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Biology版 - network modularity
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话题: modularity话题: network话题: graph话题: protein
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R******d
发帖数: 1436
1
看了一点protein-protein interaction network方面的文章。好像目前的模型基本上
是neutral model,倾向modularity是duplication所致。
有没有报道说functionality可以促成network modularity的实现?
modularity本来也有功能的意味,完全抛开功能不是太对吧?
R******d
发帖数: 1436
2
自己顶一下。
那哪位有关于 detailed analysis of duplication on modularity 的参考文献?
l*h
发帖数: 4124
3
These are basic concepts in graph theories. Are you working on random graph
models or scale-free models?

【在 R******d 的大作中提到】
: 看了一点protein-protein interaction network方面的文章。好像目前的模型基本上
: 是neutral model,倾向modularity是duplication所致。
: 有没有报道说functionality可以促成network modularity的实现?
: modularity本来也有功能的意味,完全抛开功能不是太对吧?

R******d
发帖数: 1436
4
scale-free + small world
现在想知道modularity形成的机理

graph

【在 l*h 的大作中提到】
: These are basic concepts in graph theories. Are you working on random graph
: models or scale-free models?

l*h
发帖数: 4124
5
Albert-László Barabási is the guy in the field whose work you want to
read.

【在 R******d 的大作中提到】
: scale-free + small world
: 现在想知道modularity形成的机理
:
: graph

R******d
发帖数: 1436
6
多谢。我读了一下大牛的文章。
duplication致modularity形成的部分,AB也是引用他人的文章。
似乎没有homomeric duplication或interaction rewiring,就不可能得到modularity
。仅仅duplication部分是不够的。
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吐个槽Question about Protein Oligomerization
Look for protein complexes请教确定interacting proteins的方法
求南加州生物信息工作机会求教关于学习structure biology 和 protein-protein interaction, 多谢各位老师了
关于计算protein protein interaction的流程碰上了这末个of....of.....of.....的句子咋整嗫?
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Re: 请问用什么方法证明蛋白与蛋白的直接作用?prePPI protein protein interaction prediction
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