h*****g
发帖数: 42 | 1 目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
candiate genes。
可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？ |
n******7
发帖数: 12463 | 2 感觉这类似统计的test，宁可错杀一千，不能放过一个（False positive） |
e*****t
发帖数: 642 | 3 that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
bright future even error rate is still high so far. |
A******y
发帖数: 2041 | 4 Yet, the current high through put sequencing is based on hybirdization...btw
, two are completely different things.
【在 e*****t 的大作中提到】
: that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
: noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
: bright future even error rate is still high so far.
|
o********r
发帖数: 775 | 5 We are never tagged by false negatives.某生统中牛面试时对俺说的话 |
h*****g
发帖数: 42 | 6 目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
candiate genes。
可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？ |
n******7
发帖数: 12463 | 7 感觉这类似统计的test，宁可错杀一千，不能放过一个（False positive） |
e*****t
发帖数: 642 | 8 that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
bright future even error rate is still high so far. |
A******y
发帖数: 2041 | 9 Yet, the current high through put sequencing is based on hybirdization...btw
, two are completely different things.
【在 e*****t 的大作中提到】
: that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
: noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
: bright future even error rate is still high so far.
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o********r
发帖数: 775 | 10 We are never tagged by false negatives.某生统中牛面试时对俺说的话 |
l**********1
发帖数: 5204 | 11 Just up once
from almost bioinformatics Niu-Ren were on upper floors.
plus:
//www.biodiscovery.com/software/imagene/
//myweb.ncku.edu.tw/~wjcnmr/Software.HTM#C
positive
【在 h*****g 的大作中提到】
: 目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
: candiate genes。
: 可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
: 的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
: microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
: 有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
: microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
: 网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
: 的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？
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N******n
发帖数: 3003 | 12 ROC
positive
【在 h*****g 的大作中提到】
: 目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
: candiate genes。
: 可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
: 的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
: microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
: 有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
: microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
: 网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
: 的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？
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