h*****g 发帖数: 42 | 1 目前的microarry studies更关注false positives,是因为通常统计分析能提供大量的
candiate genes。
可还有另外一种情况,统计分析(比如ttest+FDR control)无法得到任何基因或很少
的基因,这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
microarray整成false negative呢?是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
有关系?拍脑袋想想,低表达的true positive很可能成为false negative,因为在
microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢?
网上搜了一圈,很少有专门讨论microarray false negative的,至于和true positive
的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见? |
n******7 发帖数: 12463 | 2 感觉这类似统计的test,宁可错杀一千,不能放过一个(False positive) |
e*****t 发帖数: 642 | 3 that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
bright future even error rate is still high so far. |
A******y 发帖数: 2041 | 4 Yet, the current high through put sequencing is based on hybirdization...btw
, two are completely different things.
【在 e*****t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/ : noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have : bright future even error rate is still high so far.
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o********r 发帖数: 775 | 5 We are never tagged by false negatives.某生统中牛面试时对俺说的话 |
h*****g 发帖数: 42 | 6 目前的microarry studies更关注false positives,是因为通常统计分析能提供大量的
candiate genes。
可还有另外一种情况,统计分析(比如ttest+FDR control)无法得到任何基因或很少
的基因,这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
microarray整成false negative呢?是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
有关系?拍脑袋想想,低表达的true positive很可能成为false negative,因为在
microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢?
网上搜了一圈,很少有专门讨论microarray false negative的,至于和true positive
的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见? |
n******7 发帖数: 12463 | 7 感觉这类似统计的test,宁可错杀一千,不能放过一个(False positive) |
e*****t 发帖数: 642 | 8 that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
bright future even error rate is still high so far. |
A******y 发帖数: 2041 | 9 Yet, the current high through put sequencing is based on hybirdization...btw
, two are completely different things.
【在 e*****t 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/ : noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have : bright future even error rate is still high so far.
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o********r 发帖数: 775 | 10 We are never tagged by false negatives.某生统中牛面试时对俺说的话 |
l**********1 发帖数: 5204 | 11 Just up once
from almost bioinformatics Niu-Ren were on upper floors.
plus:
//www.biodiscovery.com/software/imagene/
//myweb.ncku.edu.tw/~wjcnmr/Software.HTM#C
positive
【在 h*****g 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 目前的microarry studies更关注false positives,是因为通常统计分析能提供大量的 : candiate genes。 : 可还有另外一种情况,统计分析(比如ttest+FDR control)无法得到任何基因或很少 : 的基因,这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被 : microarray整成false negative呢?是否和这个true positive的在细胞内的表达水平 : 有关系?拍脑袋想想,低表达的true positive很可能成为false negative,因为在 : microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢? : 网上搜了一圈,很少有专门讨论microarray false negative的,至于和true positive : 的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见?
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N******n 发帖数: 3003 | 12 ROC
positive
【在 h*****g 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 目前的microarry studies更关注false positives,是因为通常统计分析能提供大量的 : candiate genes。 : 可还有另外一种情况,统计分析(比如ttest+FDR control)无法得到任何基因或很少 : 的基因,这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被 : microarray整成false negative呢?是否和这个true positive的在细胞内的表达水平 : 有关系?拍脑袋想想,低表达的true positive很可能成为false negative,因为在 : microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢? : 网上搜了一圈,很少有专门讨论microarray false negative的,至于和true positive : 的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见?
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