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Biology版 - blastall 2.2.25的一个bug
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C*********m
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不知道版上各位有没有碰到过:
blastall -p blastp -d wwpdb -e 0.01 -F F -m 8 -i a.fasta | awk '$3 > 90'
wwpdb 是pdb 里所有蛋白序列,ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/derived_data/pdb_
seqres.txt,a.fasta 是 NP_113671.3 序列 (862 a.a),blast 2.2.15给出8个结果,
blast2.2.25只给出 7个,缺失的那个2p4r_T 只有25 a.a, 好像是 -F F 在 2.2.25版
本里不起作用.
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blast
Re: 谁知道有什么好的序列分析软件?
My understanding of Bioinformatics
Re: 什么软件可以做amino acid sequence alignment?
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