问一个关于cDNA的问题。 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 问一个关于cDNA的问题。

相关主题
● 请教如何找一个基因在不同物种的cDNA，然后做sequence alignment	● 基因序列和氨基酸序列的对应
● Short sequence match in a long sequence - help needed	● Anybody familiar with genome assembly software?
● 请教：如何提高Blast result #?	● 反转录酶引起的 RNA sequence 假阳性
● Re: Did I get correct cDNA clone?	● 白痴问题怎么blast人的基因
● Re: Sequence	● 验证sgRNA用什么样的细胞系合适
● Can anyone make comments on RNA sequence?	● primer 设计请教
● 请问大家都是怎么生产抗体的？(from scratch)	● Help please: to compare protein function
● 问个sequencing的初级问题	● qPCR with genomic DNA background

相关话题的讨论汇总
话题: cdna话题: human话题: blast话题: sequence话题: 问题

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I***W 发帖数: 218	1 如果一个human的cDNA sequence不能够在human genomic sequence上找到相应的位置，说明什么？我感兴趣的一个cDNA sequence，是从human的特定组织cDNA library sequencing得到的，但是当我Blast这个cDNA找不到任何match的序列（对，是任何，包括human和其他）。所以觉得很奇怪，是blast的问题，还是根本就是contanmination或者是Chimera gene?
I***W 发帖数: 218	2 自己顶一下！
s******y 发帖数: 28562	3 大部分情况下，是blast 选项的问题。极少情况下，可能是病毒感染的DNA 【在 I***W 的大作中提到】 : 如果一个human的cDNA sequence不能够在human genomic sequence上找到相应的位置， : 说明什么？ : 我感兴趣的一个cDNA sequence，是从human的特定组织cDNA library sequencing得到 : 的，但是当我Blast这个cDNA找不到任何match的序列（对，是任何，包括human和其他 : ）。所以觉得很奇怪，是blast的问题，还是根本就是contanmination或者是Chimera : gene?
I***W 发帖数: 218	4 主要是觉得这个cDNA不应该在这种组织里出现，所以才怀疑是不是污染了其他的东东。我在调整一下Blast的参数试一下。 Thanks a lot! 【在 s******y 的大作中提到】 : 大部分情况下，是blast 选项的问题。 : 极少情况下，可能是病毒感染的DNA

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相关主题
● qPCR with genomic DNA background	● Re: Sequence
● 请教一个dna sequence的alignment得问题	● Can anyone make comments on RNA sequence?
● 怎么blast deep sequencing结果fastaq file中有没有一段特殊序列？	● 请问大家都是怎么生产抗体的？(from scratch)
● 请问有什么做PHI-BLAST的program or software?	● 问个sequencing的初级问题
● 请教如何找一个基因在不同物种的cDNA，然后做sequence alignment	● 基因序列和氨基酸序列的对应
● Short sequence match in a long sequence - help needed	● Anybody familiar with genome assembly software?
● 请教：如何提高Blast result #?	● 反转录酶引起的 RNA sequence 假阳性
● Re: Did I get correct cDNA clone?	● 白痴问题怎么blast人的基因

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