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Biology版 - 【讨论】目前的分子生物学研究方法的瓶颈
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相关话题的讨论汇总
话题: 研究话题: 瓶颈话题: 网络话题: screening话题: 设计
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1 (共1页)
D****n
发帖数: 14
1
RT,目前的研究基本上还是集中研究“一种蛋白一种功能”,然后在通过不断增加的后
续研究来叠加到之前的研究结果上交织成一种网络。但是,这种做法虽然方便研究单个
基因的功能,然而缺陷也很明显,就是这个网络随着参与者的增加,复杂度成几何数量
的倍增,以至于这个网络最终产生的结果或发生的效应难以进行简单的解释,似乎到达
了瓶颈。
个人做个不恰当的类比:这类似于治病,西医和中医的区别,西医就是一种药对应一种
疾病;而中医针对于结果进行辨证分析病因,然后用多味要来进行综合调理,就类似于
这种复杂网络,但却无法细究具体的网络途径,类似黑箱)
小弟才疏学浅,无法想象这个问题继续发展下去会是一个什么样子,请教大家的看法,
感谢指点!
x*******6
发帖数: 262
2
所以很多人都退坑了
D****n
发帖数: 14
3

怎么说?是遇到瓶颈了么?
其实研究员们还是可以按这种套路继续出牌的,只是对整个field的贡献会越来越弱小
。这可能也是一个领域热了一段时间之后就冷却的原因之一,即虽然零星研究不断增加
,但整个field的脉络却并不能随之越发清楚,只能复杂化和碎片化

【在 x*******6 的大作中提到】
: 所以很多人都退坑了
b******s
发帖数: 1089
4
你要是在论坛上看人指点江山,肯定觉得这里是瓶颈那里是缺陷。
要是自己多去pubmed里搜一下,稍微研究一下会发现其实每个可能的方向都有人在努力
,也都有很多进展。很多大牛现在也都不满足一个蛋白一个蛋白的做了。至少我这个方
向的大牛好几年前就转而开始系统性研究这个发育过程。

【在 D****n 的大作中提到】
:
: 怎么说?是遇到瓶颈了么?
: 其实研究员们还是可以按这种套路继续出牌的,只是对整个field的贡献会越来越弱小
: 。这可能也是一个领域热了一段时间之后就冷却的原因之一,即虽然零星研究不断增加
: ,但整个field的脉络却并不能随之越发清楚,只能复杂化和碎片化

D****n
发帖数: 14
5

恩,这位兄弟说得很好,所以我说自己才疏学浅,很多东西还需要了解学习,这也是我
发帖向你们请教的原因。
能稍微详细谈谈您的方向上的大牛么?

【在 b******s 的大作中提到】
: 你要是在论坛上看人指点江山,肯定觉得这里是瓶颈那里是缺陷。
: 要是自己多去pubmed里搜一下,稍微研究一下会发现其实每个可能的方向都有人在努力
: ,也都有很多进展。很多大牛现在也都不满足一个蛋白一个蛋白的做了。至少我这个方
: 向的大牛好几年前就转而开始系统性研究这个发育过程。

w********r
发帖数: 1431
6
还好吧,
我感觉现在随着各种high throughput screening技术的发展,
研究参与调控某个过程的重要分子,
或者某个分子参与调控某个过程的机理/靶点,只要screening设计的好,
一轮筛选做完,常常感觉可以做的东西都被一网打尽了...
k******0
发帖数: 1073
7
一个一个零件都不会了解工作原理和用途,如何设计一个机器?
中医就搞得跟玄学一样的。
D****n
发帖数: 14
8
“一网打尽”说得稍微过了些吧,screen在实验设计上就有针对性的,所以得到的结果
也是有针对性的。就是用已知的内容去探寻未知的内容,而非用未知去探寻未知,不知
说得妥不妥,望拍砖~

【在 w********r 的大作中提到】
: 还好吧,
: 我感觉现在随着各种high throughput screening技术的发展,
: 研究参与调控某个过程的重要分子,
: 或者某个分子参与调控某个过程的机理/靶点,只要screening设计的好,
: 一轮筛选做完,常常感觉可以做的东西都被一网打尽了...

u**********d
发帖数: 573
9
请展开说说,谢谢!

【在 b******s 的大作中提到】
: 你要是在论坛上看人指点江山,肯定觉得这里是瓶颈那里是缺陷。
: 要是自己多去pubmed里搜一下,稍微研究一下会发现其实每个可能的方向都有人在努力
: ,也都有很多进展。很多大牛现在也都不满足一个蛋白一个蛋白的做了。至少我这个方
: 向的大牛好几年前就转而开始系统性研究这个发育过程。

u**********d
发帖数: 573
10
中医我不好评价。
不过要设计一个机器,它能工作是衡量 的标准,是否一个个元件都了解则不是。

【在 k******0 的大作中提到】
: 一个一个零件都不会了解工作原理和用途,如何设计一个机器?
: 中医就搞得跟玄学一样的。

w***7
发帖数: 463
11
you will get nothing.
screening can not be 设计的好.

【在 w********r 的大作中提到】
: 还好吧,
: 我感觉现在随着各种high throughput screening技术的发展,
: 研究参与调控某个过程的重要分子,
: 或者某个分子参与调控某个过程的机理/靶点,只要screening设计的好,
: 一轮筛选做完,常常感觉可以做的东西都被一网打尽了...

l**********1
发帖数: 5204
12
Not exactly
Zhuang X-W human whole Brain Mapping project doesn’t known every neuron which is also works.
from it belongs to QuasiChaos system
please refer
One 1980 Book:
by Maturana, H. R., & Varela, F. J.
"Autopoiesis and cognition: The realization of the living.” (1980)
Holland: Kluwer Academic Publishers.
link:
//topologicalmedialab.net/xinwei/classes/readings/Maturana/autopoesis_and_
cognition.pdf
and Dr. Nathaniel Virgo
his 2011 PhD dissertation:
"Thermodynamics and the Structure of Living Systems.”
full text link within below link:
//headcube.vootrunner.com/
Top right one Icon just click it.
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0
[ 10 ]
发信人: unfieldified (未场化的蛮), 信区: Biology
标 题: Re: 【讨论】目前的分子生物学研究方法的瓶颈
发信站: BBS 未名空间站 (Fri May 25 14:16:33 2012, 美东)
中医我不好评价。
不过要设计一个机器,它能工作是衡量 的标准,是否一个个元件都了解则不是。

【在 k******0 的大作中提到】
: 一个一个零件都不会了解工作原理和用途,如何设计一个机器?
: 中医就搞得跟玄学一样的。

y**********n
发帖数: 478
13
所以就有systems biology了嘛,都十年了
不过一个领域的发展需要一段时间才能对其他领域产生革命性的影响

【在 D****n 的大作中提到】
: RT,目前的研究基本上还是集中研究“一种蛋白一种功能”,然后在通过不断增加的后
: 续研究来叠加到之前的研究结果上交织成一种网络。但是,这种做法虽然方便研究单个
: 基因的功能,然而缺陷也很明显,就是这个网络随着参与者的增加,复杂度成几何数量
: 的倍增,以至于这个网络最终产生的结果或发生的效应难以进行简单的解释,似乎到达
: 了瓶颈。
: 个人做个不恰当的类比:这类似于治病,西医和中医的区别,西医就是一种药对应一种
: 疾病;而中医针对于结果进行辨证分析病因,然后用多味要来进行综合调理,就类似于
: 这种复杂网络,但却无法细究具体的网络途径,类似黑箱)
: 小弟才疏学浅,无法想象这个问题继续发展下去会是一个什么样子,请教大家的看法,
: 感谢指点!

b****r
发帖数: 17995
14
那是人家文章自己这么吹,你自己真正做的就知道,其实漏的不知道有多少
然后漏掉的一个又和n个相互作用,n个又和n^n个相互作用。。
自己想想吧,还有多少东西没搞清楚。神经科学也是类似的,1000亿个神经细胞,每个
都可以和几十上百个神经细胞发生突触关系,然后每个又和几十上百个发生关系。。。
而且这种突触关系每时每刻可能都是在动态变化的,想想那是多么大的排列组合方式!
所以说,生命这玩意实在太复杂了,这才是真正的瓶颈
不过我老还是很乐观的,我觉得很多根本的生命问题在20-30年内都会有答案的。就好
象那个寓言故事,一个棋盘里,第一格放一粒谷子,过几十轮后全国的谷子也远远不够
了。 人类技术能力和知识水平的发展速度太可怕了,很多东西都在若干年来和接下来
若干年内仍然会以接近摩尔定理甚至超摩尔速度发展,比如电脑计算速度,信息存储能
力,信息节点数量,这些都可以放在生物学上。更直接的还有测序能力,整合患者人数
做临床实验的能力
不过传统的生物知识和技能是远远不够的,做生物的如果只满足于掌握这些技能而不去
学习上面这些新知识,生物科学和生物产业再发展,也分不到什么甜头的。在巨量新信
息和不完全已知规律的情况下学习,整合,和归纳的能力会越来越重要,演绎的能力则
含金量不会有太多变化

【在 w********r 的大作中提到】
: 还好吧,
: 我感觉现在随着各种high throughput screening技术的发展,
: 研究参与调控某个过程的重要分子,
: 或者某个分子参与调控某个过程的机理/靶点,只要screening设计的好,
: 一轮筛选做完,常常感觉可以做的东西都被一网打尽了...

1 (共1页)
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