z***q
发帖数: 81 | 1 问个菜鸟问题：好多paper上都有protein multiple sequence alignment的图。俺想知
道用什么软件做这样的图比较方便，有经验的同学能给俺推荐一个吗？非常感谢！ |
g****h
发帖数: 771 | |
j*p
发帖数: 411 | 3 blast should also work, I guess |
l**********1
发帖数: 5204 | 4 LZ
here you go
Cluster
对微阵列和基因芯片数据进行多种聚类分析的软件。
Treeview
GeneCluster
对微阵列和基因芯片数据进行多种聚类分析，特别是SOM（Self-Organize Mapping）分
析的软件。
SAM
对微阵列和基因芯片数据进行显著性分析的软件。
url web link:
//bioinformatics.cau.edu.cn/software.htm
【在 z***q 的大作中提到】
: 问个菜鸟问题：好多paper上都有protein multiple sequence alignment的图。俺想知
: 道用什么软件做这样的图比较方便，有经验的同学能给俺推荐一个吗？非常感谢！
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z***q
发帖数: 81 | 5 谢谢上面几位的回复！blast, clustalw这些软件我倒是会用。俺的问题是，alignment
做好了以后，怎么样作成图放到paper上去。大家都是一行一行的copy-paste到MS Word
上吗？另外如果某些residue需要highlight成不同颜色，在word上搞也挺繁琐的。所以
我想知道什么软件可以比较方便做这些annotation，然后整个图贴到paper中。。。
【在 z***q 的大作中提到】
: 问个菜鸟问题：好多paper上都有protein multiple sequence alignment的图。俺想知
: 道用什么软件做这样的图比较方便，有经验的同学能给俺推荐一个吗？非常感谢！
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f******g
发帖数: 1003 | 6 clustalw can show alignment result in multiple color, then you can print
screen and do it the photoshop |
G***y
发帖数: 1082 | 7 BioEdit
alignment
Word
【在 z***q 的大作中提到】
: 谢谢上面几位的回复！blast, clustalw这些软件我倒是会用。俺的问题是，alignment
: 做好了以后，怎么样作成图放到paper上去。大家都是一行一行的copy-paste到MS Word
: 上吗？另外如果某些residue需要highlight成不同颜色，在word上搞也挺繁琐的。所以
: 我想知道什么软件可以比较方便做这些annotation，然后整个图贴到paper中。。。
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l**********1
发帖数: 5204 | 8 first print screen then save as TIFF format file
then with
Adobe Illustrator CS 5.0
open it then DIY
alignment
Word
【在 z***q 的大作中提到】
: 谢谢上面几位的回复！blast, clustalw这些软件我倒是会用。俺的问题是，alignment
: 做好了以后，怎么样作成图放到paper上去。大家都是一行一行的copy-paste到MS Word
: 上吗？另外如果某些residue需要highlight成不同颜色，在word上搞也挺繁琐的。所以
: 我想知道什么软件可以比较方便做这些annotation，然后整个图贴到paper中。。。
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y****i
发帖数: 4109 | 9 GeneDoc
alignment
Word
【在 z***q 的大作中提到】
: 谢谢上面几位的回复！blast, clustalw这些软件我倒是会用。俺的问题是，alignment
: 做好了以后，怎么样作成图放到paper上去。大家都是一行一行的copy-paste到MS Word
: 上吗？另外如果某些residue需要highlight成不同颜色，在word上搞也挺繁琐的。所以
: 我想知道什么软件可以比较方便做这些annotation，然后整个图贴到paper中。。。
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