z*******6
发帖数: 679 | 1 我貌似发现我的老鼠有这个莫名其妙的phenotype：triglyceride比B6高一倍 （我只分
别做了两只老鼠，但是组内都基本没差别）... 起码大家都没有expect到，我想一边把
data弄solid，一边看看关于triglyceride代谢相关的基因，做做QPCR什么的...
正打算开始看，就过来请教一下大家... |
t*******e
发帖数: 119 | 2 目前大家关注的最多的和TAG有关的基因是DGAT，另外还有PDAT也较相关。此外还有和
lipid droplet形成有关的基因也比较受关注。 |
s******a
发帖数: 252 | 3 The current metabolic pathways are good but far from complete. Try your luck
to see if there's a genetic factor in related pathways. |
g****0
发帖数: 425 | 4 看看心 肝 脂肪神马的有变化木有。
两只太少，tg组内变化很大。
【在 z*******6 的大作中提到】
: 我貌似发现我的老鼠有这个莫名其妙的phenotype：triglyceride比B6高一倍 （我只分
: 别做了两只老鼠，但是组内都基本没差别）... 起码大家都没有expect到，我想一边把
: data弄solid，一边看看关于triglyceride代谢相关的基因，做做QPCR什么的...
: 正打算开始看，就过来请教一下大家...
|
z*******6
发帖数: 679 | 5 心肝貌似木有比较明显的变化... 脂肪，我正在学习怎么看，不过肯定没有明显的变化
...
我打算给老鼠喂obesity-inducing的diet试试看有没有肥胖的phenotype...
嗯，下周再多做几个，看看...
【在 g****0 的大作中提到】
: 看看心 肝 脂肪神马的有变化木有。
: 两只太少，tg组内变化很大。
|
z*******6
发帖数: 679 | 6 嗯，刚才看到有Lipin1还有其相关的PGC-1a什么的，看到DGAT了，下下周准备看看...
不过还不确定从哪搞RNA，目前打算是腹腔里面的visceral fat（还不确定这玩意到底
在哪）...
【在 t*******e 的大作中提到】
: 目前大家关注的最多的和TAG有关的基因是DGAT，另外还有PDAT也较相关。此外还有和
: lipid droplet形成有关的基因也比较受关注。
|
z*******6
发帖数: 679 | 7 Thanks! 我也打算就挑几个试试...
luck
【在 s******a 的大作中提到】
: The current metabolic pathways are good but far from complete. Try your luck
: to see if there's a genetic factor in related pathways.
|
y**u
发帖数: 7459 | 8 一般用white adipose tissue, 腹腔下部两大片
【在 z*******6 的大作中提到】
: 嗯，刚才看到有Lipin1还有其相关的PGC-1a什么的，看到DGAT了，下下周准备看看...
: 不过还不确定从哪搞RNA，目前打算是腹腔里面的visceral fat（还不确定这玩意到底
: 在哪）...
|
z*******6
发帖数: 679 | 9 谢啦！
【在 y**u 的大作中提到】
: 一般用white adipose tissue, 腹腔下部两大片
|
D*a
发帖数: 6830 | |
|
|
n***w
发帖数: 2405 | 11 问问周围肯定有知道怎么取的， 不知道的我可以示范给你
【在 z*******6 的大作中提到】
: 谢啦！
|
z*******6
发帖数: 679 | 12 我在做别的，然后就顺带着测了一下这几个老鼠，结果还是高... 所以下周打算多测几
个，然后加上female... 看看能不能再看到差别...
因为有其他的结果预感到这个应该是真的...
【在 D*a 的大作中提到】
: 两只老鼠？
|
z*******6
发帖数: 679 | 13 你咋还搞fat呢？...
【在 n***w 的大作中提到】
: 问问周围肯定有知道怎么取的， 不知道的我可以示范给你
|
D*a
发帖数: 6830 | 14 几个老鼠还是两个老鼠？这个差别可大了
如果是血液取值，我们都是10只以上
老鼠的fat 主要的分分Subcutaneous
包括
-inguinal/dorsolumbar
-interscapular
和 Visceral
-gonadal
-mesenteric
-perirenal
另外还有心脏附近和胃附近两小块，我做的只是称重或者IHC，这两小块我不要。
我不知道三个地方的visceral有没有什么区别。
如果你要全取，那么先把皮扒了，不要剪开腹腔，搞 inguinal/dorsolumbar和
interscapular，一坨在上面一坨在下面，然后剪开腹腔找另外三块。
如果你只要腹腔内的，就直接剪开搞就可以了。但是如果你取gonadal不要死拽，死拽
就把inguinal的一部分通过最下面的小口拽进去了（我解剖的时候是这么觉得）
【在 z*******6 的大作中提到】
: 我在做别的，然后就顺带着测了一下这几个老鼠，结果还是高... 所以下周打算多测几
: 个，然后加上female... 看看能不能再看到差别...
: 因为有其他的结果预感到这个应该是真的...
|
z********8
发帖数: 818 | 15
赞！
一般我们只取 inguinal and gonadal， and brown fat
【在 D*a 的大作中提到】
: 几个老鼠还是两个老鼠？这个差别可大了
: 如果是血液取值，我们都是10只以上
: 老鼠的fat 主要的分分Subcutaneous
: 包括
: -inguinal/dorsolumbar
: -interscapular
: 和 Visceral
: -gonadal
: -mesenteric
: -perirenal
|
n***w
发帖数: 2405 | 16 做Conditional KO, 取了不少组织。
【在 z*******6 的大作中提到】
: 你咋还搞fat呢？...
|
l**********1
发帖数: 5204 | 17 Mark.
【在 D*a 的大作中提到】
: 几个老鼠还是两个老鼠？这个差别可大了
: 如果是血液取值，我们都是10只以上
: 老鼠的fat 主要的分分Subcutaneous
: 包括
: -inguinal/dorsolumbar
: -interscapular
: 和 Visceral
: -gonadal
: -mesenteric
: -perirenal
|
z*******6
发帖数: 679 | 18 终于有专家出来解释了，谢啦！！！
目前只有两只的数据，确实还要多做一些... 只不过我另一个类似的老鼠我做了10多只
，都有这个phenotype，所以我猜这个strain也可能有... 总之，当然要多做，现在只
想提前上来找大家请教一下关于triglyceride代谢的东西，因为我们完全跟这个不沾边
...
【在 D*a 的大作中提到】
: 几个老鼠还是两个老鼠？这个差别可大了
: 如果是血液取值，我们都是10只以上
: 老鼠的fat 主要的分分Subcutaneous
: 包括
: -inguinal/dorsolumbar
: -interscapular
: 和 Visceral
: -gonadal
: -mesenteric
: -perirenal
|
g****0
发帖数: 425 | 19 赞一个。
你怎么取mesenteric？ 我都是从肠子上扒下来。
另外，取fat一定要小心其它组织污染。宁缺勿难。
【在 D*a 的大作中提到】
: 几个老鼠还是两个老鼠？这个差别可大了
: 如果是血液取值，我们都是10只以上
: 老鼠的fat 主要的分分Subcutaneous
: 包括
: -inguinal/dorsolumbar
: -interscapular
: 和 Visceral
: -gonadal
: -mesenteric
: -perirenal
|
D*a
发帖数: 6830 | 20 你们细胞培养要求应该高，我就是称称多沉，再深入点切片染色（我还没做过），因为
我们基因跟fat有点关系但是对我课题不是很主要，所以做得不深入。
肠子我是先胃和肛门两头剪下来，然后镊子拽住一头慢慢拉长，fat就在一起了。你是
怎么取的？
不过说实话我做完了一年以后才知道原来胰腺也是粘乎乎一团，就是颜色黄一些，也不
知道当年mesenteric fat有没有混着一部分胰腺。不过我也不养细胞，就无所谓了。
【在 g****0 的大作中提到】
: 赞一个。
: 你怎么取mesenteric？ 我都是从肠子上扒下来。
: 另外，取fat一定要小心其它组织污染。宁缺勿难。
|
|
|
g****0
发帖数: 425 | 21 差不多。
“不过说实话我做完了一年以后才知道原来胰腺也是粘乎乎一团，就是颜色黄一些，也
不知道当年mesenteric fat有没有混着一部分胰腺。不过我也不养细胞，就无所谓了。
”你说的这个也是我说的要非常小心的原因之一。还有肾脏上的肾上腺也很象fat，卵
巢也像，附睾管也很容易混等等。
【在 D*a 的大作中提到】
: 你们细胞培养要求应该高，我就是称称多沉，再深入点切片染色（我还没做过），因为
: 我们基因跟fat有点关系但是对我课题不是很主要，所以做得不深入。
: 肠子我是先胃和肛门两头剪下来，然后镊子拽住一头慢慢拉长，fat就在一起了。你是
: 怎么取的？
: 不过说实话我做完了一年以后才知道原来胰腺也是粘乎乎一团，就是颜色黄一些，也不
: 知道当年mesenteric fat有没有混着一部分胰腺。不过我也不养细胞，就无所谓了。
|
f***x
发帖数: 1524 | 22 check TG in liver ,serum and adipose tissues.
check free fatty acids and cholesterol also.
if abnormal,check genes involved in lipogenesis and lipolysis. |
b****r
发帖数: 17995 | 23 还是先严格一点，用一样年龄性别background同食物的litter mate side by side测一
下吧。光是background可能影响就很大 |
z*****n
发帖数: 444 | 24 这个我非常同意。先确定你确实看到了现象再说。另外性别也会影响血脂。建议最好找
一个Local的懂行的实验室，远距离也说不清楚。
【在 b****r 的大作中提到】
: 还是先严格一点，用一样年龄性别background同食物的litter mate side by side测一
: 下吧。光是background可能影响就很大
|
z*******6
发帖数: 679 | 25 嗯，这些我都想到了，同年龄同性别同背景... 这个我在做atherosclerosis的时候基
本有感觉...
【在 z*****n 的大作中提到】
: 这个我非常同意。先确定你确实看到了现象再说。另外性别也会影响血脂。建议最好找
: 一个Local的懂行的实验室，远距离也说不清楚。
|
z*******6
发帖数: 679 | 26 Thank you. This is also the way I'm planning... Just ask you guys about the
genes involved in lipogenesis and lipolysis. Already got some good
candidates from some of you and literatures...
【在 f***x 的大作中提到】
: check TG in liver ,serum and adipose tissues.
: check free fatty acids and cholesterol also.
: if abnormal,check genes involved in lipogenesis and lipolysis.
|
