T*********l
发帖数: 298 | 1 这个微生物的基因组早已完成。是不是有个特定的网站，比如NCBI（这个我找过了，没
找到地方下载，汗一个）？人的genome annotation好找，可微生物的好像不行。
哪位大哥大姐愿意指点一二？蒸10个大包子请教。谢谢了。
我想下的是Prochlorococcus MED4。 |
p********e
发帖数: 16048 | 2 rere
【在 T*********l 的大作中提到】
: 这个微生物的基因组早已完成。是不是有个特定的网站，比如NCBI（这个我找过了，没
: 找到地方下载，汗一个）？人的genome annotation好找，可微生物的好像不行。
: 哪位大哥大姐愿意指点一二？蒸10个大包子请教。谢谢了。
: 我想下的是Prochlorococcus MED4。
|
j****x
发帖数: 1704 | |
T*********l
发帖数: 298 | 4 恩这个是够了，不过我想要的是.csv,.txt版本的，怪我没说清楚。
【在 j****x 的大作中提到】
: 你需要什么程度的annotation？这个还不够？
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/BX548174
|
j****x
发帖数: 1704 | 5 自己转化一下格式不就行了，一点也不复杂啊
【在 T*********l 的大作中提到】
: 恩这个是够了，不过我想要的是.csv,.txt版本的，怪我没说清楚。
|
T*********l
发帖数: 298 | 6 谢谢热心的大姐姐。5个大包子送上！
其实我要的是这样的file:
MicrobesOnline ID Locus tag Alternative locus tag gi strand
begin end name desc COG EC num evidence
VIMSS565331 PMED4_00001 PMM0001 33860561 + 174 1331
dnaN DNA polymerase III, beta chain COG592 2.7.7.7 GenBank/
CRITICA/GLIM2/GLIM3
VIMSS565332 PMED4_00011 PMM0002 33860562 + 1333 2040 NA
conserved hypothetical protein NA NA GenBank/CRITICA/GLIM2/
GLIM3
【在 j****x 的大作中提到】
: 自己转化一下格式不就行了，一点也不复杂啊
|
j****x
发帖数: 1704 | 7 我勒个去，一口鲜血喷出来。。。包子不要了，我再还你十个，你能告诉我，我哪一点
点像知心大姐了吗？
NA
【在 T*********l 的大作中提到】
: 谢谢热心的大姐姐。5个大包子送上！
: 其实我要的是这样的file:
: MicrobesOnline ID Locus tag Alternative locus tag gi strand
: begin end name desc COG EC num evidence
: VIMSS565331 PMED4_00001 PMM0001 33860561 + 174 1331
: dnaN DNA polymerase III, beta chain COG592 2.7.7.7 GenBank/
: CRITICA/GLIM2/GLIM3
: VIMSS565332 PMED4_00011 PMM0002 33860562 + 1333 2040 NA
: conserved hypothetical protein NA NA GenBank/CRITICA/GLIM2/
: GLIM3
|
u**********d
发帖数: 573 | 8 呵呵，谁让你头像那么猛
【在 j****x 的大作中提到】
: 我勒个去，一口鲜血喷出来。。。包子不要了，我再还你十个，你能告诉我，我哪一点
: 点像知心大姐了吗？
:
: NA
|
