t**l
发帖数: 109 | 1 不知道我的思路对不对，欢迎指点。
bioinfo推断出domain, 感觉是个transcription factor.
首先要找到这个transcription factor 的promoter,用CHIP-SEQ就可以。（之前可以用
GEL SHIFT确认这是一个DNA binding protein?有无必要）
但是就算CHIP-SEQ出来来结果，也只能说明这个PROTEIN是个DNA-BINDING PROTEIN，并
不能证明是一个transcription factor?
如果一个细胞endogenously 不表达这个transcription factor,然后我用一个VECTOR引
用，表达了，microarray出来发现gene expression 变化了。但是也不能只能这个是一
个transcription factor，只能说明这个protein对这些pathway有影响。
难道必须用生化的cell free system来证明？有没有什么实验能证明一个新的蛋白是
transcription factor? | H*g
发帖数: 2333 | 2 Need demonstration of nuclear localization, also need in vitro transcription
assay to demonstrate its self-activation of transcription of downstream
genes, besides of your CHIP-seq & EMSA. Any homologs/conserved domains
already demonstrated in other species? |
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