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Biology版 - 图像荧光强度积分
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话题: imagej话题: 荧光话题: 强度话题: 积分话题: 图像
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b**********3
发帖数: 165
1
弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比
较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了
两次没搞出来,请指教,谢谢
j***l
发帖数: 100
2
如果用matlab最简单的是用tiffread读出原始数据,比如一个512x512 matrix,然后
sum up 所有pixel intensity,希望有用。

【在 b**********3 的大作中提到】
: 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比
: 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了
: 两次没搞出来,请指教,谢谢

A******y
发帖数: 2041
3
Google imageJ western blot quantification...same procedure. You should use
a plate reader though to do it correctly.

【在 b**********3 的大作中提到】
: 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比
: 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了
: 两次没搞出来,请指教,谢谢

Z****9
发帖数: 738
4
不知道你说的积分值得是强度总和不?如果是的话,可以用imagej或者FIJI和容易算出
来。
可以设一个threshold,然后算就可以了。可以在set measurement 那里设置你需要算
的参数,比如强度面积等

【在 b**********3 的大作中提到】
: 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比
: 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了
: 两次没搞出来,请指教,谢谢

b**********3
发帖数: 165
5
谢谢楼上各位,今晚再试试matlab和imagej
S*********s
发帖数: 304
6
最近发现PE出的volocity很好用。
一般买荧光显微镜自带的,需要买license.后来发现他们提供free demo,除了不能输
出live image的video之外,其他功能都有。
免费注册得到unlock code后即可使用,功能挺强大。
其中就可measure 荧光强度,有各种线条,形状可选(see picture for ref.)。
http://www.perkinelmer.com/pages/020/cellularimaging/products/v

【在 b**********3 的大作中提到】
: 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比
: 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了
: 两次没搞出来,请指教,谢谢

s*****j
发帖数: 6435
7
这种基本的算强度, 面积, 形状的问题. ImageJ 比其它所有商用软件都强大.

【在 S*********s 的大作中提到】
: 最近发现PE出的volocity很好用。
: 一般买荧光显微镜自带的,需要买license.后来发现他们提供free demo,除了不能输
: 出live image的video之外,其他功能都有。
: 免费注册得到unlock code后即可使用,功能挺强大。
: 其中就可measure 荧光强度,有各种线条,形状可选(see picture for ref.)。
: http://www.perkinelmer.com/pages/020/cellularimaging/products/v

S*********s
发帖数: 304
8
我比较挫,改天试试看
可以算time course吗?

【在 s*****j 的大作中提到】
: 这种基本的算强度, 面积, 形状的问题. ImageJ 比其它所有商用软件都强大.
s*****j
发帖数: 6435
9
什么都能算. 就是得花工夫学.
你要是用 Volocity 用得舒服的话, 就接着用吧.

【在 S*********s 的大作中提到】
: 我比较挫,改天试试看
: 可以算time course吗?

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