b**********3 发帖数: 165 | 1 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比
较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了
两次没搞出来,请指教,谢谢 |
j***l 发帖数: 100 | 2 如果用matlab最简单的是用tiffread读出原始数据,比如一个512x512 matrix,然后
sum up 所有pixel intensity,希望有用。
【在 b**********3 的大作中提到】 : 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比 : 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了 : 两次没搞出来,请指教,谢谢
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A******y 发帖数: 2041 | 3 Google imageJ western blot quantification...same procedure. You should use
a plate reader though to do it correctly.
【在 b**********3 的大作中提到】 : 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比 : 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了 : 两次没搞出来,请指教,谢谢
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Z****9 发帖数: 738 | 4 不知道你说的积分值得是强度总和不?如果是的话,可以用imagej或者FIJI和容易算出
来。
可以设一个threshold,然后算就可以了。可以在set measurement 那里设置你需要算
的参数,比如强度面积等
【在 b**********3 的大作中提到】 : 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比 : 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了 : 两次没搞出来,请指教,谢谢
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b**********3 发帖数: 165 | 5 谢谢楼上各位,今晚再试试matlab和imagej |
S*********s 发帖数: 304 | 6 最近发现PE出的volocity很好用。
一般买荧光显微镜自带的,需要买license.后来发现他们提供free demo,除了不能输
出live image的video之外,其他功能都有。
免费注册得到unlock code后即可使用,功能挺强大。
其中就可measure 荧光强度,有各种线条,形状可选(see picture for ref.)。
http://www.perkinelmer.com/pages/020/cellularimaging/products/v
【在 b**********3 的大作中提到】 : 弱弱地问,想把几个个荧光图像所有像数的荧光强度积分出来,然后进行粗略的量化比 : 较,请问什么软件可以最简单地实现?基本操作能否说明一下,imageJ应该可以,试了 : 两次没搞出来,请指教,谢谢
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s*****j 发帖数: 6435 | 7 这种基本的算强度, 面积, 形状的问题. ImageJ 比其它所有商用软件都强大.
【在 S*********s 的大作中提到】 : 最近发现PE出的volocity很好用。 : 一般买荧光显微镜自带的,需要买license.后来发现他们提供free demo,除了不能输 : 出live image的video之外,其他功能都有。 : 免费注册得到unlock code后即可使用,功能挺强大。 : 其中就可measure 荧光强度,有各种线条,形状可选(see picture for ref.)。 : http://www.perkinelmer.com/pages/020/cellularimaging/products/v
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S*********s 发帖数: 304 | 8 我比较挫,改天试试看
可以算time course吗?
【在 s*****j 的大作中提到】 : 这种基本的算强度, 面积, 形状的问题. ImageJ 比其它所有商用软件都强大.
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s*****j 发帖数: 6435 | 9 什么都能算. 就是得花工夫学.
你要是用 Volocity 用得舒服的话, 就接着用吧.
【在 S*********s 的大作中提到】 : 我比较挫,改天试试看 : 可以算time course吗?
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