T*****n
发帖数: 897 | 1 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
标 题: ChIP试验做不出结果怎么办？
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
ChIP试验做不出结果怎么办？用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
conditions, 但老不出结果。怎么回事？请大家指教。谢谢！ |
a********k
发帖数: 2273 | 2 你确认有结果。。。无数发表的ChIP里面的猫腻多着呢，别人能做出来不代表你就能做
出来。
shearing
【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
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: 标 题: ChIP试验做不出结果怎么办？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
: ChIP试验做不出结果怎么办？用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事？请大家指教。谢谢！
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L****e
发帖数: 499 | 3 ChIP 有的好做很容易就做出来，有的很难，最关键的是抗体要好。我最近一个用常规
方法怎么都做不出来，后来用了一种 biotin ChIP, 就是将目的基因和一种 biotin
ligase 同时表达，让目的基因biotinated, 然后用streptavadin dynal bead 做ChIP
，这个biotin 最大的好处就是非常特异。你不妨试一试 |
C***Y
发帖数: 61 | 4 That's a good kit. Maybe your antibody is not good.
shearing
【在 T*****n 的大作中提到】
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: conditions, 但老不出结果。怎么回事？请大家指教。谢谢！
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T*****n
发帖数: 897 | 5 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
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标 题: ChIP试验做不出结果怎么办？
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
ChIP试验做不出结果怎么办？用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
conditions, 但老不出结果。怎么回事？请大家指教。谢谢！ |
a********k
发帖数: 2273 | 6 你确认有结果。。。无数发表的ChIP里面的猫腻多着呢，别人能做出来不代表你就能做
出来。
shearing
【在 T*****n 的大作中提到】
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: ChIP试验做不出结果怎么办？用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事？请大家指教。谢谢！
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L****e
发帖数: 499 | 7 ChIP 有的好做很容易就做出来，有的很难，最关键的是抗体要好。我最近一个用常规
方法怎么都做不出来，后来用了一种 biotin ChIP, 就是将目的基因和一种 biotin
ligase 同时表达，让目的基因biotinated, 然后用streptavadin dynal bead 做ChIP
，这个biotin 最大的好处就是非常特异。你不妨试一试 |
C***Y
发帖数: 61 | 8 That's a good kit. Maybe your antibody is not good.
shearing
【在 T*****n 的大作中提到】
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: 标 题: ChIP试验做不出结果怎么办？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 7 22:42:18 2012, 美东)
: ChIP试验做不出结果怎么办？用的是Active Motif的KIT。现在optimize the shearing
: conditions, 但老不出结果。怎么回事？请大家指教。谢谢！
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T*****n
发帖数: 897 | 9 我试了active motif Express kit and High Sensitivity Kit. 结果都是第一次结果
很好，然后再也重复不出来了，即使用同一ChIP DNA. 现在搞得我很郁闷。结果出来时
老板很高兴，结果不能重复，我们又都郁闷了。大家用过这两个试剂盒吗？对这两个试
剂盒有何评价？如何才能解决出现的问题？ |
t******k
发帖数: 599 | 10 做不出来，这里面多少原因啊。。ps chip一直都是自家配试剂做的 |
T*****n
发帖数: 897 | 11 这个好像不是抗体的原因，因为第一次结果出来了。是不是enriched DNA 不稳定？但
是后来又重新做ChIP,也还是出不来。
【在 t******k 的大作中提到】
: 做不出来，这里面多少原因啊。。ps chip一直都是自家配试剂做的
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k*****n
发帖数: 323 | 12 make sure your crosslinking and sonication are consistent. take Pol II as
system control.
【在 T*****n 的大作中提到】
: 这个好像不是抗体的原因，因为第一次结果出来了。是不是enriched DNA 不稳定？但
: 是后来又重新做ChIP,也还是出不来。
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