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Biology版 - 请教一个chip的问题
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话题: chip话题: shearing话题: sonication话题: enzymatic话题: histone
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t**********8
发帖数: 223
1
我想买一个enzymatic shearing的kit试试,用来替代sonication,因为我要chip的
complex太大,sonication效果很不好。但实验室另一个postdoc认为enzymatic
shearing会把dna切得太小,会miss掉很多东西,他认为这个方法只适合chromatin
modification。
很纠结,不知道是否值得一试。
s******s
发帖数: 13035
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如果你说的是fix以后用Mnase一类的,这玩意儿做histone很好用。
如果不是bind histone的factor, 确实很可能保护的太小。

【在 t**********8 的大作中提到】
: 我想买一个enzymatic shearing的kit试试,用来替代sonication,因为我要chip的
: complex太大,sonication效果很不好。但实验室另一个postdoc认为enzymatic
: shearing会把dna切得太小,会miss掉很多东西,他认为这个方法只适合chromatin
: modification。
: 很纠结,不知道是否值得一试。

t**********8
发帖数: 223
3
谢谢!我觉得我那个complex可能是作用在histone modification的。还是试试吧。

【在 s******s 的大作中提到】
: 如果你说的是fix以后用Mnase一类的,这玩意儿做histone很好用。
: 如果不是bind histone的factor, 确实很可能保护的太小。

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