b******9
发帖数: 425 | 1 做了CD31的IHC staining，想quantify staining的面积，算vessel density。请问该
用什么软件呢？ 最好是免费的。多谢多谢！ |
w*****r
发帖数: 2061 | 2 ImageJ...
【在 b******9 的大作中提到】
: 做了CD31的IHC staining，想quantify staining的面积，算vessel density。请问该
: 用什么软件呢？ 最好是免费的。多谢多谢！
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m*******d
发帖数: 247 | 3 就是它了。
【在 w*****r 的大作中提到】
: ImageJ...
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Z******5
发帖数: 435 | 4 pohotshop的魔棒很好用。
载入图片，选择魔棒工具。选择窗口，显示直方图，在直方图窗口选出详细信息。下面
就会有魔棒选择区域的像素。
还可以通过设置 羽化值、容差等提高精确度。
这里有个简单的教程 http://wenku.baidu.com/view/decce3e819e8b8f67c1cb94b.html |
b******9
发帖数: 425 | 5 看了一下ImageJ的教程，是可以测量一个区域的面积，但是好像一次只能选定一块区域
。 如果staining的图上有很多小块的positive region，应该怎么操作呢？一块一块测
不太现实，因为太多了，选完几块就晕了。有办法选multiple ROI么？
谢谢！
【在 w*****r 的大作中提到】
: ImageJ...
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b******9
发帖数: 425 | 6 这个也是同样的问题，可以同时选定好多region吗？ 多谢多谢！
【在 Z******5 的大作中提到】
: pohotshop的魔棒很好用。
: 载入图片，选择魔棒工具。选择窗口，显示直方图，在直方图窗口选出详细信息。下面
: 就会有魔棒选择区域的像素。
: 还可以通过设置 羽化值、容差等提高精确度。
: 这里有个简单的教程 http://wenku.baidu.com/view/decce3e819e8b8f67c1cb94b.html
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t*d
发帖数: 1290 | |
n***w
发帖数: 2405 | 8 。。。。选择区域的时候按control或者command，然后就可以拉。
如果你是有多种颜色或者要normalize to DAPI，你可以把选中的区域设成ROI
【在 b******9 的大作中提到】
: 看了一下ImageJ的教程，是可以测量一个区域的面积，但是好像一次只能选定一块区域
: 。 如果staining的图上有很多小块的positive region，应该怎么操作呢？一块一块测
: 不太现实，因为太多了，选完几块就晕了。有办法选multiple ROI么？
: 谢谢！
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b******9
发帖数: 425 | 9 多谢多谢！
【在 t*d 的大作中提到】
: Try CellProfiler
: There is a workshop for it
: http://www.broadinstitute.org/partnerships/education/broade/bro
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b******9
发帖数: 425 | 10 谢谢啦，以前从来没用过，现在知道了：）
【在 n***w 的大作中提到】
: 。。。。选择区域的时候按control或者command，然后就可以拉。
: 如果你是有多种颜色或者要normalize to DAPI，你可以把选中的区域设成ROI
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