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Biology版 - 求教:知道染色体的位置,如何找具体的序列?
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d**********9
发帖数: 981
1
知道我要扩增的序列位于老鼠CHR16:23890831-23896831,要如何知道它的基因序列呢
?多谢高人指导!
d**********9
发帖数: 981
2
up, no one knows?
p*******s
发帖数: 516
3
useast.ensembl.org/das/Mus_musculus.GRCm38.reference/sequence?segment=16:
23890831,23896831

【在 d**********9 的大作中提到】
: up, no one knows?
s*****3
发帖数: 20
4
My favorite tool: UCSC genome browser
Here is "how to fish":
1) go to
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway
2) paste CHR16:23890831-23896831 in "search term" and click "submit"
3) click "View" on top of the screen, select "DNA". The "fish" is almost
there; go get it!
d**********9
发帖数: 981
5
thanks a lot
Z******5
发帖数: 435
6
UCSC上,人类基因组不同版本编号不一样。
老鼠的没有注意过是否有不同版本,楼主要注意一下。

【在 s*****3 的大作中提到】
: My favorite tool: UCSC genome browser
: Here is "how to fish":
: 1) go to
: http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway
: 2) paste CHR16:23890831-23896831 in "search term" and click "submit"
: 3) click "View" on top of the screen, select "DNA". The "fish" is almost
: there; go get it!

s*****3
发帖数: 20
7
Good input. GRCm38/mm10 is the most recent version in UCSC for mouse
genome.

【在 Z******5 的大作中提到】
: UCSC上,人类基因组不同版本编号不一样。
: 老鼠的没有注意过是否有不同版本,楼主要注意一下。

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