b****r
发帖数: 17995 | 1 能出来说说吗，好不好用，上手快吗。只有一些比较基础的编程知识，能熟练使用
excel
主要是为了处理大量的excel和作图 |
K****n
发帖数: 5970 | 2 有钱人啊，我自从毕了业再也没见过能买得起马特拉博的人
我觉得学matlab特别不值，一是我没见过除了学生和老师之外的人用，二是它其实已经
算c style的programming了，又有oop，还可以system call，但是当你遇上装逼的人，
他们会说，“哦？MATLAB太简单，不算编程，会C吗？”。
我推荐直接上 numpy scipy 和 matplotlib。这样装逼的人会说，“哦？原来你也是
open source community的人啊，我也最爱用python了呢！”
这样复杂程度差不多。MATLAB主要是传说中矩阵计算牛逼，但是主要题现在凡是for
loop都要写成矩阵，而数值计算上还是调fortran库的。
【在 b****r 的大作中提到】
: 能出来说说吗，好不好用，上手快吗。只有一些比较基础的编程知识，能熟练使用
: excel
: 主要是为了处理大量的excel和作图
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e*******o
发帖数: 4654 | 3 KeeVan说的 numpy scipy 和 matplotlib，估计你自己得装半天。
如果你不是做大量的矩阵运算，用不到matlab的，
处理Excel一般的语言都行。
做图比较好用的是R的ggplot2。 |
h****e
发帖数: 138 | 4 我也推荐用python，简单易学，大爱啊。。。
关于作图和统计，numpy,scipy,matplotlib等模块即可搞定。
安装方面，scipy在我们比较老的服务器上出现过问题，别的基本没遇到过困难。
实在不想装，也可考虑集成包如enthought的free版(linux)或者pythonxy(windows)
【在 b****r 的大作中提到】
: 能出来说说吗，好不好用，上手快吗。只有一些比较基础的编程知识，能熟练使用
: excel
: 主要是为了处理大量的excel和作图
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K****n
发帖数: 5970 | 5 easy_install 啊，哈哈
我装 numpy的时候定睛一看。靠！原来也是fortran!
【在 e*******o 的大作中提到】
: KeeVan说的 numpy scipy 和 matplotlib，估计你自己得装半天。
: 如果你不是做大量的矩阵运算，用不到matlab的，
: 处理Excel一般的语言都行。
: 做图比较好用的是R的ggplot2。
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K****n
发帖数: 5970 | 6 不捣乱地说，我上学的时候有一个泰国大姐姐，她的labmate毕业了之后狠心地抛给了
她不少code，但是她嘛也不懂，于是以给我做thai food为交换，哄我写了好多matlab
处理xls的code
我当时特别震精的，一是Thai food确实好吃，二是matlab有一个叫做xlsread 的
method。
http://www.mathworks.com/help/matlab/ref/xlsread.html
只要你想得到的，早都有人做了 |
l**********1
发帖数: 5204 | 7 马特拉博 COURSERA offers student price deal (possible)
Sessions:
Sep 25th 2013(10 weeks long)
cited
>Given the computational nature of the course, access to MATLAB (www.
mathworks.com) or Octave (www.gnu.org/software/octave) is essential. Octave
is a free (or by donation) alternative to MATLAB that can also be
downloaded and installed via the web. Either software should suffice for all
the needs of the course, but MATLAB is the strongly recommended alternative.
web link:
https://www.coursera.org/course/scientificcomp
or
>
Good news: Matlab accepting Udacity enrollment for Student Pricing
http://forums.udacity.com/questions/1022597/good-news-matlab-ac
more pls go to:
http://www.mooc-list.com/tags/matlab
>
>>
【在 K****n 的大作中提到】
: 有钱人啊，我自从毕了业再也没见过能买得起马特拉博的人
: 我觉得学matlab特别不值，一是我没见过除了学生和老师之外的人用，二是它其实已经
: 算c style的programming了，又有oop，还可以system call，但是当你遇上装逼的人，
: 他们会说，“哦？MATLAB太简单，不算编程，会C吗？”。
: 我推荐直接上 numpy scipy 和 matplotlib。这样装逼的人会说，“哦？原来你也是
: open source community的人啊，我也最爱用python了呢！”
: 这样复杂程度差不多。MATLAB主要是传说中矩阵计算牛逼，但是主要题现在凡是for
: loop都要写成矩阵，而数值计算上还是调fortran库的。
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l**********1
发帖数: 5204 | 8 You sure? LZ can master R more faster than master GNUplots ?
if not, why not s/he can try below: if simple figure
cited
>
how to do GNUplots from your matlab script
web link
http://itb.biologie.hu-berlin.de/~glauser/research/GNUplot_via_
or alternatively try below if complex figure:
Figures: Matlab to Illustrator
This is the first in a series on making scientific figures. Really it's a
general introduction on going from Matlab to Powerpoint (via Illustrator!)
on Windows. Part 1 is Matlab > Illustrator, part 2 is Illustrator >
Powerpoint. This is a collection of tips I found online, along with a few
little tricks I developed for myself.
First it's worthwhile to understand the difference between vector and raster
art.
http://neuropsyence.blogspot.co.uk/2007/12/making-figures-matla
【在 e*******o 的大作中提到】
: KeeVan说的 numpy scipy 和 matplotlib，估计你自己得装半天。
: 如果你不是做大量的矩阵运算，用不到matlab的，
: 处理Excel一般的语言都行。
: 做图比较好用的是R的ggplot2。
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s******a
发帖数: 252 | 9 Many people from engineering background use Matlab.
Matlab and R are better described as computing environment than a computing
language.
If you don't want to get too deep into programming, R is a better choice
than Matlab because of its much larger resources in genomics anaysis. |
b****r
发帖数: 17995 | 10 不要笑话苦逼了。学校有免费license，最近还有个workshop去听了下，觉得貌似挺容
易上手的
【在 K****n 的大作中提到】
: 有钱人啊，我自从毕了业再也没见过能买得起马特拉博的人
: 我觉得学matlab特别不值，一是我没见过除了学生和老师之外的人用，二是它其实已经
: 算c style的programming了，又有oop，还可以system call，但是当你遇上装逼的人，
: 他们会说，“哦？MATLAB太简单，不算编程，会C吗？”。
: 我推荐直接上 numpy scipy 和 matplotlib。这样装逼的人会说，“哦？原来你也是
: open source community的人啊，我也最爱用python了呢！”
: 这样复杂程度差不多。MATLAB主要是传说中矩阵计算牛逼，但是主要题现在凡是for
: loop都要写成矩阵，而数值计算上还是调fortran库的。
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b****r
发帖数: 17995 | 11 其实我要做的处理很简单，就是条件调用一些文件里的一些行、列，可以预见的将来没
有打算做任何深层次的处理，主要的问题可能是我们那几千个表格格式不统一，有txt
，有xls，有xlsx，有各种格式和font，很可能还要直接调sql，如果直接用程序语言处
理，据说很容易出错而且不容易发现哪里错了。貌似matlab对不同microsoft office的
兼容性比较好？
另外一个需要是最后要能把程序打包做成exe之类，给完全不懂编程的人直接调用，不
知道matlab这方面是不是也算比较有优势
【在 e*******o 的大作中提到】
: KeeVan说的 numpy scipy 和 matplotlib，估计你自己得装半天。
: 如果你不是做大量的矩阵运算，用不到matlab的，
: 处理Excel一般的语言都行。
: 做图比较好用的是R的ggplot2。
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b****r
发帖数: 17995 | 12 编程到是不怕去学，当年好歹用C++ 和SAS处理过些简单的东西还发了文章的，我现在
其实要求很简单，也没有打算短期内做任何复杂的运算，将来也没打算专攻
bioinformatics，只要能迅速的处理一些多excel复杂条件读取和简单统计就行了。不
知道R对excel的格式兼容性如何？比如有的格子有颜色，有的粗体，有的前面有‘（为
了标注成文本字符）
我觉得matlab比较吸引我的一点是数据处理过程中的用户界面很友好，随时能看到自己
的数据怎么样了，很多命令还可以通过鼠标点击完成，以我对R极有限的认识，好像这
两方面R做得不如matlab，不知道大侠以为如何？
computing
【在 s******a 的大作中提到】
: Many people from engineering background use Matlab.
: Matlab and R are better described as computing environment than a computing
: language.
: If you don't want to get too deep into programming, R is a better choice
: than Matlab because of its much larger resources in genomics anaysis.
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N******n
发帖数: 3003 | 13 aglee, It is so easy and quick to write a piece of programme using matlab,
its interface including example, help section is very newbie friendly. it is
my favorite. However I still recommend you use R and python since matlab is
very expensive and not popular outside of academia community. In fact, R
people also made a lots of endeavor to improve its interface. You can try
RStudio, very much like matlab.
【在 b****r 的大作中提到】
: 编程到是不怕去学，当年好歹用C++ 和SAS处理过些简单的东西还发了文章的，我现在
: 其实要求很简单，也没有打算短期内做任何复杂的运算，将来也没打算专攻
: bioinformatics，只要能迅速的处理一些多excel复杂条件读取和简单统计就行了。不
: 知道R对excel的格式兼容性如何？比如有的格子有颜色，有的粗体，有的前面有‘（为
: 了标注成文本字符）
: 我觉得matlab比较吸引我的一点是数据处理过程中的用户界面很友好，随时能看到自己
: 的数据怎么样了，很多命令还可以通过鼠标点击完成，以我对R极有限的认识，好像这
: 两方面R做得不如matlab，不知道大侠以为如何？
:
: computing
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b****r
发帖数: 17995 | 14 多谢大侠指教
实际上我目前是打算一直留在学术界的，而且我们使用不少成千上万刀的软件，matlab
single license就是一千多刀吧，如果能节约很多时间，即使要买我觉得也还好。我
其实就是要解决手里现在的这个实际问题，完全没有打算成为hardcore informatician
。主要是不知道到底R对excel 的font，颜色等东西的兼容性如何。刚才去看了Rstudio
的教程，看起来确实比R友好不少，多谢介绍！
另外还需请教的是，不知道R有没有conditional import的功能？我现在的问题是有几
千个患者，每个患者有3-5个不同版本的excel，名字各式各样没有规律，但是都含有
unique的一个患者编号，我需要的是import每个患者最后created的那个excel文件。如
果需要手工选择正确的文件import，那会搞死的。
is
is
【在 N******n 的大作中提到】
: aglee, It is so easy and quick to write a piece of programme using matlab,
: its interface including example, help section is very newbie friendly. it is
: my favorite. However I still recommend you use R and python since matlab is
: very expensive and not popular outside of academia community. In fact, R
: people also made a lots of endeavor to improve its interface. You can try
: RStudio, very much like matlab.
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N******n
发帖数: 3003 | 15 如果你说的这种情况，不需要matlab. 可能只需要20行python code，就行了。找个会
的，一顿饭的功夫就行了。如果近的话，我免费给你做了。、
matlab
informatician
Rstudio
【在 b****r 的大作中提到】
: 多谢大侠指教
: 实际上我目前是打算一直留在学术界的，而且我们使用不少成千上万刀的软件，matlab
: single license就是一千多刀吧，如果能节约很多时间，即使要买我觉得也还好。我
: 其实就是要解决手里现在的这个实际问题，完全没有打算成为hardcore informatician
: 。主要是不知道到底R对excel 的font，颜色等东西的兼容性如何。刚才去看了Rstudio
: 的教程，看起来确实比R友好不少，多谢介绍！
: 另外还需请教的是，不知道R有没有conditional import的功能？我现在的问题是有几
: 千个患者，每个患者有3-5个不同版本的excel，名字各式各样没有规律，但是都含有
: unique的一个患者编号，我需要的是import每个患者最后created的那个excel文件。如
: 果需要手工选择正确的文件import，那会搞死的。
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b****r
发帖数: 17995 | 16 好人，感动。本人在猴子屯
不过就像上面说的，最好还要能打包成小exe文件给其他更newbie的人用，再一个就是
可能还会经常需要调整参数，比如再加1000个excel文件反复进行类似操作，所以最后
还是要完全靠自己的双手。这种情况下你还是会推荐python吗。好像确实很多人都推荐
python做简单数据库处理哈
【在 N******n 的大作中提到】
: 如果你说的这种情况，不需要matlab. 可能只需要20行python code，就行了。找个会
: 的，一顿饭的功夫就行了。如果近的话，我免费给你做了。、
:
: matlab
: informatician
: Rstudio
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l**********1
发帖数: 5204 | 17 LZ can try WINDOWS7 R Tool:
http://www.r-bloggers.com/quickly-read-excel-worksheets-into-r-
Linux/Mac OS X R Tool:
http://www.r-bloggers.com/quickly-read-excel-xlsx-worksheets-in
For how to plot ?
http://www.r-bloggers.com/software-packages-for-graphs-and-char
【在 b****r 的大作中提到】
: 好人，感动。本人在猴子屯
: 不过就像上面说的，最好还要能打包成小exe文件给其他更newbie的人用，再一个就是
: 可能还会经常需要调整参数，比如再加1000个excel文件反复进行类似操作，所以最后
: 还是要完全靠自己的双手。这种情况下你还是会推荐python吗。好像确实很多人都推荐
: python做简单数据库处理哈
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i***r
发帖数: 1035 | 18 如果你的数据是numerical的，而且不是巨大的那种（动不动500MB以上），另外你也不
想学太hard core的编程，matlab很好，或者说是最好的工具，很容易上手，而且看得
懂的人也最多
python的numpy什么的，防matlab的，从另一个角度证明matlab的优势了。
不过python+numpy什么的快很多，只不过python这种东西，需要折腾的比matlab多很多
。如果选python的话我建议你用canopy by enthought。把一堆东西坤到了一起，最接
近matlab
matlab就是慢，尤其是今年的新版matlab，搞得跟office一样。本来java写的GUI就不
快，现在更慢了
最后说一句。。。。我已经抛弃matlab不用了。。。你自己看着办吧 |
i***r
发帖数: 1035 | 19 我记得python那个什么包裹，读xsl很慢，似乎2010后的xslx还不支持 ？
不知道最近有没有更新。。。
matlab
informatician
Rstudio
【在 b****r 的大作中提到】
: 多谢大侠指教
: 实际上我目前是打算一直留在学术界的，而且我们使用不少成千上万刀的软件，matlab
: single license就是一千多刀吧，如果能节约很多时间，即使要买我觉得也还好。我
: 其实就是要解决手里现在的这个实际问题，完全没有打算成为hardcore informatician
: 。主要是不知道到底R对excel 的font，颜色等东西的兼容性如何。刚才去看了Rstudio
: 的教程，看起来确实比R友好不少，多谢介绍！
: 另外还需请教的是，不知道R有没有conditional import的功能？我现在的问题是有几
: 千个患者，每个患者有3-5个不同版本的excel，名字各式各样没有规律，但是都含有
: unique的一个患者编号，我需要的是import每个患者最后created的那个excel文件。如
: 果需要手工选择正确的文件import，那会搞死的。
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i***r
发帖数: 1035 | 20 python 不能（很难）打包成exe
必须安装python
【在 b****r 的大作中提到】
: 好人，感动。本人在猴子屯
: 不过就像上面说的，最好还要能打包成小exe文件给其他更newbie的人用，再一个就是
: 可能还会经常需要调整参数，比如再加1000个excel文件反复进行类似操作，所以最后
: 还是要完全靠自己的双手。这种情况下你还是会推荐python吗。好像确实很多人都推荐
: python做简单数据库处理哈
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e*******o
发帖数: 4654 | 21 this is simple. you are looking for a file with name include specific id
and the newest timestamp. not related to excel.
you have 2 options:
1. learn python or r, whatever language you like
2. hire someone. |
l***y
发帖数: 4671 | 22 过来人说：R。
我是铁杆的 matlab 用户，已经用了 16 年了。现在的 matlab distro 有些还是我做
的 patch。很早就接触 R，但是一直坚持用 matlab。直到毕业后才知道我错了。
尤其是你做的偏统计 -- bioinformatics 和 stat 在学术界来说，R 有决定性的地位
。当你大量重复和 pk 别人算法时，当你 scale up 或者 boot strapping 或者
parameter space exploring 或者 resampling 而不得不上 cluster 时，当你头大
mpi 时，当你因为担心把数据的行或者列的顺序搞乱而提心吊胆时，当你寻找最有效地
boost 你的工作的发布平台时，你就知道了。
【在 b****r 的大作中提到】
: 能出来说说吗，好不好用，上手快吗。只有一些比较基础的编程知识，能熟练使用
: excel
: 主要是为了处理大量的excel和作图
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K****n
发帖数: 5970 | 23 给跪了！ 我多么想玩儿一次mpi啊
【在 l***y 的大作中提到】
: 过来人说：R。
: 我是铁杆的 matlab 用户，已经用了 16 年了。现在的 matlab distro 有些还是我做
: 的 patch。很早就接触 R，但是一直坚持用 matlab。直到毕业后才知道我错了。
: 尤其是你做的偏统计 -- bioinformatics 和 stat 在学术界来说，R 有决定性的地位
: 。当你大量重复和 pk 别人算法时，当你 scale up 或者 boot strapping 或者
: parameter space exploring 或者 resampling 而不得不上 cluster 时，当你头大
: mpi 时，当你因为担心把数据的行或者列的顺序搞乱而提心吊胆时，当你寻找最有效地
: boost 你的工作的发布平台时，你就知道了。
|
l***y
发帖数: 4671 | 24 用 Rmpi + OpenMPI 做 master/slave 相当爽啊。相比之下，用 C 写 mpi 调用 R 的
主要问题是传复杂的数据结构是比较折腾。
cluster 上跑 matlab 的问题有俩：一个是很多 cluster 不支持 matlab，起码经常不
支持自己要用的那些 toolboxes；另一个是往往买不起那么多的 license，极大地限制
了并行的规模。
【在 K****n 的大作中提到】
: 给跪了！ 我多么想玩儿一次mpi啊
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l**********1
发帖数: 5204 | 25 plus coursera lecture: Data Management for Clinical Research with R
Sessions:
Sep 16th 2013(5 weeks long)
https://www.coursera.org/course/datamanagement
>
>>
【在 e*******o 的大作中提到】
: this is simple. you are looking for a file with name include specific id
: and the newest timestamp. not related to excel.
: you have 2 options:
: 1. learn python or r, whatever language you like
: 2. hire someone.
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w********m
发帖数: 1137 | 26 靠，你们这些坏人，忽悠楼主学什么matlab，python还有R什么的。
楼主不就是要做点Excel吗？听哥的，用VBA。
跟matlab，python还有R，一根毛的关系都没有。 |
p*l
发帖数: 1359 | 27 这种事用Regular expression最好。我用MatLab批处理数据，先搜索出当前目录下所有
文件名，然后用regular expression按关键字筛选，选中的文件批量处理。
MatLab是基本什么数据都能做。只两点不好：一是用它写GUI实在坑人了点。二是画图
功能很复杂，很多东西要么菜单藏的很深，要么要靠code实现，不容易掌握。但是好处
是，一旦你写好了code，可以把无数套数据按同一格式画出来。加上它本身的数据处理
功能，在处理图像数据和画图上，MatLab的自由度非常非常大。开玩笑说，如果拿
MatLab改图的话，我绝对能改得天衣无缝。
【在 b****r 的大作中提到】
: 好人，感动。本人在猴子屯
: 不过就像上面说的，最好还要能打包成小exe文件给其他更newbie的人用，再一个就是
: 可能还会经常需要调整参数，比如再加1000个excel文件反复进行类似操作，所以最后
: 还是要完全靠自己的双手。这种情况下你还是会推荐python吗。好像确实很多人都推荐
: python做简单数据库处理哈
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e*******o
发帖数: 4654 | 28 理论上，VBA 搞Excel 更合适，都是M$自己的东西。
但是为了搞个EXCEL学VB太不值。貌似VB的编译器也要钱吧。
【在 w********m 的大作中提到】
: 靠，你们这些坏人，忽悠楼主学什么matlab，python还有R什么的。
: 楼主不就是要做点Excel吗？听哥的，用VBA。
: 跟matlab，python还有R，一根毛的关系都没有。
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l***y
发帖数: 4671 | 29 VBA 更是大坑啊。的确好用，上学的时候比较过，速度比 matlab 快，但是编程比 R/
matlab 麻烦，可用的包少太多了，大量的算法得自己写。做最基本最常规的处理还可
以 -- 如果 lz 对 VB 以及面对对象编程的概念熟悉的话。
【在 w********m 的大作中提到】
: 靠，你们这些坏人，忽悠楼主学什么matlab，python还有R什么的。
: 楼主不就是要做点Excel吗？听哥的，用VBA。
: 跟matlab，python还有R，一根毛的关系都没有。
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K****n
发帖数: 5970 | 30 我其实特别想干的事儿是，用c写，socket通讯，在一个gpu cluster上，把常用
machine learning算法都并行实现一遍，再想办法用web service给expose出来，要存
数据的话都用in memory db
啊～～太爽啦～
就是不知道有什么用，估计这辈子是没机会了
【在 l***y 的大作中提到】
: 用 Rmpi + OpenMPI 做 master/slave 相当爽啊。相比之下，用 C 写 mpi 调用 R 的
: 主要问题是传复杂的数据结构是比较折腾。
: cluster 上跑 matlab 的问题有俩：一个是很多 cluster 不支持 matlab，起码经常不
: 支持自己要用的那些 toolboxes；另一个是往往买不起那么多的 license，极大地限制
: 了并行的规模。
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s******a
发帖数: 472 | 31 写了一定有人用
【在 K****n 的大作中提到】
: 我其实特别想干的事儿是，用c写，socket通讯，在一个gpu cluster上，把常用
: machine learning算法都并行实现一遍，再想办法用web service给expose出来，要存
: 数据的话都用in memory db
: 啊～～太爽啦～
: 就是不知道有什么用，估计这辈子是没机会了
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l**********1
发帖数: 5204 | 32 if lz can understand french and ANOVA
if want to learn R
just go to
HTTP: //dl.dropboxusercontent.com/u/192975/MU512_Rappels_ANOVA_Regression.
pdf
more
http://www.biologie.ens.fr/~cazelles/bernard/MU512.html
or
http://www.biologie.ens.fr/~cazelles/bernard/Teaching.html
Output from that teacher by R and ANOVA etc
http://www.biologie.ens.fr/~cazelles/bernard/Research.html
List of publications click this icon.
matlab
informatician
Rstudio
【在 b****r 的大作中提到】
: 多谢大侠指教
: 实际上我目前是打算一直留在学术界的，而且我们使用不少成千上万刀的软件，matlab
: single license就是一千多刀吧，如果能节约很多时间，即使要买我觉得也还好。我
: 其实就是要解决手里现在的这个实际问题，完全没有打算成为hardcore informatician
: 。主要是不知道到底R对excel 的font，颜色等东西的兼容性如何。刚才去看了Rstudio
: 的教程，看起来确实比R友好不少，多谢介绍！
: 另外还需请教的是，不知道R有没有conditional import的功能？我现在的问题是有几
: 千个患者，每个患者有3-5个不同版本的excel，名字各式各样没有规律，但是都含有
: unique的一个患者编号，我需要的是import每个患者最后created的那个excel文件。如
: 果需要手工选择正确的文件import，那会搞死的。
|
c******o
发帖数: 1184 | 33 这个要安装VC++, 最烦的是不同版本的matlab对VC的版本也有要求，
不过装好后做exe还是很方便
txt
【在 b****r 的大作中提到】
: 其实我要做的处理很简单，就是条件调用一些文件里的一些行、列，可以预见的将来没
: 有打算做任何深层次的处理，主要的问题可能是我们那几千个表格格式不统一，有txt
: ，有xls，有xlsx，有各种格式和font，很可能还要直接调sql，如果直接用程序语言处
: 理，据说很容易出错而且不容易发现哪里错了。貌似matlab对不同microsoft office的
: 兼容性比较好？
: 另外一个需要是最后要能把程序打包做成exe之类，给完全不懂编程的人直接调用，不
: 知道matlab这方面是不是也算比较有优势
|
K****n
发帖数: 5970 | 34 谁用让谁装MCR？
http://www.mathworks.com/products/compiler/mcr/index.html
【在 c******o 的大作中提到】
: 这个要安装VC++, 最烦的是不同版本的matlab对VC的版本也有要求，
: 不过装好后做exe还是很方便
:
: txt
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c******o
发帖数: 1184 | 35 是啊，不同版本的MCR有时候还不兼容，所以一般都从自己pc上打包省心
【在 K****n 的大作中提到】
: 谁用让谁装MCR？
: http://www.mathworks.com/products/compiler/mcr/index.html
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