n*******l
发帖数: 75 | 1 请教构建lentivirus质粒的大拿，菜鸟求教
我想沉默pc12细胞的一个基因。查到某公司有公布的基因的沉默序列，在pGFP-shlenti
上。我想构建到lvthm上
问题是我们实验室构建的模版都是（21nt+9bp的loop+21nt的反向互补）在lVTHM上。公
司公布的是（29nt+7bp+29nt的反向互补）
。直接把用（29nt+9bp的loop+29nt的反向互
补）可以直接构建到lvthm上 影响沉默效率么，另外，loop的长短会影响沉默效率么。
万分感谢。 |
p********i
发帖数: 116 | |
n*******l
发帖数: 75 | 3 sigma 买什么？ 我要的是大鼠的某个序列沉默。 |
d*****r
发帖数: 45 | 4 理论上不会影响吧，但我也没横向比较过7bp和9bp的loop效果到底差多少。
我们用过21＋6＋21的，效果最好能到90％ |
r***e
发帖数: 2539 | 5 长度没问题（19-29都有），序列才是关键。最近在做一个22nt的序列，我一不小心漏了
5'一个nt，成了21nt竟然一点都不行。但并不是说21nt长度不行。（有点拗口，但就是
这个意思）
shlenti
【在 n*******l 的大作中提到】
: 请教构建lentivirus质粒的大拿，菜鸟求教
: 我想沉默pc12细胞的一个基因。查到某公司有公布的基因的沉默序列，在pGFP-shlenti
: 上。我想构建到lvthm上
: 问题是我们实验室构建的模版都是（21nt+9bp的loop+21nt的反向互补）在lVTHM上。公
: 司公布的是（29nt+7bp+29nt的反向互补）
: 。直接把用（29nt+9bp的loop+29nt的反向互
: 补）可以直接构建到lvthm上 影响沉默效率么，另外，loop的长短会影响沉默效率么。
: 万分感谢。
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a*******a
发帖数: 4233 | 6 origin, openbiosystem
【在 n*******l 的大作中提到】
: sigma 买什么？ 我要的是大鼠的某个序列沉默。
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j******n
发帖数: 941 | |
