f*c 发帖数: 2726 | 1 用imageJ 来quantitate gel band, 为啥空白lane背景intensity高于样品条带的强度
,是哪里要设置一下?
我就是用长方形选择条带,然后直接measure,总是背景的强度最大,正好反着来
谢谢 |
s*****j 发帖数: 6435 | 2 "Edit" --> "Invert"
【在 f*c 的大作中提到】 : 用imageJ 来quantitate gel band, 为啥空白lane背景intensity高于样品条带的强度 : ,是哪里要设置一下? : 我就是用长方形选择条带,然后直接measure,总是背景的强度最大,正好反着来 : 谢谢
|
f*c 发帖数: 2726 | 3 那样图的背景就是黑色,然后条带变成白色,measure倒是对了,谢谢哈
就是好奇,不能直接measure条带的黑度吗?
【在 s*****j 的大作中提到】 : "Edit" --> "Invert"
|
s**2 发帖数: 1287 | 4 ImageJ 主要是针对显微镜照片开发的,而显微镜照片亮的才是信号。
【在 f*c 的大作中提到】 : 那样图的背景就是黑色,然后条带变成白色,measure倒是对了,谢谢哈 : 就是好奇,不能直接measure条带的黑度吗?
|
s*****j 发帖数: 6435 | 5 No. most of the time ImageJ will assume you work on "dark" objects. you
need to set it to work on "white" objects.
【在 s**2 的大作中提到】 : ImageJ 主要是针对显微镜照片开发的,而显微镜照片亮的才是信号。
|
s*****j 发帖数: 6435 | 6 直接measure条带的黑度, 你不是嫌背景高 不舒服吗?
【在 f*c 的大作中提到】 : 那样图的背景就是黑色,然后条带变成白色,measure倒是对了,谢谢哈 : 就是好奇,不能直接measure条带的黑度吗?
|
f*c 发帖数: 2726 | 7 我再把背景减掉,如果我不事先invert,就得用背景去减样品,其实也可以,就是觉得
怪怪的
既然大家都觉得imagej本来就这样,我就放心了
【在 s*****j 的大作中提到】 : 直接measure条带的黑度, 你不是嫌背景高 不舒服吗?
|
a****c 发帖数: 339 | |
f*c 发帖数: 2726 | 9 我有看到这个,谢谢,其实我只想要Intensity的数据,这个貌似做得比较fancy
【在 a****c 的大作中提到】 : ImageJ has a built-in method for quantifying western bands. : http://lukemiller.org/index.php/2010/11/analyzing-gels-and-west
|
b********r 发帖数: 31 | 10 为啥不用image studio lite? 个人觉得比imageJ 好用太多 |
f*c 发帖数: 2726 | 11 不知道这个软件,实验室的人好像都用得imageJ, 也是免费下载的吗?
【在 b********r 的大作中提到】 : 为啥不用image studio lite? 个人觉得比imageJ 好用太多
|
e******0 发帖数: 2149 | 12 有人用过Scion Image 来定量western吗 |