做mutation calling的时候，一般用什么genome做reference？ - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 做mutation calling的时候，一般用什么genome做reference？

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x******m 发帖数: 736	1 我的sample是cancer patient的。用normal tissue还是hg16做reference？
s*********x 发帖数: 1923	2 hg16? at least hg19 and there is a version used by 1000Genome
x*****d 发帖数: 704	3 比较稳妥的是nomral tissue和cancer patient都用hg19做reference，然后在cancer patients里面的mutation排除掉normal tissue里面的mutation

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