r******t
发帖数: 135 | 1 选择shRNA的序列，用哪一种软件比较可靠？多谢 | T****u
发帖数: 424 | 2 http://blog.sina.com.cn/s/blog_12d8810790102uyry.html
有微友私信问设计siRNA、shRNA和gRNA. 今天先说siRNA和shRNA吧。
一般我是take advantage of sigma. 他们有现成的shRNA产品，而且反响很好。
当然了，土豪可以自己去Dharmacon订购siRNA， 或者在sigma订购shRNA,甚至是包装好
的病毒。
1.第一步去sigma英文网站，一定要是英文网站
http://www.sigmaaldrich.com/united-states.html
#华夏小奇说实验的事#设计siRNA和shRNA
2. 搜索你感兴趣的基因。如TNFR, 出来结果之后点击shRNA(下图黑色剪头所示)
插播广告 订购基因敲除小鼠请访问公司网站（2-4个月，小鼠转基因、敲除敲入、条件
性敲除）
#华夏小奇说实验的事#设计siRNA和shRNA
3. 点击进入下个页面，点击pricing，会出现每个shRNA的hairpin的序列。
如下面的序列，介于“CCGG”和"CTCGAG"之间的，就是shRNA的目标序列。
可以根据这个序列设计siRNA和shRNA(自己合成hairpin, 退火连入pLKO or Tet-pLKO就
可以做knockdown和inducible knockdown).
CCGGCACGACTTCATCCACGGATATCTCGAGATATCCGTGGATGAAGTCGTGTTTTTG
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