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Biology版 - 有人做Autophagy吗?
相关主题
氯奎 可以使LC3II增加,为什么还是autophagy的抑制剂呢?YFP为啥是green的
有人用过GFP或者mCherry标记的LC3来观测autophagy吗?问一下用FACS能否区分EGFP/RFP
问做autophagy的同学一些问题求教版上大牛,怎样区分clump 里的细胞是分裂来的还是自发地凑在一起的?
版上有没人在做Autophagy??有什么方法可以high-throughput screen 一个蛋白的stability 的调控机理?
做Autophagy的请进求帮助:细胞内荧光蛋白表达
什么软件可以计数细胞内的点状物?请问GFP抗体能识别别的荧光蛋白吗?
问个stable cell line with multiple color的问题请教Autophagy的大牛,奎宁(Chloroquine)是抑制剂还是启动Autophagy
Arguing with Boss with co-transfection完全依赖proteasome降解的蛋白,谁给介绍几个?
相关话题的讨论汇总
话题: p62话题: autophagy话题: lc3话题: ii
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c********e
发帖数: 215
1
很多paper说用了各种autophagy inducer,然后看到了p62 upregulation, LC3-II
upregulation, induced autophagy, 也有很多paper说抑制了autophagy看到p62的
accumulation。这个p62上调到底是说induced还是suppressed autophagy。越看越糊涂
c********e
发帖数: 215
2
我自己做发现用某一种东西induce了autophagy以后,increased LC3-II for sure, 但
也有很明显的p62 upregulation.
c******g
发帖数: 49
3

p62可以结合ubiquitinated cargo,同时又结合LC3,所以autophagy inducation 可能
看到p62 upregulation。如果autophagosome-lysosome 被抑制,可以看到p62
accumulation.

【在 c********e 的大作中提到】
: 很多paper说用了各种autophagy inducer,然后看到了p62 upregulation, LC3-II
: upregulation, induced autophagy, 也有很多paper说抑制了autophagy看到p62的
: accumulation。这个p62上调到底是说induced还是suppressed autophagy。越看越糊涂
: 。

c********e
发帖数: 215
4
如果我in vitro看到加了药A,有LC3-II conversion, p62 upregulation, 在in vivo
的实验中做了p62的IHC,也看到了处理后的upregulation,我可以说in vivo也证明药A
induce autophagy吗?
x*****e
发帖数: 309
5
你这情况好像是autophagy flux blockage. chloroquine CQ是溶酶体抑制剂,你可以
处理的时候加CQ, 如果cq能够增强你的处理引起的LC3II 增加,那就是诱导autophagy,
如果没什么变化,那就可能是LC3II的降解受抑制导致LC3II增加,就可能是autophagy
flux blockage:fusion of autophagosome and lysosome is inhibited。p62是
autophagy的特异性受体,自噬增加会导致p62降解增加,减少p62蛋白量;flux受抑制
则会降低p62的降解,增加p62的蛋白量,所以你的情况看着像是flux blockage。 另外
,检测的时间点很关键的,没有记错的话饥饿2小时的时候LC3II 上升,4小时之后则
降低。 推荐:Guidelines for the use and interpretation of assays for
monitoring autophagy
c********e
发帖数: 215
6
这也是我confuse的地方,in vitro的data很clear, in vivo p62 IHC upregulation是
处理了好多次,一个月以后收的sample。有这个paper说,很多人只用p62做autophagy
flux的底物,实际上,多等一段时间,p62表达又自己恢复了
https://www.landesbioscience.com/journals/autophagy/2012AUTO0626R1.pdf

【在 x*****e 的大作中提到】
: 你这情况好像是autophagy flux blockage. chloroquine CQ是溶酶体抑制剂,你可以
: 处理的时候加CQ, 如果cq能够增强你的处理引起的LC3II 增加,那就是诱导autophagy,
: 如果没什么变化,那就可能是LC3II的降解受抑制导致LC3II增加,就可能是autophagy
: flux blockage:fusion of autophagosome and lysosome is inhibited。p62是
: autophagy的特异性受体,自噬增加会导致p62降解增加,减少p62蛋白量;flux受抑制
: 则会降低p62的降解,增加p62的蛋白量,所以你的情况看着像是flux blockage。 另外
: ,检测的时间点很关键的,没有记错的话饥饿2小时的时候LC3II 上升,4小时之后则
: 降低。 推荐:Guidelines for the use and interpretation of assays for
: monitoring autophagy

d*2
发帖数: 35
7
根据多年的经验,p62不consistent,很多时候跟lc3-ii共进退。用lc3的wb和gfp-lc3
就行了。
s****l
发帖数: 395
8
测一下p62转录水平有没有变化

【在 c********e 的大作中提到】
: 很多paper说用了各种autophagy inducer,然后看到了p62 upregulation, LC3-II
: upregulation, induced autophagy, 也有很多paper说抑制了autophagy看到p62的
: accumulation。这个p62上调到底是说induced还是suppressed autophagy。越看越糊涂
: 。

c********e
发帖数: 215
9
谢谢,我也发现是这样,GFP-LC3, LC3-II,p62 in vitro都有上调,但我需要(老板
非要)看下in
vivo的IHC,很明显处理后p62的IHC表达增强。我可以说in vivo的finding也支持这个
要induce autophagy吗?

lc3

【在 d*2 的大作中提到】
: 根据多年的经验,p62不consistent,很多时候跟lc3-ii共进退。用lc3的wb和gfp-lc3
: 就行了。

d*2
发帖数: 35
10
1. 首先看GFP-LC3, LC3-II,这个你做过了
2. In vitro 处理Bafilomycin或者Chloroquine,然后再看GFP-LC3, LC-II,这个
可以知道Flux
3. 或者用RFP-GFP-LC3看Flux
4. In vivo,染色看LC-3,如果可以的话,注射Bafilomycin,再看LC-3II的WB。或
者找reporter小鼠。P62可看可不看,毕竟能提供的信息量不多。

【在 c********e 的大作中提到】
: 谢谢,我也发现是这样,GFP-LC3, LC3-II,p62 in vitro都有上调,但我需要(老板
: 非要)看下in
: vivo的IHC,很明显处理后p62的IHC表达增强。我可以说in vivo的finding也支持这个
: 要induce autophagy吗?
:
: lc3

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话题: p62话题: autophagy话题: lc3话题: ii