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Biology版 - 做生物实验能偷懒还获得很多data吗?
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有没有谁有鼓捣生物信息服务公司的想法?去药厂做bioinformatics的难度有多大?
请大牛科普下这几个database:Oncomine, TCGA, CCLE, cBioPortal求partner or senior scientists
有没有tumor CNA的统计数据转行 bioinformatics
copy number variation哪个公司的WB dry transfer system比较好用?
用WGS寻找疾病structural variation的文章Re: Question of microarray:gene expression
Which method is better for copy number variation detection, NGS or microarray?NCBI 的 SRA 停了?
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相关话题的讨论汇总
话题: data话题: bioinfo话题: 数据话题: 实验话题: 很多
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1 (共1页)
V******t
发帖数: 444
1
交流交流经验啊。一边逛街度假看闲书 enjoy life,同时还能轻易获得很多data。
怎么能做到?说说啊
C*********h
发帖数: 83
2
雇30个博后
写好文章你签字就好

【在 V******t 的大作中提到】
: 交流交流经验啊。一边逛街度假看闲书 enjoy life,同时还能轻易获得很多data。
: 怎么能做到?说说啊

D*a
发帖数: 6830
3
bioinfo吧
m*********D
发帖数: 1727
4
仅仅想少作试验,可以看看“大数据”的方向,看看你在方面有没有专长。
很多microarray data是公开的。生物发展到现在,领域越分越细,很多作miacroassay
的,只看和他/她研究相关的东西,其他data对他/她没有多少用处。你在你的领域可以
用这些data,要找到金矿,就可以少作很多试验。
以前读到个类似的文章。我们实验室的学生也这么干过。前者是先data,后试验验证;
我们这个倒是作的差不多了,有了idea,再去数据库找数据验证。
我自己在这方面不行,但看“猪走过路”。

【在 V******t 的大作中提到】
: 交流交流经验啊。一边逛街度假看闲书 enjoy life,同时还能轻易获得很多data。
: 怎么能做到?说说啊

t*****z
发帖数: 1598
5
没错我就是这么搞的,下载来的数据鼓捣鼓捣,各种东西都弄一点,就整个paper出来
。我做这个不仅是为了凑paper,更重要的作为通往bioinfo界的敲门砖。最近终于如愿
全职做大数据去了,再也不用喂老鼠了耶。

miacroassay

【在 m*********D 的大作中提到】
: 仅仅想少作试验,可以看看“大数据”的方向,看看你在方面有没有专长。
: 很多microarray data是公开的。生物发展到现在,领域越分越细,很多作miacroassay
: 的,只看和他/她研究相关的东西,其他data对他/她没有多少用处。你在你的领域可以
: 用这些data,要找到金矿,就可以少作很多试验。
: 以前读到个类似的文章。我们实验室的学生也这么干过。前者是先data,后试验验证;
: 我们这个倒是作的差不多了,有了idea,再去数据库找数据验证。
: 我自己在这方面不行,但看“猪走过路”。

s*****g
发帖数: 7857
6
都去哪里下载或找数据呢?
m*********D
发帖数: 1727
7
这个呢,你可以根据你的细胞系,领域等等找发表了的microarray数据。更多大数据顺
藤摸瓜就找到了。
还有是很多大型医院研究机构的数据。尤其是医院的,他们往往和临床有关,象Mayo,
他们有自己的bioimform。section,合作也可能的。

【在 s*****g 的大作中提到】
: 都去哪里下载或找数据呢?
t*****z
发帖数: 1598
8
稍微学一点脚本语言,就可以批量从数据库网站上抓数据。编程真是非常有用。现在我
给我之前的导师培训新学生,把实验和数据分析先放一边,重点教编程。

【在 s*****g 的大作中提到】
: 都去哪里下载或找数据呢?
m******5
发帖数: 1383
9
求带入门!!能多提供点信息么?

【在 t*****z 的大作中提到】
: 稍微学一点脚本语言,就可以批量从数据库网站上抓数据。编程真是非常有用。现在我
: 给我之前的导师培训新学生,把实验和数据分析先放一边,重点教编程。

D*a
发帖数: 6830
10
你们实验室是做bioinfo的还是湿的?都是自学的?

【在 t*****z 的大作中提到】
: 没错我就是这么搞的,下载来的数据鼓捣鼓捣,各种东西都弄一点,就整个paper出来
: 。我做这个不仅是为了凑paper,更重要的作为通往bioinfo界的敲门砖。最近终于如愿
: 全职做大数据去了,再也不用喂老鼠了耶。
:
: miacroassay

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t*****z
发帖数: 1598
11
我都是自学的。我之前几个实验室都是实验为主。我觉得我们做实验的要学好编程有一
条窍门,就是任何需要重复30次以上的操作都试图寻求自动化的解决方案。只要存有这
个信念,就能在实践中提高。

【在 D*a 的大作中提到】
: 你们实验室是做bioinfo的还是湿的?都是自学的?
m********a
发帖数: 12601
12
现在不弄点machine learning就能做bioinfo了?那这个门槛还是涨得慢啊

【在 t*****z 的大作中提到】
: 没错我就是这么搞的,下载来的数据鼓捣鼓捣,各种东西都弄一点,就整个paper出来
: 。我做这个不仅是为了凑paper,更重要的作为通往bioinfo界的敲门砖。最近终于如愿
: 全职做大数据去了,再也不用喂老鼠了耶。
:
: miacroassay

W***o
发帖数: 6519
13
多刨一刨TCGA,做点统计就可以发表故事了

【在 V******t 的大作中提到】
: 交流交流经验啊。一边逛街度假看闲书 enjoy life,同时还能轻易获得很多data。
: 怎么能做到?说说啊

t*****z
发帖数: 1598
14
楼主问的是data mining。

【在 m********a 的大作中提到】
: 现在不弄点machine learning就能做bioinfo了?那这个门槛还是涨得慢啊
e*******o
发帖数: 4654
15
不重复第二次
DRY

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我都是自学的。我之前几个实验室都是实验为主。我觉得我们做实验的要学好编程有一
: 条窍门,就是任何需要重复30次以上的操作都试图寻求自动化的解决方案。只要存有这
: 个信念,就能在实践中提高。

e*******o
发帖数: 4654
16
我跟像你这样的提个醒
你的基础 可以找找非学术的工作
基本工资double没问题
当然 喜欢做research的除外

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我都是自学的。我之前几个实验室都是实验为主。我觉得我们做实验的要学好编程有一
: 条窍门,就是任何需要重复30次以上的操作都试图寻求自动化的解决方案。只要存有这
: 个信念,就能在实践中提高。

a*******a
发帖数: 4233
17
只要能找准方向,其实不用很努力。。
恶心的是找方向的过程

【在 V******t 的大作中提到】
: 交流交流经验啊。一边逛街度假看闲书 enjoy life,同时还能轻易获得很多data。
: 怎么能做到?说说啊

n********t
发帖数: 1079
18
TCGA的原始数据很可能是一个烂摊子(比如他们某个小项的WGS数据中至少一半的pair
有严重的artifacts),单靠刨TCGA出来的东西,自己不实验验证,结果多数是垃圾。

【在 W***o 的大作中提到】
: 多刨一刨TCGA,做点统计就可以发表故事了
l**********8
发帖数: 337
19
看了这个标题我就想起Immigration版前不久的一个帖子,“非一作文章相同贡献的证
明信模板”。

【在 V******t 的大作中提到】
: 交流交流经验啊。一边逛街度假看闲书 enjoy life,同时还能轻易获得很多data。
: 怎么能做到?说说啊

1 (共1页)
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