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Biology版 - 怎么blast deep sequencing结果fastaq file中有没有一段特殊序列?
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Should transgenic mice from the same founder have the equal copy number of transgenes?各位大虾,请指点一下,拜托!
Short sequence match in a long sequence - help needed三黄包求方案可行性!!!co-microinjection(for transgenic mice!!!)
请大家推荐一下序列分析软件求推荐做transgenic mice 的公司
请教:如何提高Blast result #?about sequencing pCMV
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y*********u
发帖数: 183
1
chip seq data , 担心core Facility把别人的data给我了,想能否分析一下data里是
否有我的transgenic mice里的一段特定序列,要怎么做?
j****n
发帖数: 3370
2
分析的时候查下indel就行了

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

【在 y*********u 的大作中提到】
: chip seq data , 担心core Facility把别人的data给我了,想能否分析一下data里是
: 否有我的transgenic mice里的一段特定序列,要怎么做?

y*********u
发帖数: 183
3
sorry what is indel? Or do you mean index?

【在 j****n 的大作中提到】
: 分析的时候查下indel就行了
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

j****n
发帖数: 3370
4
Insertion and deletion
Btw, do you ever use any ngs analysis software?

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【在 y*********u 的大作中提到】
: sorry what is indel? Or do you mean index?
y*********u
发帖数: 183
5
No just Galaxy

【在 j****n 的大作中提到】
: Insertion and deletion
: Btw, do you ever use any ngs analysis software?
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

j****n
发帖数: 3370
6
Galaxy has this function...

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

【在 y*********u 的大作中提到】
: No just Galaxy
y*********u
发帖数: 183
7
Thank you!! Never used it. Mainly just do peak calling.
Do you know in which toolset it is listed under?

【在 j****n 的大作中提到】
: Galaxy has this function...
:
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g********6
发帖数: 86
8
把那段特定序列作为基因组,看input能不能map上去
g*r
发帖数: 67
9
赞同。chip也应该试试map。

【在 g********6 的大作中提到】
: 把那段特定序列作为基因组,看input能不能map上去
y*********u
发帖数: 183
10
Thank you!! Can I do it in Galaxy main?

【在 g********6 的大作中提到】
: 把那段特定序列作为基因组,看input能不能map上去
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