ChIPseq的spike-in是必须的嘛？ - Biology版

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Biology版 - ChIPseq的spike-in是必须的嘛？

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相关话题的讨论汇总
话题: spike话题: chipseq话题: 必须

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j*********g
发帖数: 463

不同的人／文献都说的不一样。
求懂的人说说。我想比较未分化vs分化状态的细胞enhancer的变化，ChIP K27ac和
K4me1，需要spike-in嘛？
倒是有商业化的spike-in chromatin/antibody卖。
https://www.activemotif.com/catalog/1091/chip-normalization
谢谢！

j*******u
发帖数: 81

当然不是必须的
你的实验里最doMinant的因素是 differentiation effeciency和purification
methods.

【在 j*********g 的大作中提到】

: 不同的人／文献都说的不一样。
: 求懂的人说说。我想比较未分化vs分化状态的细胞enhancer的变化，ChIP K27ac和
: K4me1，需要spike-in嘛？
: 倒是有商业化的spike-in chromatin/antibody卖。
: https://www.activemotif.com/catalog/1091/chip-normalization
: 谢谢！

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