v********a 发帖数: 646 | 1 通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
筛选到和该疾病相关的基因,从而进行下游分析?
没有编码经验,求指导,谢谢 |
j*********g 发帖数: 463 | 2 easy。
不需要会代码。
Google gene ontology加上关键词 g:profiler 或者 gorilla 或者 DAVID 或者
Metascape。把你的基因放进去就行。
如果想同时考虑基因的表达情况,可以用Broad Institute的GSEA,也是用户友好软件
,不需要写代码。这个可以考虑基因的表达高低,比如TPM或者fold change,需要发表
过的reference gene datasets,Broad网站提供各种下载,你读读手册就会用。
[在 vicillibra (vicillibra) 的大作中提到:]
:通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
:如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
:筛选到和该疾病相关的基因,从而进行下游分析?
:没有编码经验,求指导,谢谢 |
n******7 发帖数: 12463 | |
c**y 发帖数: 2282 | 4 学着写点代码才是治本之道
【在 v********a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel) : 如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析 : 筛选到和该疾病相关的基因,从而进行下游分析? : 没有编码经验,求指导,谢谢
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t****i 发帖数: 34 | 5 不需要写多少“代码”,很多软件都有教程的,但是需要懂一些统计知识。会基本的R |
v********a 发帖数: 646 | |