v********a
发帖数: 646 | 1 通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
筛选到和该疾病相关的基因，从而进行下游分析？
没有编码经验，求指导，谢谢 |
j*********g
发帖数: 463 | 2 easy。
不需要会代码。
Google gene ontology加上关键词 g:profiler 或者 gorilla 或者 DAVID 或者
Metascape。把你的基因放进去就行。
如果想同时考虑基因的表达情况，可以用Broad Institute的GSEA，也是用户友好软件
，不需要写代码。这个可以考虑基因的表达高低，比如TPM或者fold change，需要发表
过的reference gene datasets，Broad网站提供各种下载，你读读手册就会用。
[在 vicillibra (vicillibra) 的大作中提到：]
:通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
:如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
:筛选到和该疾病相关的基因，从而进行下游分析？
:没有编码经验，求指导，谢谢 |
n******7
发帖数: 12463 | |
c**y
发帖数: 2282 | 4 学着写点代码才是治本之道
【在 v********a 的大作中提到】
: 通过测序手段获得的一堆上调或者下降的基因(excel)
: 如何对其进行Gene Ontology/Function Annotation 分析
: 筛选到和该疾病相关的基因，从而进行下游分析？
: 没有编码经验，求指导，谢谢
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t****i
发帖数: 34 | 5 不需要写多少“代码”，很多软件都有教程的，但是需要懂一些统计知识。会基本的R |
v********a
发帖数: 646 | |
