j*********g
发帖数: 463 | 1 当然取决于细胞系和target蛋白。
但是泛泛而言，数量级一般是多少？
比如组蛋白修饰，十万？一万？
转录因子，一万？两千？五百？
谢谢！ |
r**********r
发帖数: 21 | 2 master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
一般的转录因子会少些，几千。
【在 j*********g 的大作中提到】
: 当然取决于细胞系和target蛋白。
: 但是泛泛而言，数量级一般是多少？
: 比如组蛋白修饰，十万？一万？
: 转录因子，一万？两千？五百？
: 谢谢！
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e*********6
发帖数: 3453 | 3 请教一下peak是什么意思？
【在 j*********g 的大作中提到】
: 当然取决于细胞系和target蛋白。
: 但是泛泛而言，数量级一般是多少？
: 比如组蛋白修饰，十万？一万？
: 转录因子，一万？两千？五百？
: 谢谢！
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a******r
发帖数: 786 | 4 protein binding region on DNA
【在 e*********6 的大作中提到】
: 请教一下peak是什么意思？
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j*********g
发帖数: 463 | 5 组蛋白修饰多少？十万？
[在 repeatmasker (repeatmarker) 的大作中提到：]
:master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
:一般的转录因子会少些，几千。 |
e*********6
发帖数: 3453 | 6 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
【在 a******r 的大作中提到】
: protein binding region on DNA
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f*******e
发帖数: 354 | 7 Reads数量你钱多你就狂测，到一定depth后再多也不会改变peak数量，可能peak会好
看一点吧
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
【在 e*********6 的大作中提到】
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
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e*********6
发帖数: 3453 | 8 是不是region的范围大一些？
【在 f*******e 的大作中提到】
: Reads数量你钱多你就狂测，到一定depth后再多也不会改变peak数量，可能peak会好
: 看一点吧
:
:
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
:
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j*********g
发帖数: 463 | 9 当然取决于细胞系和target蛋白。
但是泛泛而言，数量级一般是多少？
比如组蛋白修饰，十万？一万？
转录因子，一万？两千？五百？
谢谢！ |
r**********r
发帖数: 21 | 10 master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
一般的转录因子会少些，几千。
【在 j*********g 的大作中提到】
: 当然取决于细胞系和target蛋白。
: 但是泛泛而言，数量级一般是多少？
: 比如组蛋白修饰，十万？一万？
: 转录因子，一万？两千？五百？
: 谢谢！
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e*********6
发帖数: 3453 | 11 请教一下peak是什么意思？
【在 j*********g 的大作中提到】
: 当然取决于细胞系和target蛋白。
: 但是泛泛而言，数量级一般是多少？
: 比如组蛋白修饰，十万？一万？
: 转录因子，一万？两千？五百？
: 谢谢！
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a******r
发帖数: 786 | 12 protein binding region on DNA
【在 e*********6 的大作中提到】
: 请教一下peak是什么意思？
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j*********g
发帖数: 463 | 13 组蛋白修饰多少？十万？
[在 repeatmasker (repeatmarker) 的大作中提到：]
:master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
:一般的转录因子会少些，几千。 |
e*********6
发帖数: 3453 | 14 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
【在 a******r 的大作中提到】
: protein binding region on DNA
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f*******e
发帖数: 354 | 15 Reads数量你钱多你就狂测，到一定depth后再多也不会改变peak数量，可能peak会好
看一点吧
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
【在 e*********6 的大作中提到】
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
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e*********6
发帖数: 3453 | 16 是不是region的范围大一些？
【在 f*******e 的大作中提到】
: Reads数量你钱多你就狂测，到一定depth后再多也不会改变peak数量，可能peak会好
: 看一点吧
:
:
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量？
:
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f*******e
发帖数: 354 | 17 region？你指interval？peak width?
到一定深度后不会有太多改变的，可以说越多越好，但是enough is enough，没必要浪
费钱，还不如多几个重复
: 是不是region的范围大一些？
【在 e*********6 的大作中提到】
: 是不是region的范围大一些？
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B*****U
发帖数: 38 | 18 不觉得有泛泛的数量级
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3431496/figure/F3/
QC的话follow这篇文章也是不错的
【在 j*********g 的大作中提到】
: 当然取决于细胞系和target蛋白。
: 但是泛泛而言，数量级一般是多少？
: 比如组蛋白修饰，十万？一万？
: 转录因子，一万？两千？五百？
: 谢谢！
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