j*********g 发帖数: 463 | 1 当然取决于细胞系和target蛋白。
但是泛泛而言,数量级一般是多少?
比如组蛋白修饰,十万?一万?
转录因子,一万?两千?五百?
谢谢! |
r**********r 发帖数: 21 | 2 master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
一般的转录因子会少些,几千。
【在 j*********g 的大作中提到】 : 当然取决于细胞系和target蛋白。 : 但是泛泛而言,数量级一般是多少? : 比如组蛋白修饰,十万?一万? : 转录因子,一万?两千?五百? : 谢谢!
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e*********6 发帖数: 3453 | 3 请教一下peak是什么意思?
【在 j*********g 的大作中提到】 : 当然取决于细胞系和target蛋白。 : 但是泛泛而言,数量级一般是多少? : 比如组蛋白修饰,十万?一万? : 转录因子,一万?两千?五百? : 谢谢!
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a******r 发帖数: 786 | 4 protein binding region on DNA
【在 e*********6 的大作中提到】 : 请教一下peak是什么意思?
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j*********g 发帖数: 463 | 5 组蛋白修饰多少?十万?
[在 repeatmasker (repeatmarker) 的大作中提到:]
:master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
:一般的转录因子会少些,几千。 |
e*********6 发帖数: 3453 | 6 这是不是可以理解为测序到的reads的数量?
【在 a******r 的大作中提到】 : protein binding region on DNA
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f*******e 发帖数: 354 | 7 Reads数量你钱多你就狂测,到一定depth后再多也不会改变peak数量,可能peak会好
看一点吧
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量?
【在 e*********6 的大作中提到】 : 这是不是可以理解为测序到的reads的数量?
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e*********6 发帖数: 3453 | 8 是不是region的范围大一些?
【在 f*******e 的大作中提到】 : Reads数量你钱多你就狂测,到一定depth后再多也不会改变peak数量,可能peak会好 : 看一点吧 : : : 这是不是可以理解为测序到的reads的数量? :
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j*********g 发帖数: 463 | 9 当然取决于细胞系和target蛋白。
但是泛泛而言,数量级一般是多少?
比如组蛋白修饰,十万?一万?
转录因子,一万?两千?五百?
谢谢! |
r**********r 发帖数: 21 | 10 master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
一般的转录因子会少些,几千。
【在 j*********g 的大作中提到】 : 当然取决于细胞系和target蛋白。 : 但是泛泛而言,数量级一般是多少? : 比如组蛋白修饰,十万?一万? : 转录因子,一万?两千?五百? : 谢谢!
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e*********6 发帖数: 3453 | 11 请教一下peak是什么意思?
【在 j*********g 的大作中提到】 : 当然取决于细胞系和target蛋白。 : 但是泛泛而言,数量级一般是多少? : 比如组蛋白修饰,十万?一万? : 转录因子,一万?两千?五百? : 谢谢!
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a******r 发帖数: 786 | 12 protein binding region on DNA
【在 e*********6 的大作中提到】 : 请教一下peak是什么意思?
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j*********g 发帖数: 463 | 13 组蛋白修饰多少?十万?
[在 repeatmasker (repeatmarker) 的大作中提到:]
:master regulator一般在一两万以上。组蛋白修饰比这个多一些。
:一般的转录因子会少些,几千。 |
e*********6 发帖数: 3453 | 14 这是不是可以理解为测序到的reads的数量?
【在 a******r 的大作中提到】 : protein binding region on DNA
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f*******e 发帖数: 354 | 15 Reads数量你钱多你就狂测,到一定depth后再多也不会改变peak数量,可能peak会好
看一点吧
: 这是不是可以理解为测序到的reads的数量?
【在 e*********6 的大作中提到】 : 这是不是可以理解为测序到的reads的数量?
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e*********6 发帖数: 3453 | 16 是不是region的范围大一些?
【在 f*******e 的大作中提到】 : Reads数量你钱多你就狂测,到一定depth后再多也不会改变peak数量,可能peak会好 : 看一点吧 : : : 这是不是可以理解为测序到的reads的数量? :
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f*******e 发帖数: 354 | 17 region?你指interval?peak width?
到一定深度后不会有太多改变的,可以说越多越好,但是enough is enough,没必要浪
费钱,还不如多几个重复
: 是不是region的范围大一些?
【在 e*********6 的大作中提到】 : 是不是region的范围大一些?
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B*****U 发帖数: 38 | 18 不觉得有泛泛的数量级
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3431496/figure/F3/
QC的话follow这篇文章也是不错的
【在 j*********g 的大作中提到】 : 当然取决于细胞系和target蛋白。 : 但是泛泛而言,数量级一般是多少? : 比如组蛋白修饰,十万?一万? : 转录因子,一万?两千?五百? : 谢谢!
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