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Biology版 - 感叹生物科技最近进步更快
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话题: 生物话题: chip话题: seq话题: 感叹话题: 最近
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1 (共1页)
m*********t
发帖数: 480
1
最近做个seminar类似的东西,要给系里完全CS出身教授讲我的研究,做一些文献调研
了解一下大背景,真是感叹生物技术发展真快。
在不到10年前,我们对基因的non coding region一无所知,对为什么细胞会从同一个
染色体出来不同的性质,完全不了解。
现在,随着Chip-Seq,Hi-C等技术的发展,整个DNA上的三维结构,各种蛋白质的结合
,现在都基本有个大概的了解了,下一步,随着这批数据进一步的积累,可能突破就在
未来几年。
看看Toronto的Frey, UW的Noble或者Stanford的Anshul做的各种东西,尽管现在大部
分在Epigenetics上还是比较初级,但是还是很令人激动的。最近又有互联网泡沫的刺
激,各种信息的研究工具,尤其是deep learning的发展,非常迅速,可能未来几年会
有大的突破,大家一定要有信心,不要在唉声叹气了。
j*********g
发帖数: 463
2
不错。怎么不提MIT的Kellis,写了ChromHMM?
用machine learning注释染色体,很好。

【在 m*********t 的大作中提到】
: 最近做个seminar类似的东西,要给系里完全CS出身教授讲我的研究,做一些文献调研
: 了解一下大背景,真是感叹生物技术发展真快。
: 在不到10年前,我们对基因的non coding region一无所知,对为什么细胞会从同一个
: 染色体出来不同的性质,完全不了解。
: 现在,随着Chip-Seq,Hi-C等技术的发展,整个DNA上的三维结构,各种蛋白质的结合
: ,现在都基本有个大概的了解了,下一步,随着这批数据进一步的积累,可能突破就在
: 未来几年。
: 看看Toronto的Frey, UW的Noble或者Stanford的Anshul做的各种东西,尽管现在大部
: 分在Epigenetics上还是比较初级,但是还是很令人激动的。最近又有互联网泡沫的刺
: 激,各种信息的研究工具,尤其是deep learning的发展,非常迅速,可能未来几年会

S**********e
发帖数: 1789
3
没人否认生物技术的进步,但跟学生物的待遇提高,工作机会增加没有关系。更多学计
算机的可以到生物口来抢点饭吃了。
学物理的,数学的,计算机的,化学的都可以到生物口来了,生物的去哪都没饭吃。就
算癌症治好了,人的寿命延长了20年,依然没法解决生物人的就业问题。
你是生物界的马工,不算真正学生物的,你不懂生物人的困境。大部分生物人只会做
western,养细胞,养老鼠,连基本的统计都不懂,更别说编程了。如果生物人会编程,
懂统计,你们生信的就快失业了。

【在 m*********t 的大作中提到】
: 最近做个seminar类似的东西,要给系里完全CS出身教授讲我的研究,做一些文献调研
: 了解一下大背景,真是感叹生物技术发展真快。
: 在不到10年前,我们对基因的non coding region一无所知,对为什么细胞会从同一个
: 染色体出来不同的性质,完全不了解。
: 现在,随着Chip-Seq,Hi-C等技术的发展,整个DNA上的三维结构,各种蛋白质的结合
: ,现在都基本有个大概的了解了,下一步,随着这批数据进一步的积累,可能突破就在
: 未来几年。
: 看看Toronto的Frey, UW的Noble或者Stanford的Anshul做的各种东西,尽管现在大部
: 分在Epigenetics上还是比较初级,但是还是很令人激动的。最近又有互联网泡沫的刺
: 激,各种信息的研究工具,尤其是deep learning的发展,非常迅速,可能未来几年会

e*******o
发帖数: 4654
4
所以要转cs
这些领域更需要cs技能

【在 m*********t 的大作中提到】
: 最近做个seminar类似的东西,要给系里完全CS出身教授讲我的研究,做一些文献调研
: 了解一下大背景,真是感叹生物技术发展真快。
: 在不到10年前,我们对基因的non coding region一无所知,对为什么细胞会从同一个
: 染色体出来不同的性质,完全不了解。
: 现在,随着Chip-Seq,Hi-C等技术的发展,整个DNA上的三维结构,各种蛋白质的结合
: ,现在都基本有个大概的了解了,下一步,随着这批数据进一步的积累,可能突破就在
: 未来几年。
: 看看Toronto的Frey, UW的Noble或者Stanford的Anshul做的各种东西,尽管现在大部
: 分在Epigenetics上还是比较初级,但是还是很令人激动的。最近又有互联网泡沫的刺
: 激,各种信息的研究工具,尤其是deep learning的发展,非常迅速,可能未来几年会

m*********t
发帖数: 480
5
产生高通量的数据,照样需要养细胞,然后才能后处理测序啊

【在 S**********e 的大作中提到】
: 没人否认生物技术的进步,但跟学生物的待遇提高,工作机会增加没有关系。更多学计
: 算机的可以到生物口来抢点饭吃了。
: 学物理的,数学的,计算机的,化学的都可以到生物口来了,生物的去哪都没饭吃。就
: 算癌症治好了,人的寿命延长了20年,依然没法解决生物人的就业问题。
: 你是生物界的马工,不算真正学生物的,你不懂生物人的困境。大部分生物人只会做
: western,养细胞,养老鼠,连基本的统计都不懂,更别说编程了。如果生物人会编程,
: 懂统计,你们生信的就快失业了。

m*********t
发帖数: 480
6
这玩意是个典型的中间方案,数据太杂,又没有更下游的结果,只能出个这种中间结果
了。以后这种Chip seq数据可以有了明确的用途,就不在需要这种中间数据了

【在 j*********g 的大作中提到】
: 不错。怎么不提MIT的Kellis,写了ChromHMM?
: 用machine learning注释染色体,很好。

j*********g
发帖数: 463
7
什么明确用途

:这玩意是个典型的中间方案,数据太杂,又没有更下游的结果,只能出个这种中间结
果了。以后这种Chip seq数据可以有了明确的用途,就不在需要这种中间数据了

【在 m*********t 的大作中提到】
: 这玩意是个典型的中间方案,数据太杂,又没有更下游的结果,只能出个这种中间结果
: 了。以后这种Chip seq数据可以有了明确的用途,就不在需要这种中间数据了

m*********t
发帖数: 480
8
比如直接可以用于病理诊断之类的

【在 j*********g 的大作中提到】
: 什么明确用途
:
: :这玩意是个典型的中间方案,数据太杂,又没有更下游的结果,只能出个这种中间结
: 果了。以后这种Chip seq数据可以有了明确的用途,就不在需要这种中间数据了

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新手求教, 大家用哪个genome browser看别人publish的Chip-Seq data?CHiP seq
问一下,大家都用哪个chip Protocol或者Chip kit做表达量不高的transcription factor 的Chip/Chip-SEqPostdoc position in Molecular Genetics/Epigenetics, 老板又牛又好的
chip-Seq大家都在哪个公司做啊?active motif太贵了真心求教:关于CHIP-Seq library 的数据分析问题
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Chip-seq 实验球助求推荐做Chip-Seq的tag
怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙求助:请牛人指点 Chip-Seq !!!
Chip-Seq 样品制备求助请问在哪个网站可以查到别人发表的CHiP-Seq DATA
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