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Biology版 - Mitbbs水平挺高的,纯从科学家角度质疑韩春雨
相关主题
纯从science角度分析一下韩春雨的文章韩春雨论文被撤,新的基因编辑技术还会出现吗?
韩春雨NgAgo的Nature Biotechnology存在篡改结果科学不端行为看看老外怎么评价韩春雨的NgAgo
韩春雨的电话录音韩教授这个发现能得诺贝尔奖吗
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?重复韩春雨的工作,测序也不是标准
河北新闻网:“科研英雄”背后社会舆论的悲哀这个NgAgo培训班有没有开办?
自然》:韩春雨已找到别人无法重复其实验原因 (转载)附:目前公开声明未能重复实验的部分课题组名单
中央用人不疑,《自然》获得韩春雨实验可重复性新数据韩春雨NgAgo基因编辑技术可重复性引质疑zz
造假吹牛?曾被譽諾獎級別 韓春雨撤稿走下神壇上海神经所仇子龙实验室可以重复出韩春雨的工作
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话题: ngago话题: 春雨话题: 论文话题: ago话题: 细胞
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m****s
发帖数: 18160
1
2016年5月2日,英国《自然》杂志子刊《自然 生物技术》刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所谓基因组编辑技术,就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序列。
http://tv.cctv.com/2017/05/20/VIDEBZRf7rQNg2Y1ExpBhpQM170520.shtml
一、学界和媒体的热议Mitbbs.com
一年前,英国《自然生物技术》杂志刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文。论文的负责人"一鸣惊人",得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属期刊上发表论文,通常表明,该科研成果走在了世界科学研究的最前沿,并有可能对未来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出,在站内引起站内相关专业人士的热议。
国内科研水平不得了了,河北科技大学在Nature Biotechnoligy发表重要成果
http://mitbbs.com/article_t/Faculty/31803583.html
感觉韩春雨做科研的境界比颜宁高
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32019973.html
二、实验结果被质疑
1.一般来说Ago蛋白C端加tag,无论是来自于那个物种,蛋白就没有活性了,主要由Ago蛋白自身结构folding决定。文中用的几个construct,好像只有1-2个C端是没有tag的。那么,用C端带tag的Ago作出的实验,是否有意义呢?当然,不能够排除NgAgo本身特殊,能够tolerate C端tag,只是从预测的结构上讲,可能性很小。
2.Ago催化酶切的核心domain实际是一个RNaseH fold,催化cleavage时应该结合双链(无论DNA或RNA),而双链其中一个是guide,另外一个是target。我无法想象gDNAguided NgAgo是如何切割双链DNA的。文章开始用2个guide,也许还有些道理(说不定细胞DNA会有瞬时的单链状态);后来直接上一个guide也能行,确实比较神奇。当然,不能够排除NgAgo本身特殊,就是能够切双链,只是从其类似蛋白结构上讲,可能性很小。
3.文章说如果同时转入Ago表达质粒和gDNA,就能行。如果先转Ago质粒,8小时候再转gDNA,就不行。这里我无法理解。难道先转Ago质粒8小时候,这个质粒就不表达了?如果继续表达,那8小时候再加gDNA跟同时一起转细胞又有什么区别呢?难道transfection效率太低,以至于2次transfect的东西无法进入同一细胞,因而不行?至少从这个角度来讲,文章的一个主要figure的结果有点奇怪。
4. Minor points:文章用bacteria codon 的construct在真核细胞表达蛋白,能有表达真心不容易。如果用humanized codon,效果岂不更好?文末作者declare nofinancial interest,如果这个东西将来有大用途了,还不能有专利呀,太失策了。
纯从science角度分析一下韩春雨的文章
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32021669.html
韩春雨的NgAgo效率怎么样?有人试过么?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32022589.html
韩春雨的NgAgo版上同志们进展如何
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025033.html
方舟子:韩春雨"诺贝尔奖级"实验的重复性问题. 附韩答复
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32026229.html
Ng-Ago 重复进展(集合贴)
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025503.html
三、重复证明结果
一位朋友最近在和韩老师交流,他只上国内虎扑不上MITBBS,所以我征得他同意发到这里,希望对正在重复这个实验的各位有所帮助。
for 24 well plate, 300ng NgAgo expression plasmid, 30-40ng GFP-N1, 200-500ng 5'P ssDNA guide----co-transfection. after 24 hours, detect GFP expressionunder fluorescnet microscopy. do not use electric trasnfection. NgAgo canremove 24bp from target, we suggest you do silver stain PAGE to observ T7E1results; the "Protocol of NgAgo/gDNA-mediated genome editing and examination(T7E1 assay) and a representative experiment" in ONLINE METHODS is veryhelpful! good luck!
韩春雨老师给的实验建议
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025735.html
韩春雨在985贴吧发言了?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32025929.html
韩春雨说的可控的事情可否理解为可以操控?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32027677.html
四、实验带来的疑问
国内知识产权形势比较复杂,自我保护意识都比较强。我老自己原来博士老板,985学校,搞出来个新东西,写课题和项目的时候,特意嘱咐我师兄把关键蛋白写成别的,比如说本来是Cdc42,就给写成Cdc47。
相信我,这不是个例,在国内混的都得会这一手。当然,韩这个已经不是课题,而是发表在著名公共期刊上的文章了,肯定不能写错太明显,那么很可能就会在一些protocol上动手脚。仅供参考。
我来说一下NgAgo
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028347.html
拜读韩春雨的论文
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028409.html
看看老外怎么评价韩春雨的NgAgo
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028447.html
NgAgo文章里Fig S4的NgAgo染色是怎么拿到的
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32028491.html
五、被质疑的科学家
到目前为止,所谓的仇子龙看到了Indel,根本无法证明那个是NgAgo引起的,有常识的做过测序的人都知道,即使你拿同一个样品去测一百遍,你肯定会在其中的少许几个测序结果中发现会有所谓的indel,这种indel不是真实的indel,而只是测序本身带有的误差(这个是很正常的,喷子喷之前请先做功课)。要想证明NgAgo具有基因组层面的编辑功能,请参照CRISPR-Cas9的检测标准。搞了这么久,韩春雨所谓的全国20个实验室重复出来,原来是这种重复结果,真的令人觉得可笑。现在应该是时候给杂志社写comment了。
韩春雨NgAgo的Nature Biotechnology存在篡改结果科学不端行为
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32029651.html
韩春雨有义务为大家释疑
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32032859.html
一个搞物理的悄悄地评论一下大家对韩春雨老师论文的争论
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32029939.html
韩文到底有没有被重复?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32030451.html
韩春雨的文章刚刚发表,有人就有看法
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32030543.html
关于韩春雨是否造假,个人看法
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32030565.html
六、实验证明
《自然》调查员戴维的访谈报告是亲自调查的结果吗?
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32043485.html
仇子龙的申明中说他们实验室用韩春雨的NgAgo在293细胞中看到测
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32070491.html
韩春雨回应质疑:对重复实验充满信心
http://mitbbs.com/article_t/Biology/32032263.html
a*******m
发帖数: 14194
2
最后再说一句,灌水的大方向肯定是货币化,不给钱,就不可能有长期
的繁荣,特别是在别的很多地方都给钱的情况下,看看微信公众号,
微博,付出都是有回报的。就算你不愿意出钱,弄个可货币化的伪币,
搞个打赏功能会死人吗?至少可以测试一下吧!
不过相比金钱而言, 对核心竞争的维护,对灌水朋友的尊重也很重要。
这么多牛逼ID都走了,你自己不想想,不写信问问都是什么原因? 怎么样
才能把他们搞回来吗?
这么多年的连续瞎胡搞,管理员像个脑残一样,结果是什么,自己看到了吧。
以前不少人给你提建议,不管好听,难听,基本是好心吧,结果你听就算了,
还忙着删帖封人,真是醉了!
a*******m
发帖数: 14194
3
当然老邢还是有点理想的,言论比较自由,让大家随便说,这一点beat国内
大多数网站,也不算是坏人。
你这个宣传贴,我看至少可以置顶一个月!
不用谢了,走了!
c********6
发帖数: 693
4
稍微有一丁点科学常识的人都不会介意你对于一个发现的评论。
但是很奇怪的是,当时大家在评论韩春雨的这个NgAgo的时候,大量的水军在后面跟帖
讽刺挖苦,或许不能叫做水军,很有可能是拥有国内三流四流大学背景没有接受过正规
科研训练的人,这个很不正常。更不正常的是这个NgAgo已经被认定为无法重复的时候
,韩春雨居然还能够继续保留自己的实验室自己的2.24亿基金。让说什么好呢?

编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获
得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化
出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所
谓基因组编辑技术,就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序
列。
文的负责人"一鸣惊人",得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属
期刊上发表论文,通常表明,该科研成果走在了世界科学研究的最前沿,并有可能对未
来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出,在站内引起站内相关专业人士的
热议。

【在 m****s 的大作中提到】
: 2016年5月2日,英国《自然》杂志子刊《自然 生物技术》刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所谓基因组编辑技术,就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序列。
: http://tv.cctv.com/2017/05/20/VIDEBZRf7rQNg2Y1ExpBhpQM170520.shtml
: 一、学界和媒体的热议Mitbbs.com
: 一年前,英国《自然生物技术》杂志刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文。论文的负责人"一鸣惊人",得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属期刊上发表论文,通常表明,该科研成果走在了世界科学研究的最前沿,并有可能对未来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出,在站内引起站内相关专业人士的热议。
: 国内科研水平不得了了,河北科技大学在Nature Biotechnoligy发表重要成果
: http://mitbbs.com/article_t/Faculty/31803583.html
: 感觉韩春雨做科研的境界比颜宁高
: http://mitbbs.com/article_t/Biology/32019973.html
: 二、实验结果被质疑
: 1.一般来说Ago蛋白C端加tag,无论是来自于那个物种,蛋白就没有活性了,主要由Ago蛋白自身结构folding决定。文中用的几个construct,好像只有1-2个C端是没有tag的。那么,用C端带tag的Ago作出的实验,是否有意义呢?当然,不能够排除NgAgo本身特殊,能够tolerate C端tag,只是从预测的结构上讲,可能性很小。

c****a
发帖数: 134
5
不错,有思想
h********x
发帖数: 1043
6
有后续的跟踪调查了吗?
e*******o
发帖数: 4654
7
你真替老邢操心。
mitbbs 死了,还有其它的论坛,何必呢

【在 a*******m 的大作中提到】
: 最后再说一句,灌水的大方向肯定是货币化,不给钱,就不可能有长期
: 的繁荣,特别是在别的很多地方都给钱的情况下,看看微信公众号,
: 微博,付出都是有回报的。就算你不愿意出钱,弄个可货币化的伪币,
: 搞个打赏功能会死人吗?至少可以测试一下吧!
: 不过相比金钱而言, 对核心竞争的维护,对灌水朋友的尊重也很重要。
: 这么多牛逼ID都走了,你自己不想想,不写信问问都是什么原因? 怎么样
: 才能把他们搞回来吗?
: 这么多年的连续瞎胡搞,管理员像个脑残一样,结果是什么,自己看到了吧。
: 以前不少人给你提建议,不管好听,难听,基本是好心吧,结果你听就算了,
: 还忙着删帖封人,真是醉了!

f****y
发帖数: 13
8
老韩还在煮熟的鸭子,就是想逃避造假惩罚。早认错还能往作实验的学生身上推,现在
是没得退了。这种让他逃了,以后造假会更明目张胆。
最简单就是让他寄一盘NgAgo编辑后的细胞,大家帮他测序。全世界的细胞都可能支原
体或未知菌污染,但测序仪不会污染吧?什么?实验室没经费,液氮罐坏了,细胞没有
了。那你声称分分秒秒的可以重复,那就再作一个。

编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获
得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化
出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所
谓基因组编辑技术,就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序
列。
文的负责人"一鸣惊人",得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属
期刊上发表论文,通常表明,该科研成果走在了世界科学研究的最前沿,并有可能对未
来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出,在站内引起站内相关专业人士的
热议。

【在 m****s 的大作中提到】
: 2016年5月2日,英国《自然》杂志子刊《自然 生物技术》刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所谓基因组编辑技术,就是人为来调整、改变、插入、去除、修改个体或物种的基因组序列。
: http://tv.cctv.com/2017/05/20/VIDEBZRf7rQNg2Y1ExpBhpQM170520.shtml
: 一、学界和媒体的热议Mitbbs.com
: 一年前,英国《自然生物技术》杂志刊载了一篇有关"基因编辑工具"的论文。论文的负责人"一鸣惊人",得到了学界和媒体给予的无限荣光。在《自然》杂志社的所属期刊上发表论文,通常表明,该科研成果走在了世界科学研究的最前沿,并有可能对未来科学的发展起到关键性作用。此消息一经媒体爆出,在站内引起站内相关专业人士的热议。
: 国内科研水平不得了了,河北科技大学在Nature Biotechnoligy发表重要成果
: http://mitbbs.com/article_t/Faculty/31803583.html
: 感觉韩春雨做科研的境界比颜宁高
: http://mitbbs.com/article_t/Biology/32019973.html
: 二、实验结果被质疑
: 1.一般来说Ago蛋白C端加tag,无论是来自于那个物种,蛋白就没有活性了,主要由Ago蛋白自身结构folding决定。文中用的几个construct,好像只有1-2个C端是没有tag的。那么,用C端带tag的Ago作出的实验,是否有意义呢?当然,不能够排除NgAgo本身特殊,能够tolerate C端tag,只是从预测的结构上讲,可能性很小。

P****R
发帖数: 22479
9
中国都是韩春雨这种包子人物,就不会有中国威胁了。

【在 c********6 的大作中提到】
: 稍微有一丁点科学常识的人都不会介意你对于一个发现的评论。
: 但是很奇怪的是,当时大家在评论韩春雨的这个NgAgo的时候,大量的水军在后面跟帖
: 讽刺挖苦,或许不能叫做水军,很有可能是拥有国内三流四流大学背景没有接受过正规
: 科研训练的人,这个很不正常。更不正常的是这个NgAgo已经被认定为无法重复的时候
: ,韩春雨居然还能够继续保留自己的实验室自己的2.24亿基金。让说什么好呢?
:
: 编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获
: 得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
: 医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化
: 出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所

a**********u
发帖数: 28450
10
我不能理解他,无论是从开始造假到被质询的反应到现在的态度。不晓得是今日令中第
一人出类拔萃与众不同,还是禽兽之变诈几何哉止增笑耳?

【在 f****y 的大作中提到】
: 老韩还在煮熟的鸭子,就是想逃避造假惩罚。早认错还能往作实验的学生身上推,现在
: 是没得退了。这种让他逃了,以后造假会更明目张胆。
: 最简单就是让他寄一盘NgAgo编辑后的细胞,大家帮他测序。全世界的细胞都可能支原
: 体或未知菌污染,但测序仪不会污染吧?什么?实验室没经费,液氮罐坏了,细胞没有
: 了。那你声称分分秒秒的可以重复,那就再作一个。
:
: 编辑工具"的论文,论文负责人的英文署名是"Chunyu Han",这篇论文在华人生物界获
: 得广泛赞誉。论文发表的第二天,韩春雨的名字和论文在一个名为"生物艺术全球生物
: 医学交流"的微信群里得到了热烈讨论。生命体从受精卵开始,经过不断分裂,可分化
: 出大约60兆亿个构建人类身体的细胞,每个细胞都含有全部生命遗传信息的基因组,所

j******i
发帖数: 939
11
老韩把科学的上争论上升到了哲学上的争论。只有他能做出来,你们都做不出来,这在
哲学上没错吧?
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纯从science角度分析一下韩春雨的文章韩春雨论文被撤,新的基因编辑技术还会出现吗?
韩春雨NgAgo的Nature Biotechnology存在篡改结果科学不端行为看看老外怎么评价韩春雨的NgAgo
韩春雨的电话录音韩教授这个发现能得诺贝尔奖吗
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?重复韩春雨的工作,测序也不是标准
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