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Biology版 - CRISPR screening筛选到不足1000个细胞 怎么解?
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话题: 细胞话题: crispr话题: 1000话题: screening话题: 筛选
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j******i
发帖数: 939
1
有个CRISPR screening课题 感染library后 细胞加药筛选 确实有1000个左右的细胞能
活下来 但是活下来的细胞也长不了了 这1000个细胞怎么做二代测序好呢
D****g
发帖数: 275
2
Single cell RNA seq?
c**i
发帖数: 265
3
药是不是加太多了,少加点,之后还要做duplicate和统计分析。

【在 j******i 的大作中提到】
: 有个CRISPR screening课题 感染library后 细胞加药筛选 确实有1000个左右的细胞能
: 活下来 但是活下来的细胞也长不了了 这1000个细胞怎么做二代测序好呢

j*********g
发帖数: 463
4
他是要测DNA,基因组上的barcode
1000个细胞不能测吗?不就把带barcode的片段PCR扩增出来么。

【在 D****g 的大作中提到】
: Single cell RNA seq?
d****u
发帖数: 1553
5
不知道你这个setting为啥要只留下这么少的细胞。最简单的办法就是再做一遍,把
representation扩大1000倍。这样你就应该有1M的细胞,足够了。
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