z*******x
发帖数: 103 | 1 别人想跳出生物，我是自愿跳入。
今天在读近期Cell 上的一篇tcga 文章。文章提到Hippo pathway 并给出
Pahtwaymapper 网站，结果发现那里的Hippo pathway 压根就不是文章中提到的。
这就是生物学家的态度呀？Cell 不是第一期刊吗？
从去年开始看Cancer 的文章，以前陆陆续续的看了一些有关信号转导的文章。
我发现这行里的生物学家跟本没有想把问题搞清楚。这是我观察的几个现象：
1。一个信号通道有的文章画的很复杂，有的文章就几个蛋白，几个link。 有没有标准？
2。TP53 很重要，那么为什么PUBpeer 上还有几百篇有关TP53（p53) 文章备受质疑而
没有出来澄清？
3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
论是错的，不更好吗？ 难道没有顶天立地的大牛敢作这个？
4。一个基因/蛋白几个名字。这个由于历史原因可以理解。现在大部分model 物种已经
测序，统一名字不更好吗？ 为什么生物学家不做这个？
5。 一个数学博士在5年学习期间只能发1，2 个论文即可。一个一流数学家叫望月新一
。 几年前声称解决了ABC猜想。 3，4年已过，没人读懂就是不能正式发表/
为啥生物学家急吼吼的发表错的东西。为什么不向数学家学习？
凭什么生物学方面的学生要发那么个多才有工作？
这不是给造垃圾文章的提供不良环境吗？ |
T****i
发帖数: 15191 | 2 欢迎跳进生物坑。
准？
【在 z*******x 的大作中提到】
: 别人想跳出生物，我是自愿跳入。
: 今天在读近期Cell 上的一篇tcga 文章。文章提到Hippo pathway 并给出
: Pahtwaymapper 网站，结果发现那里的Hippo pathway 压根就不是文章中提到的。
: 这就是生物学家的态度呀？Cell 不是第一期刊吗？
: 从去年开始看Cancer 的文章，以前陆陆续续的看了一些有关信号转导的文章。
: 我发现这行里的生物学家跟本没有想把问题搞清楚。这是我观察的几个现象：
: 1。一个信号通道有的文章画的很复杂，有的文章就几个蛋白，几个link。 有没有标准？
: 2。TP53 很重要，那么为什么PUBpeer 上还有几百篇有关TP53（p53) 文章备受质疑而
: 没有出来澄清？
: 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
|
k***b
发帖数: 181 | 3 因为没人能行,大家只能这么干了，不然你来试试，保证你诺奖拿到手软 |
S**********e
发帖数: 1789 | 4 想做癌症就要接受现实，现实很残酷。大部分故事都是骗人的。受不了了就跳出去。
我们现在跟一个大牛合作，筛选激酶抑制剂。我做的这个以前有几篇报道，最好的发在
nature大子刊上。我接手以后发现文章报道的肿瘤细胞根本不表达这个蛋白，抗体是不
特异的。找不到肿瘤表达此蛋白，但工作仍在继续，文章可能发表在NCS子刊。抑制剂
也不特异，失掉功能集团的抑制剂仍然有效果。我把我发现的都告诉老板了，老板视而
不见，该干嘛还干嘛。这个圈子的人是没有底线的。
准？
【在 z*******x 的大作中提到】
: 别人想跳出生物，我是自愿跳入。
: 今天在读近期Cell 上的一篇tcga 文章。文章提到Hippo pathway 并给出
: Pahtwaymapper 网站，结果发现那里的Hippo pathway 压根就不是文章中提到的。
: 这就是生物学家的态度呀？Cell 不是第一期刊吗？
: 从去年开始看Cancer 的文章，以前陆陆续续的看了一些有关信号转导的文章。
: 我发现这行里的生物学家跟本没有想把问题搞清楚。这是我观察的几个现象：
: 1。一个信号通道有的文章画的很复杂，有的文章就几个蛋白，几个link。 有没有标准？
: 2。TP53 很重要，那么为什么PUBpeer 上还有几百篇有关TP53（p53) 文章备受质疑而
: 没有出来澄清？
: 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
|
b******g
发帖数: 20 | 5 哈哈哈，生物传导这个烂坑，二十年前是个富矿，现在都是矿渣。
信号传导就是做分钟Western, 常规抗体早就把能做的做完了，现在都是磷酸化、乙酰
化什么的乱七八糟抗体了
P53 是所有做信号转导的人的噩梦，本身极低含量，数不清的上游通路都会影响这个蛋
白的丰度，做P53的 western，做一次一个结果，你都根本不可能知道是什么原因。你
实验室本科生这周多开了两次培养箱的门都有可能让你的P53 western结果不一样 |
L****8
发帖数: 3938 | 6 盲人摸象 复杂网络
【在 b******g 的大作中提到】
: 哈哈哈，生物传导这个烂坑，二十年前是个富矿，现在都是矿渣。
: 信号传导就是做分钟Western, 常规抗体早就把能做的做完了，现在都是磷酸化、乙酰
: 化什么的乱七八糟抗体了
: P53 是所有做信号转导的人的噩梦，本身极低含量，数不清的上游通路都会影响这个蛋
: 白的丰度，做P53的 western，做一次一个结果，你都根本不可能知道是什么原因。你
: 实验室本科生这周多开了两次培养箱的门都有可能让你的P53 western结果不一样
|
z*******x
发帖数: 103 | 7 从外行的角度来看， 这方面的生物学家都不是在共同基础上对话， 各说各的。
另外， 编故事不是不可以， 但你要告诉别人这是假设， 或者是理论。
物理上， 好多是在假设上讨论。 提出假设， 猜想在数学上也可能有不平凡的贡献。
此外， 一篇文章连大牛都没法拍胸脯是对是错也是一个奇怪的现像。 这是癌症研究不
容易check的原因
【在 S**********e 的大作中提到】
: 想做癌症就要接受现实，现实很残酷。大部分故事都是骗人的。受不了了就跳出去。
: 我们现在跟一个大牛合作，筛选激酶抑制剂。我做的这个以前有几篇报道，最好的发在
: nature大子刊上。我接手以后发现文章报道的肿瘤细胞根本不表达这个蛋白，抗体是不
: 特异的。找不到肿瘤表达此蛋白，但工作仍在继续，文章可能发表在NCS子刊。抑制剂
: 也不特异，失掉功能集团的抑制剂仍然有效果。我把我发现的都告诉老板了，老板视而
: 不见，该干嘛还干嘛。这个圈子的人是没有底线的。
:
: 准？
|
S****8
发帖数: 1 | 8 理解。
【在 S**********e 的大作中提到】
: 想做癌症就要接受现实，现实很残酷。大部分故事都是骗人的。受不了了就跳出去。
: 我们现在跟一个大牛合作，筛选激酶抑制剂。我做的这个以前有几篇报道，最好的发在
: nature大子刊上。我接手以后发现文章报道的肿瘤细胞根本不表达这个蛋白，抗体是不
: 特异的。找不到肿瘤表达此蛋白，但工作仍在继续，文章可能发表在NCS子刊。抑制剂
: 也不特异，失掉功能集团的抑制剂仍然有效果。我把我发现的都告诉老板了，老板视而
: 不见，该干嘛还干嘛。这个圈子的人是没有底线的。
:
: 准？
|
P****R
发帖数: 22479 | 9 测不准理论
【在 b******g 的大作中提到】
: 哈哈哈，生物传导这个烂坑，二十年前是个富矿，现在都是矿渣。
: 信号传导就是做分钟Western, 常规抗体早就把能做的做完了，现在都是磷酸化、乙酰
: 化什么的乱七八糟抗体了
: P53 是所有做信号转导的人的噩梦，本身极低含量，数不清的上游通路都会影响这个蛋
: 白的丰度，做P53的 western，做一次一个结果，你都根本不可能知道是什么原因。你
: 实验室本科生这周多开了两次培养箱的门都有可能让你的P53 western结果不一样
|
C*********X
发帖数: 10518 | 10 做学问是很奢侈的。。。。
希望能有体制，让人既可以谋生，也可以进行这个奢侈的活动。。。。
【在 b******g 的大作中提到】
: 哈哈哈，生物传导这个烂坑，二十年前是个富矿，现在都是矿渣。
: 信号传导就是做分钟Western, 常规抗体早就把能做的做完了，现在都是磷酸化、乙酰
: 化什么的乱七八糟抗体了
: P53 是所有做信号转导的人的噩梦，本身极低含量，数不清的上游通路都会影响这个蛋
: 白的丰度，做P53的 western，做一次一个结果，你都根本不可能知道是什么原因。你
: 实验室本科生这周多开了两次培养箱的门都有可能让你的P53 western结果不一样
|
|
|
P****R
发帖数: 22479 | 11 少招生即可。
【在 C*********X 的大作中提到】
: 做学问是很奢侈的。。。。
: 希望能有体制，让人既可以谋生，也可以进行这个奢侈的活动。。。。
|
d********m
发帖数: 3662 | |
x****6
发帖数: 4339 | 13 应该是主力吧
信号转导不是细胞生物学里的主力分支吗？
癌症不是生物力的主力分支吗？
【在 d********m 的大作中提到】
: 版上有人在癌症信号转导这个烂坑里的吗
|
S**********e
发帖数: 1789 | 14 做癌症的主要就是做信号转导，说白了就是编故事。最终结果没人关心。
【在 d********m 的大作中提到】
: 版上有人在癌症信号转导这个烂坑里的吗
|
a*********n
发帖数: 2526 | 15 去药厂工作吧，起码data不会造假
准？
【在 z*******x 的大作中提到】
: 别人想跳出生物，我是自愿跳入。
: 今天在读近期Cell 上的一篇tcga 文章。文章提到Hippo pathway 并给出
: Pahtwaymapper 网站，结果发现那里的Hippo pathway 压根就不是文章中提到的。
: 这就是生物学家的态度呀？Cell 不是第一期刊吗？
: 从去年开始看Cancer 的文章，以前陆陆续续的看了一些有关信号转导的文章。
: 我发现这行里的生物学家跟本没有想把问题搞清楚。这是我观察的几个现象：
: 1。一个信号通道有的文章画的很复杂，有的文章就几个蛋白，几个link。 有没有标准？
: 2。TP53 很重要，那么为什么PUBpeer 上还有几百篇有关TP53（p53) 文章备受质疑而
: 没有出来澄清？
: 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
|
d********m
发帖数: 3662 | 16 隔壁系有个朋友p53做的骂娘，我看着都心疼，五年千老了
【在 x****6 的大作中提到】
: 应该是主力吧
: 信号转导不是细胞生物学里的主力分支吗？
: 癌症不是生物力的主力分支吗？
|
d********m
发帖数: 3662 | 17 这个东西必须往系统方向上发展了，比如和network theory的人合作好好设计实验做
sensitivity analysis。
召唤xiao86童鞋评论下
【在 S**********e 的大作中提到】
: 做癌症的主要就是做信号转导，说白了就是编故事。最终结果没人关心。
|
x****6
发帖数: 4339 | 18 癌症这东西太复杂。而且每种癌症都有自己的鲜明特点、相互都不一样。
去年华大基因大规模的测量多种癌症的序列，发现突变基本上是随机的，没有规律可言
。平均一个癌细胞上百个突变。这些突变中的子集决定了癌细胞在遗传上和正常细胞不
同，生长不受控制，行为也变得乖张。
从癌细胞凌乱、无规律的突变来看，我觉得与其去研究癌症本身的机制，还不如把有限
的资源用来
1. 研究早期诊断癌症的方法
2. 研究如何对免疫系统进行精确和有效的控制，加强免疫系统对癌症组织细胞的清楚。
【在 d********m 的大作中提到】
: 这个东西必须往系统方向上发展了，比如和network theory的人合作好好设计实验做
: sensitivity analysis。
: 召唤xiao86童鞋评论下
|
d********m
发帖数: 3662 | 19 我是来扯淡的你又正儿八经回一大堆，搞得我都不知道怎么回
楚。
【在 x****6 的大作中提到】
: 癌症这东西太复杂。而且每种癌症都有自己的鲜明特点、相互都不一样。
: 去年华大基因大规模的测量多种癌症的序列，发现突变基本上是随机的，没有规律可言
: 。平均一个癌细胞上百个突变。这些突变中的子集决定了癌细胞在遗传上和正常细胞不
: 同，生长不受控制，行为也变得乖张。
: 从癌细胞凌乱、无规律的突变来看，我觉得与其去研究癌症本身的机制，还不如把有限
: 的资源用来
: 1. 研究早期诊断癌症的方法
: 2. 研究如何对免疫系统进行精确和有效的控制，加强免疫系统对癌症组织细胞的清楚。
|
x****6
发帖数: 4339 | 20 我在业务版还是尽量保持专业一点。在菌斑尽扯淡了
【在 d********m 的大作中提到】
: 我是来扯淡的你又正儿八经回一大堆，搞得我都不知道怎么回
:
: 楚。
|
|
|
M*P
发帖数: 6456 | 21 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
论是错的，不更好吗？ 难道没有顶天立地的大牛敢作这个？
因为没任何人知道哪个是定理，哪个是假设，哪个结论是错的。这个不是小学中学上课
，1＋1=2，结论就告诉你错不了。
准？
【在 z*******x 的大作中提到】
: 别人想跳出生物，我是自愿跳入。
: 今天在读近期Cell 上的一篇tcga 文章。文章提到Hippo pathway 并给出
: Pahtwaymapper 网站，结果发现那里的Hippo pathway 压根就不是文章中提到的。
: 这就是生物学家的态度呀？Cell 不是第一期刊吗？
: 从去年开始看Cancer 的文章，以前陆陆续续的看了一些有关信号转导的文章。
: 我发现这行里的生物学家跟本没有想把问题搞清楚。这是我观察的几个现象：
: 1。一个信号通道有的文章画的很复杂，有的文章就几个蛋白，几个link。 有没有标准？
: 2。TP53 很重要，那么为什么PUBpeer 上还有几百篇有关TP53（p53) 文章备受质疑而
: 没有出来澄清？
: 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
|
b******g
发帖数: 20 | 22
楚。
【在 x****6 的大作中提到】
: 癌症这东西太复杂。而且每种癌症都有自己的鲜明特点、相互都不一样。
: 去年华大基因大规模的测量多种癌症的序列，发现突变基本上是随机的，没有规律可言
: 。平均一个癌细胞上百个突变。这些突变中的子集决定了癌细胞在遗传上和正常细胞不
: 同，生长不受控制，行为也变得乖张。
: 从癌细胞凌乱、无规律的突变来看，我觉得与其去研究癌症本身的机制，还不如把有限
: 的资源用来
: 1. 研究早期诊断癌症的方法
: 2. 研究如何对免疫系统进行精确和有效的控制，加强免疫系统对癌症组织细胞的清楚。
|
P****R
发帖数: 22479 | 23 2个定理就是（1）癌症不受控制连续生长，（2）癌症发生原因是基因突变。
至于怎么解决（1），现在有抗癌药2500多种，基本无效；解决（2）简直是不可能完成
的任务。
【在 M*P 的大作中提到】
: 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
: 论是错的，不更好吗？ 难道没有顶天立地的大牛敢作这个？
: 因为没任何人知道哪个是定理，哪个是假设，哪个结论是错的。这个不是小学中学上课
: ，1＋1=2，结论就告诉你错不了。
:
: 准？
|
l******q
发帖数: 52 | 24 re这个。癌症研究如今局面跟还原论思想分不开，愿望美好，现实骨干。不夸张的说，
美国任意一家Cancer Center癌组织标本库存中包含的癌细胞克隆数远大于人类人口。
还原论妄想
穷举所有的致癌路线，无异于痴人说梦。当然，如果他们的目标根本不是寻找真理，那
就另当别论。《侏罗纪公园》里面有句名言，"Life finds a way." 癌细胞不仅是life
，而且是不同于我们人类的新物种。
楚。
【在 x****6 的大作中提到】
: 癌症这东西太复杂。而且每种癌症都有自己的鲜明特点、相互都不一样。
: 去年华大基因大规模的测量多种癌症的序列，发现突变基本上是随机的，没有规律可言
: 。平均一个癌细胞上百个突变。这些突变中的子集决定了癌细胞在遗传上和正常细胞不
: 同，生长不受控制，行为也变得乖张。
: 从癌细胞凌乱、无规律的突变来看，我觉得与其去研究癌症本身的机制，还不如把有限
: 的资源用来
: 1. 研究早期诊断癌症的方法
: 2. 研究如何对免疫系统进行精确和有效的控制，加强免疫系统对癌症组织细胞的清楚。
|
x********a
发帖数: 230 | 25 亲， 我老人家也做个火热抗癌check point配体的信号控制，Science两篇， Nature 1
篇， 小杂志无数， 没有能重复出来的。 洗洗睡吧。
准？
【在 z*******x 的大作中提到】
: 别人想跳出生物，我是自愿跳入。
: 今天在读近期Cell 上的一篇tcga 文章。文章提到Hippo pathway 并给出
: Pahtwaymapper 网站，结果发现那里的Hippo pathway 压根就不是文章中提到的。
: 这就是生物学家的态度呀？Cell 不是第一期刊吗？
: 从去年开始看Cancer 的文章，以前陆陆续续的看了一些有关信号转导的文章。
: 我发现这行里的生物学家跟本没有想把问题搞清楚。这是我观察的几个现象：
: 1。一个信号通道有的文章画的很复杂，有的文章就几个蛋白，几个link。 有没有标准？
: 2。TP53 很重要，那么为什么PUBpeer 上还有几百篇有关TP53（p53) 文章备受质疑而
: 没有出来澄清？
: 3。虽然生物是很复杂，那么在一个综述文章里告诉那个是定理，那个是假设， 那个结
|
x****6
发帖数: 4339 | 26 您现在高就?
1
【在 x********a 的大作中提到】
: 亲， 我老人家也做个火热抗癌check point配体的信号控制，Science两篇， Nature 1
: 篇， 小杂志无数， 没有能重复出来的。 洗洗睡吧。
:
: 准？
|
P****R
发帖数: 22479 | 27 that is normal.
1
【在 x********a 的大作中提到】
: 亲， 我老人家也做个火热抗癌check point配体的信号控制，Science两篇， Nature 1
: 篇， 小杂志无数， 没有能重复出来的。 洗洗睡吧。
:
: 准？
|
S****8
发帖数: 1 | 28 co ask.
【在 x****6 的大作中提到】
: 您现在高就?
:
: 1
|
P****R
发帖数: 22479 | 29
1
【在 x********a 的大作中提到】
: 亲， 我老人家也做个火热抗癌check point配体的信号控制，Science两篇， Nature 1
: 篇， 小杂志无数， 没有能重复出来的。 洗洗睡吧。
:
: 准？
|
O********T
发帖数: 9 | 30 大神。肯定是千老，了解这么多哈哈
： 哈哈哈，生物传导这个烂坑，二十年前是个富矿，现在都是矿渣。
： |
|
|
i*********0
发帖数: 915 | 31 不一定是信号转导的错。是大家都在用说故事的套路来做科研、写论文。这个套路玩着
玩着，大家都以为是在“说故事”了。 |
