s******n
发帖数: 175 | 1 最好有在不同ethnicity group里的frequency数据，不知道有这样的网站吗？谢谢。 |
i********f
发帖数: 206 | |
s******n
发帖数: 175 | 3 最好有在不同ethnicity group里的frequency数据，不知道有这样的网站吗？谢谢。 |
i********f
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s******s
发帖数: 13035 | 5 dbSNP, gnoMAD/ExAc
【在 s******n 的大作中提到】
: 最好有在不同ethnicity group里的frequency数据，不知道有这样的网站吗？谢谢。
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f*****n
发帖数: 499 | 6 直接UCSC genome browser就有
【在 s******n 的大作中提到】
: 最好有在不同ethnicity group里的frequency数据，不知道有这样的网站吗？谢谢。
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s******n
发帖数: 175 | 7 试了一下，好像还是更习惯dbSNP的界面。谢谢推荐。
【在 f*****n 的大作中提到】
: 直接UCSC genome browser就有
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s******n
发帖数: 175 | 8 很感谢上面各位的推荐。我在用dbSNP查allele frequency，里面包含了1000genomes,
ExAC and gnomAD等等，另外发现里面有个置顶的ALFA allele frequency，好像是个很
新的工具，今年三月才开始的。貌似集合了许多不同study的数据，总的sample size很
大（上万，而1000genomes的总sample size只有五千多)。但有些population的sample
size却又很小，比如我现在查的一个allele,south asian的sample size 才10， 而
1000genomes有近一千。有人懂吗？能解释一下吗？这个ALFA和1000genomes 以及 ExAC
，gnomAD有啥区别？ 谢谢。
【在 s******n 的大作中提到】
: 最好有在不同ethnicity group里的frequency数据，不知道有这样的网站吗？谢谢。
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s******s
发帖数: 13035 | 9 这儿有介绍啊，就是dbgap https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/docs/gsr/alfa/
sample
ExAC
【在 s******n 的大作中提到】
: 很感谢上面各位的推荐。我在用dbSNP查allele frequency，里面包含了1000genomes,
: ExAC and gnomAD等等，另外发现里面有个置顶的ALFA allele frequency，好像是个很
: 新的工具，今年三月才开始的。貌似集合了许多不同study的数据，总的sample size很
: 大（上万，而1000genomes的总sample size只有五千多)。但有些population的sample
: size却又很小，比如我现在查的一个allele,south asian的sample size 才10， 而
: 1000genomes有近一千。有人懂吗？能解释一下吗？这个ALFA和1000genomes 以及 ExAC
: ，gnomAD有啥区别？ 谢谢。
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