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Chemistry版 - 一个关于DFT的初级问题:
相关主题
真心求助几道本科无机试题做金属异相催化的都有哪些牛组?
问个electronic coupling的问题吧看看院士是怎么在JPCB骂人的
问一个gaussian计算的问题JPCA上面一篇比较新的骂架的文章
能否稍微修改一下CCSD的代码来计算我的这个问题?问一个Kohn-Sham DFT的问题
computational question?Vasp DFT manual
谁有introducing book on SIESTA? 介绍SIESTA 是如何执行每一块的计算?学化学挣钱很少啊
在美国哪些组使用SIESTA做密度泛函研究和应用的?求计算单个离子波函数的软件
paper help,Thanks.----- PCCPQuestion about DFT
相关话题的讨论汇总
话题: siesta话题: dft话题: planewave话题: orbital话题: 基组
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1 (共1页)
J*******3
发帖数: 1651
1
本人用SIESTA. 一个general的问题。
通常情况下,设计一个体系,假设选用了Atomic orbitals 作basis,用cutoff radius
和orbital撒数来控制计算精度。这时,那些控制planwaves 和realspace grid 的参
数们都不起作用了吗?换句话说,他们对计算没什么贡献了,对吗?
e******g
发帖数: 29
2
不对
首先,这个问题跟你用不用DFT无关,即便用HF或post-HF这个问题的表现也是一样
的。
其次,siesta的具体实现里面是没有planwave的。
然后,siesta的计算精度不仅仅是由basis orbital的cutoff radii和数目确定
的,其他的参数也对精度有影响,包括realspace grid density

radius
grid 的参

【在 J*******3 的大作中提到】
: 本人用SIESTA. 一个general的问题。
: 通常情况下,设计一个体系,假设选用了Atomic orbitals 作basis,用cutoff radius
: 和orbital撒数来控制计算精度。这时,那些控制planwaves 和realspace grid 的参
: 数们都不起作用了吗?换句话说,他们对计算没什么贡献了,对吗?

J*******3
发帖数: 1651
3
为什么? basis 的选择 通常有三个options:1) atomic orbital 2)plane wave
3) real space without basis。 他们不是平行的吗? 我的意思是一旦用其中一个
,例如说 1, 那就是说我们用 atomic orbital 同展开 KS equation,另外两个以及相
关的参数在计算过程中就被neglected? 不对吗?
e******g
发帖数: 29
4
哦,大概明白你问的什么了。。。
在siesta中并没有关于平面波展开KS轨道的功能。也没有相关参数,所以你的这个问题
貌似不是个问题。。
所谓的real space without basis,我并不熟悉,orbital free DFT应该算这一块吧?
不过这一点也跟siesta没有关系
此外,我印象中还没见过某个软件既可以用平面波基组,也可以用原子轨道基组。如果
你知道的话请告诉我,呵呵,谢谢
h********r
发帖数: 821
5
real space without basis只是计算实现方法,orbital free dft是理论框架,这个是
两回事。

【在 e******g 的大作中提到】
: 哦,大概明白你问的什么了。。。
: 在siesta中并没有关于平面波展开KS轨道的功能。也没有相关参数,所以你的这个问题
: 貌似不是个问题。。
: 所谓的real space without basis,我并不熟悉,orbital free DFT应该算这一块吧?
: 不过这一点也跟siesta没有关系
: 此外,我印象中还没见过某个软件既可以用平面波基组,也可以用原子轨道基组。如果
: 你知道的话请告诉我,呵呵,谢谢

J*******3
发帖数: 1651
6
很困惑的问:
可是一些DFT books 中叙述说: 如果是solids( 也就是说有周期性的块材) 通常是
用planewave 作基的?难道不是么?
如果SIESTa,中没有涉及到 planewave,也就是说不管是什么体系,SIESTa 通用
atomic orbitals 来作基的?
那样的话,其中的energycutoff 有什么用呢?
e******g
发帖数: 29
7

架,这个是
啊哈,了解了一下,不是一回事:)

【在 h********r 的大作中提到】
: real space without basis只是计算实现方法,orbital free dft是理论框架,这个是
: 两回事。

e******g
发帖数: 29
8

常是

在一个计算中采用什么基组跟你的体系无关,只跟你选用的软件,或者计算方法有关。
对bulk体系,平面波基组有天生的优势,但对低维材料来说,平面波基组相对于原子轨
道基组来说计算量比较大。
siesta是基于原子轨道基组的,它的参数貌似跟平面波cutoff之间没有很明显的联
系。这也是siesta缺少一种系统化提高精度的方法的原因之一。
不清楚siesta里哪个参数叫“energycutoff”

【在 J*******3 的大作中提到】
: 很困惑的问:
: 可是一些DFT books 中叙述说: 如果是solids( 也就是说有周期性的块材) 通常是
: 用planewave 作基的?难道不是么?
: 如果SIESTa,中没有涉及到 planewave,也就是说不管是什么体系,SIESTa 通用
: atomic orbitals 来作基的?
: 那样的话,其中的energycutoff 有什么用呢?

J*******3
发帖数: 1651
9
sorry, 它不叫energycutoff, 而是meshcutoff, 定义说是 planewave cutoff for
the grid?
既然不是用planewave, 为啥还有这个参数?
另一个问题是:在SIESTA 中用 super cell 不是为了使非周期性的东东具有周期性而
利用 planewave 吗?
h********r
发帖数: 821
10
推荐看martin的书,siesta也有足够多的参考资料。

【在 J*******3 的大作中提到】
: sorry, 它不叫energycutoff, 而是meshcutoff, 定义说是 planewave cutoff for
: the grid?
: 既然不是用planewave, 为啥还有这个参数?
: 另一个问题是:在SIESTA 中用 super cell 不是为了使非周期性的东东具有周期性而
: 利用 planewave 吗?

e******g
发帖数: 29
11

cutoff for
性而
关于meshcutoff,这个问题貌似在别的帖子里回答过了,简单说就是siesta的
Hamiltonian可以分成两坨,其中双中心积分是在k空间做的,其他的在real space
做比较容易,但最后要把两块加起来。这里面需要一个Fourier变化倒来倒去。而
meshcutoff指定的是做FFT时的实空间格点密度。这个参数跟基组没有关系
siesta中会把所有的体系都当做周期性体系来算。但按你设置super cell的不同,你
的体系实际上不一定bulk,低维体系可以通过设定真空层来模拟。
程序用到了super cell 跟它用什么基组没有关系

【在 J*******3 的大作中提到】
: sorry, 它不叫energycutoff, 而是meshcutoff, 定义说是 planewave cutoff for
: the grid?
: 既然不是用planewave, 为啥还有这个参数?
: 另一个问题是:在SIESTA 中用 super cell 不是为了使非周期性的东东具有周期性而
: 利用 planewave 吗?

J*******3
发帖数: 1651
12
多谢多谢了!
J*******3
发帖数: 1651
13
推荐看martin的书? 能不能把书的全名给一下,以便查找?感激涕凌!
h********r
发帖数: 821
1 (共1页)
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Question about DFTcomputational question?
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