c******d
发帖数: 564 | 1 我是外行，有个关于荧光光谱的问题请教。 比如下面这大约十种荧光集团，单靠光谱
分析能分出来吗？
或者转化成另外一个问题，MAx EM 只差 5， 6 nm，这两个基团能靠光谱分析分开吗？
溶液环境一致但是较复杂，是PCR反应产物，里面有0.5mM MgCl2，0.05mM dNTP，DNA，
痕量protein等。
多谢指点
Dye Max. EX (nm) Max.EM (nm)
6-FAM 494 515
JOE™ 520 548 BHQ-1,
TET 521 536
Cal Fluor® Gold 5401 522 541
HEX2 535 555
Cal Fluor Orange 5602 540 561
TAMRA™ 555 576
Cy3® 550 570
Quasar® 5703 548 566
Cal Fluor Red 5904 565 588
ROX™ 573 602
Texas Red® 583 603
Cy5® 651 674
Quasar 6705 647 667
Cy5.5® 675 694 |
m****n
发帖数: 75 | 2 MAx EM 只差 5， 6 nm，这两个基团能靠光谱分析分开吗
单纯靠光谱分析不行 |
c******d
发帖数: 564 | 3 多谢指点。
得差别多少nm才能有效分开？
还有别的简单的方法来区别他们吗？我知道质谱可以，但是太复杂。我就是想用更简便
的方法来取代质谱。 目的是用来做分子探针标记（label for probes in PCR）
多谢
【在 m****n 的大作中提到】
: MAx EM 只差 5， 6 nm，这两个基团能靠光谱分析分开吗
: 单纯靠光谱分析不行
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m*********s
发帖数: 323 | 4 100nm? Maybe.
Make sure there is no FRET if measurement is in a mixture. |
d********y
发帖数: 176 | 5 对你的这些dye不熟悉，他们的fwhm一般多少？如果在20nm以下，那么通过chemometric
analysis (CLS,PLS,PCA etc)没准可以。当然前提是没有太多fret发生，光谱是线性组合
【在 c******d 的大作中提到】
: 我是外行，有个关于荧光光谱的问题请教。 比如下面这大约十种荧光集团，单靠光谱
: 分析能分出来吗？
: 或者转化成另外一个问题，MAx EM 只差 5， 6 nm，这两个基团能靠光谱分析分开吗？
: 溶液环境一致但是较复杂，是PCR反应产物，里面有0.5mM MgCl2，0.05mM dNTP，DNA，
: 痕量protein等。
: 多谢指点
: Dye Max. EX (nm) Max.EM (nm)
: 6-FAM 494 515
: JOE™ 520 548 BHQ-1,
: TET 521 536
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