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Computation版 - molecular dynamics simulation
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c***i
发帖数: 45
1
我在编的MD程序,遇到一个问题,想请教大家。在运行NVT ensemble 的MD程序时,
energy 不断增大导致程序死掉。 具体地说是reciprical part of energy in Ewald
Sum 在不断增大。 想请教大家可能是什莫原因? Thanks!
K*****n
发帖数: 23
2
Ewald求和之前,求和变量是否忘了赋零了。同时也检查一下你的charge值。

【在 c***i 的大作中提到】
: 我在编的MD程序,遇到一个问题,想请教大家。在运行NVT ensemble 的MD程序时,
: energy 不断增大导致程序死掉。 具体地说是reciprical part of energy in Ewald
: Sum 在不断增大。 想请教大家可能是什莫原因? Thanks!

O******e
发帖数: 734
3
If you suspect a bug in the reciprocal Ewald summation, have you
verified your assumption by running a simulation with the real part
of the Ewald summation (the erfc contributions) included but the
reciprocal and correction Ewald contributions excluded and showing
that this gives conservation of the extended Hamiltonian?

【在 c***i 的大作中提到】
: 我在编的MD程序,遇到一个问题,想请教大家。在运行NVT ensemble 的MD程序时,
: energy 不断增大导致程序死掉。 具体地说是reciprical part of energy in Ewald
: Sum 在不断增大。 想请教大家可能是什莫原因? Thanks!

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