D*******r
发帖数: 162 | 1 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
谢谢！ |
m******n
发帖数: 1691 | 2 考虑性价比为什么要mac呢？
【在 D*******r 的大作中提到】
: 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
: 看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
: 想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
: 谢谢！
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f*******2
发帖数: 211 | 3 还是升级显卡，内存太贵了，选32GB， 等内存便宜了再升级。 |
e**********m
发帖数: 1960 | 4 做下一代测序为什么要用mac pro？一般的工作站不是很好么。。。
【在 D*******r 的大作中提到】
: 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
: 看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
: 想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
: 谢谢！
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t**t
发帖数: 27760 | 5 买MacPro还要啥性价比？
【在 D*******r 的大作中提到】
: 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
: 看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
: 想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
: 谢谢！
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n******r
发帖数: 4455 | 6 可能老板是果粉
我去出差时候遇到过一个单位，几百台电脑都是MAC
但是都当成thin client用，运行citrix连到服务器，在窗口里运行window应用软件
只能说领导不缺钱啊 |
n******7
发帖数: 12463 | 7 处理NGS要毛显卡啊
core要多，内存硬盘要大
钱不多的话要mac pro不是行为艺术吗
【在 f*******2 的大作中提到】
: 还是升级显卡，内存太贵了，选32GB， 等内存便宜了再升级。
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D*******r
发帖数: 162 | 8 谢谢你的回复
1.老板现在用的事mac pro,他觉得好
2.我们也想考虑其它的server,但实验室没人懂电脑的...想想就觉得很麻烦...
【在 m******n 的大作中提到】
: 考虑性价比为什么要mac呢？
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D*******r
发帖数: 162 | 9 谢谢你的建议。
我们主要做数据处理，所以感觉显卡可能不是太重要。
我们在前期处理时，用的事desktop,i5处理器，8g内存，感觉很费力。所以想弄大内存
【在 f*******2 的大作中提到】
: 还是升级显卡，内存太贵了，选32GB， 等内存便宜了再升级。
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D*******r
发帖数: 162 | 10 谢谢你的建议。
我知道大部分实验室做NGS都是自己有服务器，或者用学校的supercomputer.
我曾经试过用desktop去做alignment(bowtie2),基本上不行。
但我们实验室比较穷，也不懂怎么建立服务器，所以想着最简单就是弄个mac pro(也算
个服务器吧？）
【在 e**********m 的大作中提到】
: 做下一代测序为什么要用mac pro？一般的工作站不是很好么。。。
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D*******r
发帖数: 162 | 11 谢谢你的回复，实验室经费很有限...
【在 t**t 的大作中提到】
: 买MacPro还要啥性价比？
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D*******r
发帖数: 162 | 12 谢谢你的建议，和我感觉一样。
就是core要多，内存要大。
难道硬盘也要很大吗？
我是想弄个256g的硬盘，处理好的数据转移到移动硬盘存起来，应该要便宜一些，不知
道可行？
【在 n******7 的大作中提到】
: 处理NGS要毛显卡啊
: core要多，内存硬盘要大
: 钱不多的话要mac pro不是行为艺术吗
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d***a
发帖数: 13752 | 13 其实对商用来说，Mac的性价比很好啊。俺上一次配一个server，花了七八千元。楼主
这个配置，在Dell那里恐怕比这个价要高。 |
d***a
发帖数: 13752 | 14 Mac Pro支持一个处理器和两个GPU。如果能用上GPU，Mac Pro非常不错。如果用不上
GPU，那就不合适了。现在越来越多的应用是可以用GPU了。
【在 D*******r 的大作中提到】
: 谢谢你的建议。
: 我知道大部分实验室做NGS都是自己有服务器，或者用学校的supercomputer.
: 我曾经试过用desktop去做alignment(bowtie2),基本上不行。
: 但我们实验室比较穷，也不懂怎么建立服务器，所以想着最简单就是弄个mac pro(也算
: 个服务器吧？）
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D*******r
发帖数: 162 | 15 谢谢你的回复。
怎么才算用上GPU了？难道不是cpu不够了，自动用GPU吗？
不好意思，我电脑基本上就是白痴。。。
【在 d***a 的大作中提到】
: Mac Pro支持一个处理器和两个GPU。如果能用上GPU，Mac Pro非常不错。如果用不上
: GPU，那就不合适了。现在越来越多的应用是可以用GPU了。
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P**H
发帖数: 1897 | |
d***a
发帖数: 13752 | 17 这个要应用程序支持GPU加速。比如说Photoshop CS6，用GPU加速可以有几倍或更高的
提速，就适合Mac Pro这样单CPU双GPU的设计。
如果是你们自己写程序，那要用OpenCL或CUDA编程来使用GPU。
【在 D*******r 的大作中提到】
: 谢谢你的回复。
: 怎么才算用上GPU了？难道不是cpu不够了，自动用GPU吗？
: 不好意思，我电脑基本上就是白痴。。。
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n******7
发帖数: 12463 | 18 你不是做NGS吗？你看看文件都多大
我们这边做meta genome的，几十T都轻松占满
【在 D*******r 的大作中提到】
: 谢谢你的建议，和我感觉一样。
: 就是core要多，内存要大。
: 难道硬盘也要很大吗？
: 我是想弄个256g的硬盘，处理好的数据转移到移动硬盘存起来，应该要便宜一些，不知
: 道可行？
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n******7
发帖数: 12463 | 19 那还是别折腾mac pro了，老老实实PC+linux
我同事几个月前配你这类似的，HP workstation, 6 core + 32GB + 2TB HDD,不到2K
因为我们是当destkop用的，所以其实内存应该在加点，要是你们跑job
reads alignment是高度可并行的，所以core多点好，现在似乎6-core的价格还在性价
比线性范围内。上双CPU价格就上去了
你们要只处理自己的数据，比如RNA-SEQ,Exome sequencing,其实不用太fancy的机器，
我想你们比较穷的话，自己的data也不多
这些个bioinfo工具linux下面跑没有任何问题。大部分应该osx下面也能跑，不过难说
某些有问题。
你们干活的机器，实在没有必要上mac. 装个debian，什么bowtie2，samtools直接在库
里面，一行命令安装好。不然我琢磨你这背景安装就要折腾半天
【在 D*******r 的大作中提到】
: 谢谢你的建议。
: 我知道大部分实验室做NGS都是自己有服务器，或者用学校的supercomputer.
: 我曾经试过用desktop去做alignment(bowtie2),基本上不行。
: 但我们实验室比较穷，也不懂怎么建立服务器，所以想着最简单就是弄个mac pro(也算
: 个服务器吧？）
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d***a
发帖数: 13752 | 20 MacPro运行Linux没问题吧? 没必要在OS X下搞大型开发。
OS X下运行Photoshop倒是很不错。可以搞双启动，把OS X也留着。
...
【在 n******7 的大作中提到】
: 那还是别折腾mac pro了，老老实实PC+linux
: 我同事几个月前配你这类似的，HP workstation, 6 core + 32GB + 2TB HDD,不到2K
: 因为我们是当destkop用的，所以其实内存应该在加点，要是你们跑job
: reads alignment是高度可并行的，所以core多点好，现在似乎6-core的价格还在性价
: 比线性范围内。上双CPU价格就上去了
: 你们要只处理自己的数据，比如RNA-SEQ,Exome sequencing,其实不用太fancy的机器，
: 我想你们比较穷的话，自己的data也不多
: 这些个bioinfo工具linux下面跑没有任何问题。大部分应该osx下面也能跑，不过难说
: 某些有问题。
: 你们干活的机器，实在没有必要上mac. 装个debian，什么bowtie2，samtools直接在库
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x***4
发帖数: 1815 | 21 纳税人的钱就是这样浪费掉。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6
【在 D*******r 的大作中提到】
: 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
: 看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
: 想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
: 谢谢！
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n******7
发帖数: 12463 | 22 OSX也不用，买Mac不是更亏了
另外不知道bootcamp对安装linux支持如何
反正那个SSA mba装linux写了一堆步骤，看着就蛋疼，LZ没必要跟自己过不去
【在 d***a 的大作中提到】
: MacPro运行Linux没问题吧? 没必要在OS X下搞大型开发。
: OS X下运行Photoshop倒是很不错。可以搞双启动，把OS X也留着。
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: ...
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D*******r
发帖数: 162 | 23 谢谢你的科普！
【在 d***a 的大作中提到】
: 这个要应用程序支持GPU加速。比如说Photoshop CS6，用GPU加速可以有几倍或更高的
: 提速，就适合Mac Pro这样单CPU双GPU的设计。
: 如果是你们自己写程序，那要用OpenCL或CUDA编程来使用GPU。
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D*******r
发帖数: 162 | 24 嗯，如果做whole genome sequencing估计得要很大的存储空间。
我们现在主要是RNA-seq,所以感觉还好。
【在 n******7 的大作中提到】
: 你不是做NGS吗？你看看文件都多大
: 我们这边做meta genome的，几十T都轻松占满
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D*******r
发帖数: 162 | 25 谢谢你的信息，真的很有帮助！
不知道你能否给我你同事这款电脑的详细型号？不到2k的性价比真的不错，我可以让我
老板考虑考虑，实在是挺穷的。。。
你觉得32gRAM够了么？
另外，debian 和 ubuntu你觉得装哪个好些？
【在 n******7 的大作中提到】
: 那还是别折腾mac pro了，老老实实PC+linux
: 我同事几个月前配你这类似的，HP workstation, 6 core + 32GB + 2TB HDD,不到2K
: 因为我们是当destkop用的，所以其实内存应该在加点，要是你们跑job
: reads alignment是高度可并行的，所以core多点好，现在似乎6-core的价格还在性价
: 比线性范围内。上双CPU价格就上去了
: 你们要只处理自己的数据，比如RNA-SEQ,Exome sequencing,其实不用太fancy的机器，
: 我想你们比较穷的话，自己的data也不多
: 这些个bioinfo工具linux下面跑没有任何问题。大部分应该osx下面也能跑，不过难说
: 某些有问题。
: 你们干活的机器，实在没有必要上mac. 装个debian，什么bowtie2，samtools直接在库
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s*****o
发帖数: 1565 | |
a********c
发帖数: 3657 | 27 ngs用mac？？？同样的价钱配出的mac比pc慢不少
【在 D*******r 的大作中提到】
: 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
: 看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
: 想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
: 谢谢！
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a******k
发帖数: 1190 | 28 我见过做Bioinfor的，用Mac Pro（以前的型号）的比例那是相当的高
如果你要用的话，差不多内存、硬盘、CPU最好都加到顶
（硬盘千万不要小，要不很多分析你根本没办法做，CPU可以妥协一点，内存必须到顶）
Mac其实性价比应该不错，主要是升级配置加的钱比较合理
比如新Mac Pro所有加到顶也不到$9000（教育价格），
HP和Dell的工作站吊丝配置都很便宜，不过随便升级一些配置花的钱海了去了
比如经典的Z820，只要不到$2000起，但是如果升级到Mac同样的配置
12Core CPU要加$4200，64G内存要加$2000, 1T的SSD要$1600(最差的SSD,比Mac的差)
两块W7000的显卡(比Mac的D700=W9000差)要加$1700
最后要$12000
不过新Mac Pro不太推荐，主要是CPU和内存的扩展性太差，和Z820差的不是一点半点
后者CPU可以加到两块，内存可以加到512G，不过价格也就上去了，要$60000多
（光内存就要$40000多） |
n******7
发帖数: 12463 | 29 看了一下，机器是去年6月买的Z420,2.2K
E501650 6core, 32G 内存，2TB HDD
内存肯定越大越好，预算允许的话
ubuntu debian没大区别，不当桌面用 debian挺好
【在 D*******r 的大作中提到】
: 谢谢你的信息，真的很有帮助！
: 不知道你能否给我你同事这款电脑的详细型号？不到2k的性价比真的不错，我可以让我
: 老板考虑考虑，实在是挺穷的。。。
: 你觉得32gRAM够了么？
: 另外，debian 和 ubuntu你觉得装哪个好些？
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n******7
发帖数: 12463 | 30 我们这一层楼做bioinfo的，没有看到用mac pro的，用imac的倒是有
以前在另一层楼做bioinfo的地方，也没有一个用mac pro的，倒是一个同事用ibook，
等他当了PI，立刻订了一个mac pro
你这比较也不合适，官网升级到极端配置当然是杀猪价，要性价比完全可以自己加东西
顶）
【在 a******k 的大作中提到】
: 我见过做Bioinfor的，用Mac Pro（以前的型号）的比例那是相当的高
: 如果你要用的话，差不多内存、硬盘、CPU最好都加到顶
: （硬盘千万不要小，要不很多分析你根本没办法做，CPU可以妥协一点，内存必须到顶）
: Mac其实性价比应该不错，主要是升级配置加的钱比较合理
: 比如新Mac Pro所有加到顶也不到$9000（教育价格），
: HP和Dell的工作站吊丝配置都很便宜，不过随便升级一些配置花的钱海了去了
: 比如经典的Z820，只要不到$2000起，但是如果升级到Mac同样的配置
: 12Core CPU要加$4200，64G内存要加$2000, 1T的SSD要$1600(最差的SSD,比Mac的差)
: 两块W7000的显卡(比Mac的D700=W9000差)要加$1700
: 最后要$12000
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n******7
发帖数: 12463 | 31 另外一点就是PC，特别是workstation实际价格都有很大的折扣
那个Z420官网价格2.9k,折扣后2.2k，mac的价格基本不可能这个幅度的打折
顶）
【在 a******k 的大作中提到】
: 我见过做Bioinfor的，用Mac Pro（以前的型号）的比例那是相当的高
: 如果你要用的话，差不多内存、硬盘、CPU最好都加到顶
: （硬盘千万不要小，要不很多分析你根本没办法做，CPU可以妥协一点，内存必须到顶）
: Mac其实性价比应该不错，主要是升级配置加的钱比较合理
: 比如新Mac Pro所有加到顶也不到$9000（教育价格），
: HP和Dell的工作站吊丝配置都很便宜，不过随便升级一些配置花的钱海了去了
: 比如经典的Z820，只要不到$2000起，但是如果升级到Mac同样的配置
: 12Core CPU要加$4200，64G内存要加$2000, 1T的SSD要$1600(最差的SSD,比Mac的差)
: 两块W7000的显卡(比Mac的D700=W9000差)要加$1700
: 最后要$12000
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a****a
发帖数: 3905 | 32 amazon ec2加star cluster。
【在 n******7 的大作中提到】
: 那还是别折腾mac pro了，老老实实PC+linux
: 我同事几个月前配你这类似的，HP workstation, 6 core + 32GB + 2TB HDD,不到2K
: 因为我们是当destkop用的，所以其实内存应该在加点，要是你们跑job
: reads alignment是高度可并行的，所以core多点好，现在似乎6-core的价格还在性价
: 比线性范围内。上双CPU价格就上去了
: 你们要只处理自己的数据，比如RNA-SEQ,Exome sequencing,其实不用太fancy的机器，
: 我想你们比较穷的话，自己的data也不多
: 这些个bioinfo工具linux下面跑没有任何问题。大部分应该osx下面也能跑，不过难说
: 某些有问题。
: 你们干活的机器，实在没有必要上mac. 装个debian，什么bowtie2，samtools直接在库
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t******o
发帖数: 1470 | 33 真实吃饱了折腾，买mac pro 做ngs ,还追求性价比？ 你还不如问问北京街头的豆汁摊
哪个有欧洲中世纪风格了
老板实在想要，随机选一个就是了。反正性价比都是垃圾
做ngs， 第一重要的是core数目，其次是内存。 用bowtie2， gpu是没指望了
想新潮，考虑amazon的服务，想实用，自己找hp dell的服务器，还是那句话，随机选
一个，轻松秒杀mac pro
【在 D*******r 的大作中提到】
: 实验室要买一台Mac Pro处理数据，主要是next generation sequencing 数据。
: 看了一下APPLE的网站，cpu,memory,storage可以选不同的配置。见附图。
: 想请板上的大侠们推荐一下，怎么配置性价比高些。
: 谢谢！
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z**********3
发帖数: 11979 | 34
我自个弄会搞hackintosh
【在 x***4 的大作中提到】
: 纳税人的钱就是这样浪费掉。
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6
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g*r
发帖数: 67 | 35 听说mac OSX自家的gcc跟linux下的有些区别。
如果你要自行编译某些程序，有时会遇到麻烦。 |
D*******r
发帖数: 162 | 36 谢谢你的建议！我也是准备CUP妥协一点，内存加到顶。
顶）
【在 a******k 的大作中提到】
: 我见过做Bioinfor的，用Mac Pro（以前的型号）的比例那是相当的高
: 如果你要用的话，差不多内存、硬盘、CPU最好都加到顶
: （硬盘千万不要小，要不很多分析你根本没办法做，CPU可以妥协一点，内存必须到顶）
: Mac其实性价比应该不错，主要是升级配置加的钱比较合理
: 比如新Mac Pro所有加到顶也不到$9000（教育价格），
: HP和Dell的工作站吊丝配置都很便宜，不过随便升级一些配置花的钱海了去了
: 比如经典的Z820，只要不到$2000起，但是如果升级到Mac同样的配置
: 12Core CPU要加$4200，64G内存要加$2000, 1T的SSD要$1600(最差的SSD,比Mac的差)
: 两块W7000的显卡(比Mac的D700=W9000差)要加$1700
: 最后要$12000
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D*******r
发帖数: 162 | 37 再次感谢！！
【在 n******7 的大作中提到】
: 看了一下，机器是去年6月买的Z420,2.2K
: E501650 6core, 32G 内存，2TB HDD
: 内存肯定越大越好，预算允许的话
: ubuntu debian没大区别，不当桌面用 debian挺好
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x***4
发帖数: 1815 | 38 是的。osx 现在是llvm了。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6
【在 g*r 的大作中提到】
: 听说mac OSX自家的gcc跟linux下的有些区别。
: 如果你要自行编译某些程序，有时会遇到麻烦。
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d********u
发帖数: 5383 | 39 mac pro跟人家SERVER比就是玩具，比你贵有什么新鲜的。LZ说实验室经费有限，不会
折腾机器，然后要考虑买MAC...
really funny
【在 d***a 的大作中提到】
: 其实对商用来说，Mac的性价比很好啊。俺上一次配一个server，花了七八千元。楼主
: 这个配置，在Dell那里恐怕比这个价要高。
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d***a
发帖数: 13752 | 40 呵呵，大抽抽眼界有限啊。你说说看Dell的server有什么特殊？
【在 d********u 的大作中提到】
: mac pro跟人家SERVER比就是玩具，比你贵有什么新鲜的。LZ说实验室经费有限，不会
: 折腾机器，然后要考虑买MAC...
: really funny
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d*b
发帖数: 21830 | 41 差别大了，很多学生物的编程都是三脚猫的功夫，最大的本事也就拿人家的code改改，
你要没钱养programmer,linux上的c++ code你改得了吗？估计一个make file都能让你
这种的玩上一个月吧？
computer在科学研究里是tool,选择tool的最重要的要求是能提高你work的throughput
：你有idea到发paper需要多少时间， 好比一辆车，要丫的大多数时间都停在车库里维
修的话，你还跑什么运输？改行修车算了。
lab选计算机最重要的是，你tmd在这种机器上有本事维护人家的code么？没有就别穿那
t-back了，你们学生物的那活儿，穿个t-back只能徒增笑儿。
有时候看看版上的一些生物果残，真他妈的神经病，苍蝇一样，一闻到夹不死的骚味就
一哄而上。
【在 d***a 的大作中提到】
: 呵呵，大抽抽眼界有限啊。你说说看Dell的server有什么特殊？
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d***a
发帖数: 13752 | 42 大sb也来了，你们两位倒是能凑成一对。:)
计算机科班出身的，不管什么拿来先装一个Linux，不是你这么个搞笑的做法。
throughput
【在 d*b 的大作中提到】
: 差别大了，很多学生物的编程都是三脚猫的功夫，最大的本事也就拿人家的code改改，
: 你要没钱养programmer,linux上的c++ code你改得了吗？估计一个make file都能让你
: 这种的玩上一个月吧？
: computer在科学研究里是tool,选择tool的最重要的要求是能提高你work的throughput
: ：你有idea到发paper需要多少时间， 好比一辆车，要丫的大多数时间都停在车库里维
: 修的话，你还跑什么运输？改行修车算了。
: lab选计算机最重要的是，你tmd在这种机器上有本事维护人家的code么？没有就别穿那
: t-back了，你们学生物的那活儿，穿个t-back只能徒增笑儿。
: 有时候看看版上的一些生物果残，真他妈的神经病，苍蝇一样，一闻到夹不死的骚味就
: 一哄而上。
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d*b
发帖数: 21830 | 43 地瓜同学，该杀老鼠了，上网灌水的事可以再缓，你要再不杀，（女）老板要不happy了
【在 d***a 的大作中提到】
: 大sb也来了，你们两位倒是能凑成一对。:)
: 计算机科班出身的，不管什么拿来先装一个Linux，不是你这么个搞笑的做法。
:
: throughput
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d***a
发帖数: 13752 | 44 大sb，你神智有点不清啊。
happy了
【在 d*b 的大作中提到】
: 地瓜同学，该杀老鼠了，上网灌水的事可以再缓，你要再不杀，（女）老板要不happy了
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