i***k
发帖数: 45 | 1 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: icook (icook), 信区: Chemistry
标 题: 问个计算化学问题：怎么读GRID？
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 3 12:55:17 2011, 美东)
初入计算化学行当，现在有一个势能FUNCTION, f(a,b,c,d,e)，
我们从别的组拿到了f的ab initio数据，是17万行的数据，分别是变换ABCD得来的
我老板的意思是，做个GRIDDING，就相当于做个LIBRARY，
然后从里面内插，或者外插（interpolation, extrapolation）得到我们要的f值。
可是俺比较笨，不知道该怎么做。能请各位前辈指导一下么？我们用fortran，c
也可以。
1，我是先把17万行数据都读入程序先么？这样会不会内存废掉？俺是在ibm系列
的super computer上做，不知道会不会导致内存太大
2，假设我不先读入，而是每个f(a,b,c,d,e)，我都到外部文件里面去查找，
这个怎么实现呢？ 非常感谢关于这个的建议！ 俺编程半白痴，实在不知道怎么实现。
如果一开始都读入，俺可以想办法实现。如果外部每次都读，就不知道了。：）
谁能帮忙一下？ 多谢！
要是有人有类似的gridding的，外部读入的或者内部读入的程序可以介绍看一下，
就更好了！ 多谢多谢！！ | g*****k
发帖数: 623 | 2 17万行的数据应该不需要你做高深的优化。
应该可以直接读入内存操作。上了billion再考虑如何分块使用buffer
【在 i***k 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
: 发信人: icook (icook), 信区: Chemistry
: 标 题: 问个计算化学问题：怎么读GRID？
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 3 12:55:17 2011, 美东)
: 初入计算化学行当，现在有一个势能FUNCTION, f(a,b,c,d,e)，
: 我们从别的组拿到了f的ab initio数据，是17万行的数据，分别是变换ABCD得来的
: 我老板的意思是，做个GRIDDING，就相当于做个LIBRARY，
: 然后从里面内插，或者外插（interpolation, extrapolation）得到我们要的f值。
: 可是俺比较笨，不知道该怎么做。能请各位前辈指导一下么？我们用fortran，c
: 也可以。
| i***k
发帖数: 45 | 3 就是说，直接当做数组读入数据先，然后直接访问数组数据来进行内插和外插？
（interpolation extrapolation)
那就简单多了！ 多谢！
【在 g*****k 的大作中提到】
: 17万行的数据应该不需要你做高深的优化。
: 应该可以直接读入内存操作。上了billion再考虑如何分块使用buffer
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