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发帖数: 8613 | 1 有不少没搞懂报道和网络流言
来来来，咱聊一聊
如果你至少有点概率统计/probabilistic analysis的知识，那这个话题对你就不难。
否则你要费点小脑筋。 |
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发帖数: 8613 | |
w********9
发帖数: 8613 | 3 为了抗击病毒肺炎
中国检验临床
国家健康卫生健康委员会临床检验中心
推迟了总体的检验临床技术计划
而把核酸试剂检验作为首要
https://www.nccl.org.cn/showMeetDetail?code=09&id=140
03月30日, 2020年
为配合抗击新型冠状病毒肺炎疫情，经研究决定，推迟原定于2020年4月份开展的全国
临床检验室间质量评价计划（心肌标志物、脂类、血气、特殊蛋白、半胱氨酸蛋白酶抑
制剂C、血清视黄醇结合蛋白、血清降钙素原、抗核抗体、华法林药物代谢基因(CYP2C9
和VKORC1)多态性、氯吡格雷药物代谢基因(CYP2C19)多态性、伊立替康药物代谢基因(
UGT1A1)多态性、乳腺癌HER2扩增FISH检测、BCR-ABL1融合基因检测、DMD基因检测、全
血细胞计数、血红蛋白A2和血红蛋白F、疾控中心细菌学检验、血型）。具体时间将另
行通知。请您及时关注国家卫生健康委临床检验中心网站通知。 |
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发帖数: 8613 | 4 https://www.nccl.org.cn/showMeetDetail?code=09&id=141
关于免费提供新型冠状病毒核酸检测质控品（原料）的通知（独立医学实验室、试剂厂
家名额已满，已截止报名）
04月03日, 2020年
各有关单位实验室：
核酸检测是新型冠状病毒肺炎（Corona Virus Disease 2019，COVID-19）确诊标准，
为更好地促进临床实验室新型冠状病毒核酸检测质量，国家卫生健康委临床检验中心（
以下简称“临检中心”）拟向全国开展新型冠状病毒核酸检测的临床实验室免费提供无
生物传染危险性噬菌体病毒样颗粒样本（自研），用于实验室室内质量控制、性能验证
或试剂方法建立的性能确认等。每个实验室提供3支高浓度质控品原料（0.5mL/支，浓
度约105~106copies/mL），按室内质控每批检测使用1支500~1000 copies/mL弱阳性质
控品来计算，则1支质控品原料可稀释1000倍，分装为1000支，可满足1000~2000个批次
检测使用。
。。。 |
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发帖数: 8613 | 5 其实，在世界各地，核酸检测是金标/gold standard（辅以疑似判断和其它技术包括抗
体等等，可以大大减小实际中的假阴性和假阳性）
3月12日，国家药品监督管理局公布了11家许可的核酸试剂提供单位（后来好像有第12
家）
https://www.cmde.org.cn/CL0004/20614.html
截至目前，国家药品监督管理局共批准新冠病毒核酸检测试剂11个，抗体检测试剂6个。
已批准新冠病毒检测试剂清单： |
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发帖数: 8613 | 6 https://www.cmde.org.cn/CL0004/20689.html
2020-03-27 20:00
截至目前，国家药监局已经应急批准23个新型冠状病毒检测产品，其中新冠病毒核酸检
测试剂15个，抗体检测试剂8个。
。。。 |
w********9
发帖数: 8613 | 7 2月12日发布了核酸检测的技术要求
其中提到90%-95%的准确度要求
这个数字很重要
必须用在我后来作的概率计算
1月底准确度参差不齐
到了现在4月份，有报道说比95%都高了
https://www.medsci.cn/article/show_article.do?id=34eb18e92867
关于发布《2019新型冠状病毒核酸检测试剂注册技术审评要点》的通告
（2020年第4号）
为应对新型冠状病毒感染的肺炎疫情，按照“统一指挥、早期介入、随到随审、科学审
批”的原则和确保产品安全、有效、质量可控的要求，我中心制定了《2019新型冠状病
毒核酸检测试剂注册技术审评要点》，现予以发布。
特此通告。
附件：2019新型冠状病毒核酸检测试剂注册技术审评要点
国家药品监督管理局
医疗器械技术审评中心
2020年2月12日
2019新型冠状病毒核酸检测试剂注册技术审评要点
一、适用范围
2019新型冠状病毒核酸检测试剂用于对咽拭子、鼻咽拭子、肺泡灌洗液、痰液、呼吸道
洗液、抽吸液或其他呼吸道分泌物等样本中的2019新型冠状病毒核酸进行体外定性检测
。本审评要点适用于进行首次注册申报的产品。
二、性能评估：
企业应提交在符合质量管理体系的生产环境下生产的试剂盒进行的所有性能验证的研究
资料，包括具体研究方法、实验方案、实验数据、统计分析等详细资料。建议着重对以
下分析性能进行研究。
1.核酸（RNA）提取/纯化性能
在进行靶核酸检测前，应有核酸（RNA）提取/纯化步骤。该步骤的目的除最大量分离出
目的RNA外，还应有相应的纯化作用，尽可能去除PCR抑制物。无论检测试剂是否含有
RNA分离/纯化的组分，企业都应结合检测试剂的特性，对配合使用的核酸提取试剂/方
法的提取效率、提取核酸纯度等做充分的验证，提供详细的验证资料。
2.最低检测限
（1）最低检测限的确定
将含有2019新型冠状病毒的真实临床样本/含有该病毒RNA片段的假病毒颗粒梯度稀释于
（与适用样本一致的）适当基质中，用于进行最低检测限研究，应采用科学的方法标定
病毒滴度。每个浓度梯度最少重复三次检测，以100%可检出的最低浓度水平作为估计检
测限，在此浓度附近制备若干梯度浓度样品，每个浓度至少重复20次检测，将具有90%
～95%阳性检出率的最低浓度水平作为确定的最低检测限。
在进行最低检测限的确定时，应至少包括不同来源的三个具有代表性的2019新型冠状病
毒样本，进行系列梯度稀释。
（2）最低检测限的验证
选择不同来源的至少3个病毒样本（与最低检测限确定不同的病毒样本）在最低检测限
浓度水平进行验证，应达到90%～95%阳性检出率。
应提供详细的病毒液滴度的确定方法及验证结果。
3.不同区域病毒样本包容性的验证
至少验证包括具有时间和区域特征性的10个不同来源的病毒样本（阳性临床样本或分离
培养物），应包括最低检出限、重复性等性能的验证，病毒样本的滴度应采用科学合理
的方法进行标定。
4.分析特异性
（1）交叉反应验证包括：
①地方性人类冠状病毒（HKU1，OC43，NL63和229E）、SARS冠状病毒、MERS冠状病毒；
H1N1（新型甲型H1N1流感病毒（2009）、季节性H1N1流感病毒）、H3N2、H5N1、H7N9，
乙型流感Yamagata、Victoria，呼吸道合胞病毒A、B型，副流感病毒1、2、3型，鼻病
毒A、B、C组，腺病毒1、2、3、4、5、7、55型，肠道病毒A、B、C、D组，人间质肺病
毒、人偏肺病毒、EB病毒、麻疹病毒、人巨细胞病毒、轮状病毒、诺如病毒、腮腺炎病
毒、水痘-带状疱疹病毒；
肺炎支原体、肺炎衣原体；
军团菌、百日咳杆菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、化脓性链球菌、
肺炎克雷伯菌、结核分枝杆菌；
烟曲霉、白色念珠菌、光滑念珠菌、新生隐球菌等。
建议在病毒和细菌感染的医学相关水平进行交叉反应的验证。通常，细菌感染的浓度水
平为106 cfu/ml或更高，病毒为105 pfu/ml或更高，提供所有用于交叉反应验证的病毒
和细菌的来源、种属/型别和浓度确认等试验资料。
②人类基因组DNA。
（2）内源/外源物质干扰
应根据所采集样本类型，针对可能存在的干扰情况进行验证。建议申请人在每种干扰物
质的潜在最大浓度（“最差条件”）条件下进行评价，在病毒临界阳性水平进行干扰试
验验证。检测的潜在干扰物包括样本中的原有物质（如血液、鼻腔分泌物、粘液及用于
缓解淤血、鼻噪、刺激或哮喘和过敏症状的鼻腔和咽喉药物、抗菌药物、抗病毒药物等
）及在样本采集和制备期间引入的物质。
QQ截图20200212204855.jpg
表1 推荐用于干扰试验的物质
5.精密度
企业应对精密度指标，如标准差或变异系数等的评价标准做出合理要求。模拟样本并不
能体现临床样本可能带来的所有变异因素，因此精密度评价中应同时包含若干临床样本
，且精密度评价试验应包含核酸分离/纯化步骤。针对本类产品的精密度评价主要包括
以下要求。
（1）对可能影响检测精密度的主要变量进行验证，除检测试剂（包括核酸分离/纯化组
分）本身的影响外，还应对分析仪、操作者、地点、检测轮次等要素进行相关的验证。
（2）设定合理的精密度评价周期，例如：为期至少20天的检测或者为期至少5天的检测
，具体方案可参考EP文件进行。从而对批内/批间、日内/日间以及不同操作者之间的精
密度进行综合评价。
（3）用于精密度评价的人工模拟样品和临床样本均应至少包含3个水平：阴性样品、临
界阳性样品、（中或强）阳性样品，并根据产品特性设定适当的精密度要求，临床样本
精密度评价中的每一次检测均应从核酸提取开始。
①阴性样本：待测物浓度低于最低检测限或为零浓度，阴性检出率应为100%（n≥20）。
②临界阳性样本：待测物浓度略高于试剂盒的最低检测限，阳性检出率应≥95%（n≥20
）。
③中/强阳性样本：待测物浓度呈中度到强阳性，阳性检出率为100%且CV≤10%（n≥20
）。
6.提供企业参考品验证资料：根据主要原材料研究资料中的企业参考品设置情况，采用
三批产品对企业参考品进行检验并提供详细的实验数据。
7.其他需注意问题
对于适用多个机型的产品，应提供产品说明书【适用机型】项中所列的所有型号仪器的
性能评估资料。不同样本类型应分别进行性能评估验证.
三、注册检验
应提供符合产品技术要求的、在具有相应医疗器械检验资质和承检范围的医疗器械检验
机构进行的产品检验报告，应提供连续3个生产批次样品的检验合格报告。
该项目已有国家参考品，应使用国家参考品进行注册检验。
四、阳性判断值确定资料
阳性判断值确定资料主要指对申报产品病毒核酸检测的Ct值，即结果判断的临界值进行
确认的资料。阳性判断值研究资料样本来源应考虑不同年龄、性别、地域等因素，尽可
能考虑样本来源的多样性、代表性。如存在判定值灰区，应提供灰区的确认资料。应说
明所选择阳性判断值研究方法的合理性，阈值设置应科学合理。提供内标值的确定方法
和研究资料。
五、主要原材料研究资料
此产品的主要原材料包括引物、探针、酶、dNTP、核酸分离/纯化组分（如有）、质控
品、参考品等。应提供主要原材料的选择与来源、制备过程、质量标准等相关研究资料
、质控品的定值试验资料等。如主要原材料为企业自制，应提供其详细制备过程；如主
要原材料源于外购，应提供资料包括：选择该原材料的依据及对比筛选试验资料、供货
方提供的质量标准、出厂检定报告，以及该原材料到货后的质量检验资料。
1.引物和探针：应详述引物和探针的设计原则，提供引物、探针核酸序列、靶序列的基
因位点及两者的对应情况。建议每种病毒设计两套或多套引物、探针以供筛选，通过序
列比对和试验等方式，对病毒进行包容性和特异性（如交叉反应）的评价，选择最佳组
合，并提交筛选的研究数据。引物、探针的质量标准应至少包括序列准确性、纯度、浓
度及功能性实验等。
2.脱氧三磷酸核苷（dNTP）：包括dATP、dUTP、dGTP、dCTP、dTTP，应提供对其纯度、
浓度、功能性等的详细验证资料。
3.酶：需要的酶主要包括DNA聚合酶、逆转录酶、尿嘧啶DNA糖基化酶等，应分别对酶活
性、功能性等进行评价和验证。
4.试剂盒内质控品
试剂盒的质控体系通过设置各种试剂盒质控品来实现，其应参与样本处理、核酸的平行
提取和检测的全过程。以对整个提取和PCR扩增过程、试剂/设备、交叉污染等环节进行
合理质量控制。申报资料应对试剂盒质控品有关原料选择、制备、定值过程、浓度范围
等试验资料详细说明。企业应对质控品的检测结果（如Ct值）做出明确的范围要求。
4.1阴性质控品应不含试剂盒所检测的靶序列。
4.2阳性质控品
阳性质控品可用1～2个病毒株为代表，应含有天然的或人工合成的包含试剂盒可检测靶
序列（如假病毒）。
5.内对照（内标）可以对管内抑制导致的假阴性结果进行质量控制，应与靶核酸一同提
取及扩增，申请人应对内对照（内标）的引物、探针设计和模板浓度做精确验证，既要
保证内标荧光通道呈明显的阳性曲线又要尽量降低对靶基因检测造成的抑制。对内对照
的检测结果（如Ct值）亦应做出明确的范围要求。建议科学设置内对照（内标），对待
侧样本的取样质量、试剂的反应体系进行监控。
6.企业参考品
应根据产品性能验证的实际需要自行设定企业内部参考品，包括阳性参考品、阴性参考
品、检测限参考品、重复性参考品。
阳性参考品应着重考虑不同来源的病毒样本和滴度要求，应至少选取不同来源的5个病
毒样本。
阴性参考品则主要涉及对交叉反应的验证情况，建议包括冠状病毒（HKU1、OC43、NL63
、229E）、SARS冠状病毒（可采用假病毒）、MERS冠状病毒（可采用假病毒）、流感病
毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒等。
检测限参考品的浓度水平可采用90～95%阳性检出水平或略高于最低检测限的水平，如
100%阳性检出水平。检测限参考品的浓度确定应科学合理。
重复性参考品建议包括高、低两个浓度的样本，其中一个浓度应为最低检出限附近的浓
度。
申请人应对内部参考品的来源、型别鉴定、病毒滴度等信息进行精确的试验验证，并提
交详细的验证资料。
六、主要生产工艺及反应体系的研究资料
1.介绍产品主要生产工艺，可用图表方式表示，并说明主要生产工艺的确定依据。
2.反应原理介绍。
3.详述样本采集、样本处理方式的选择和设置，提供相关的研究资料。
（1）研究样本采集时间点的选择：是否受病程、临床症状、用药情况等因素的影响。
（2）研究对采样拭子及样本保存液的要求：对采样拭子的材质要求（包括对拭子头和
拭子杆的要求），保存容器要求，裂解液、保存液成分、浓度、使用量的要求等。
4.确定最佳反应体系的研究资料，包括样本用量、各种酶浓度、引物/探针浓度、dNTP
浓度、阳离子浓度及反应各阶段温度、时间、循环数等。建议在保证核酸提取纯度的情
况下尽量扩大总反应体系和加样量。
5.不同适用机型的反应条件如果有差异应分别详述，并提交验证资料。
6.如申报产品包含核酸分离/纯化试剂，应提交对核酸分离/纯化过程进行工艺优化的研
究资料。
七、稳定性研究资料
稳定性研究资料主要涉及两部分内容，申报试剂的稳定性和适用样本的稳定性研究。
1.申报试剂的稳定性主要包括实时稳定性（有效期）、开瓶稳定性及冻融次数限制等研
究，申请人可根据实际需要选择合理的稳定性研究方案。稳定性研究资料应包括研究方
法的确定依据、具体的实施方案、详细的研究数据以及结论。对于实时稳定性研究，应
提供至少三批样品在实际储存条件下保存至成品有效期后的研究资料。
2. 适用样本的稳定性
考虑到病毒RNA极易被降解的特性，企业也应对样本稳定性进行研究，包括采集后未经
处理的样本，加入裂解液/保存液的样本，常规病毒灭活的样本，保存条件包括冷藏和
冷冻两种条件。如产品适用拭子、痰液和灌洗液等不同的样本类型，因其中干扰物质存
在较大差异，可能对病毒RNA降解的影响不同，建议对每种样本类型均进行研究。适于
冷冻保存的样本还应对冻融次数进行评价。
对于此类试剂，如核酸提取液不能立即进行检测，则还需对核酸提取液的保存条件和稳
定性进行研究。
八、临床证据
新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂临床试验应按要求在三家以上临床试验机构进行
（含各级疾病预防控制中心），通过考核试剂对来自临床病例样本的检测结果与已上市
同类产品检测结果以及病例的临床确诊/排除结果进行对比，以验证产品临床性能。已
上市同类产品检测结果可获取自病例临床诊疗过程。如临床试验机构条件允许，推荐多
家生产企业的试剂盒在相同的临床试验机构共同验证。
1.临床试验对比方法
临床试验应选择已上市的同类产品作为对比产品，同时，考虑考核试剂检测结果与临床
确诊/排除结果进行对比。国家卫生健康委员会发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊断
方案》及《全国各省（区、市）首例新型冠状病毒感染的肺炎病例确认程序》等文件，
病例确认方法应依据上述文件中规定的各省份首例病例确认程序及各省第二例及以后的
感染病例的确认程序制定。不建议采用某一试验地点的单次试验结果作为确认结果。既
往病例的确认结果可提交该病例的既往确认数据。
2.临床试验入组人群
临床试验的入组人群应为产品的预期适用人群，该产品的适用人群为新型冠状病毒感染
肺炎的疑似病例，国家卫生健康委在不同时间阶段发布了不同版本的《新型冠状病毒感
染的肺炎诊疗方案》，申请人在进行临床试验时应考虑当时现行方案对“疑似病例”的
定义，按照该定义入组病例进行临床研究，临床试验过程中应包括确诊及排除病例。临
床试验中应入组部分前期新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测阴性的确诊病例，该部分病
例可采用回顾性研究，临床验证的样本包括：前期核酸检测剩余样本及病例确认所用样
本。同时，临床试验还可入组部分解除隔离和符合出院标准的病例，该部分病例阴性的
确认应满足现行的《新型冠状病毒感染的肺炎诊断方案》中关于解除隔离和出院标准的
要求。
3.临床试验样本类型
试剂盒样本采集建议按照《新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南》进行。临床
试验过程中，如临床试验过程中样本确实难以获得，经提取后的核酸提取液亦可作为样
本进行临床试验。如采用核酸提取液进行临床试验，建议临床试验中明确该核酸提取液
对应的样本类型及样本保存液/采样液（如适用），同时明确核酸提取试剂盒，临床前
应对临床试验中所涉及的样本类型、样本保存液及核酸提取试剂进行充分的性能评估，
临床试验中所用样本保存液及核酸提取试剂应严格满足考核试剂及对比试剂要求。
临床试验中如病例可获得多个样本类型，如上、下呼吸道标本等，验证过程中建议至少
包括上呼吸道样本和下呼吸道样本。临床试验不同样本类型及核酸提取液稳定性应满足
考核试剂及对比试剂的要求。
4.临床试验样本量
新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂为定性产品，临床试验过程样本量应能够满足评
价临床评价指标的要求，如临床灵敏度、临床特异度、阴阳性符合率等，建议入组确诊
病例不少于200例，排除病例不少于300例，同时入组部分解除隔离和符合出院标准的病
例。入组病例中不同临床严重程度、不同病程阶段的患者均应有一定的例数。如申报试
剂包含不同样本类型，建议每种样本类型单独统计满足统计学要求。
5.临床试验结果的统计分析
此类产品的临床试验目的在于验证申报产品与临床已应用的同类产品及临床参考标准的
一致性，统计分析一般以2×2表的形式对结果进行总结，并据此计算申报产品与对比产
品的符合率、临床灵敏度、临床特异度及其置信区间。应将考核试剂与对比试剂检测结
果一致性及考核试剂检测结果与临床确认/排除结果的一致性分别进行统计分析，以评
价产品临床性能。
临床试验建议对入组人群的人口学进行分析，包括年龄、性别、临床诊断背景、临床分
型等。临床试验中应对不同的人群进行分层统计，如确诊/排除病例、前期新型冠状病
毒2019-nCoV核酸检测阴性的确诊病例、及解除隔离和符合出院标准病例等。针对前期
新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测阴性的确诊病例前期阴性样本、及解除隔离和符合出
院标准病例样本，应描述考核试剂针对新型冠状病毒2019-nCoV核酸的检出率。临床试
验中包含不同样本类型的，应在总样本数（各样本类型总和）进行统计分析的基础上，
每个样本类型分别进行统计分析。
临床试验中所有不一致结果均应结合患者的流行病学背景、临床症状、疾病转归等信息
进行充分的分析。
6. 临床证据的形式要求
申请人应按照《体外诊断试剂注册管理办法》、《关于公布体外诊断试剂注册申报资料
要求和批准证明文件格式的公告》等法规文件要求提交各机构伦理审查意见、临床试验
方案和临床试验报告以及临床试验总结报告。
临床试验数据汇总表作为临床试验报告的附件提交。数据表中应包括检测病例的编号、
年龄、性别、样本类型、临床诊断背景信息、考核试剂检测结果（含各基因的Ct值）、
对比试剂的检测结果（各基因的Ct值）、新冠病毒感染的确诊或排除结果等，如临床试
验中所用样本为核酸提取液，应明确该样本样本保存液（如涉及）、核酸提取试剂等。
临床应用的数据集中每一病例编号应能够溯源。具体内容详见附表。 |
w********9
发帖数: 8613 | 8 2月25日增加了抗原/抗体测试技术要求
https://www.cmde.org.cn/CL0004/20512.html
关于发布《2019新型冠状病毒抗原/抗体检测试剂注册技术审评要点（试行）》的通告
（2020年第6号）
2020-02-25 16:00
为应对新型冠状病毒肺炎疫情，按照“统一指挥、早期介入、随到随审、科学审批
”的原则和确保产品安全、有效、质量可控的要求，我中心制定了《2019新型冠状病毒
抗原/抗体检测试剂注册技术审评要点（试行）》，现予以发布。
特此通告。
附件：2019新型冠状病毒抗原/抗体检测试剂注册技术审评要点（试行）（下载）
国家药品监督管理局
医疗器械技术审评中心
2020年2月25日 |
w********9
发帖数: 8613 | |
w********9
发帖数: 8613 | 10 数据可做后来计算（包括敏感性分析）的参考
https://m.chinanews.com/wap/detail/zw/cj/2020/03-06/9116198.shtml
中新网客户端3月6日电(记者 吴涛)6日，在国新办举行的新闻发布会上，中央指导组成
员、工信部副部长王江平称，关于新冠病毒核酸检测试剂，目前共有12家生产企业取得
产品注册证，这些企业都在生产，从检测试剂盒批准上市至3月5日，累计供给了1537.4
万人份，日均供应34.16万人份，生产企业库存还有大约200万人份，可以说完全满足湖
北省和全国其他地区的检测需求。 |
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发帖数: 8613 | |
w********9
发帖数: 8613 | 12 假阴性对防抗疫情更比假阳性重要得多
而反过来的情况是
对毒品/醉驾测试，假阳性更重要 |
w********9
发帖数: 8613 | 13 在网上似乎还没有
《全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价结果报告》
这里有技术和技术改进细节
官批的每个试剂的综合准确度还是很高的，但是2区测试的准确度差异会很大，个别的
试剂只对单区敏感。对超低浓度还是需要改进，也可能那本来就太接近可测试浓度的阈
值，在实际中样品需要更多时间复制而提高浓度到敏感高区域。
我没涉及生物或相关行业，还需要更细看内容。
http://www.innomd.org/article/5e8e849d07bace0521c4b521
http://feng.ifeng.com/c/7vZqWRq63gw
本次质评，共计 844 家实验室回报有效结果，实验室总体检测情况良好，合格实验室
701 家（83.1%）。
。。。
本次质评要求实验室能够检出8×10 4 copies/mL，1.6×10 4 copies/mL, 3.2×10
3copies/mL, 640 copies/mL 四个浓度水平的样本。各临床实验室在 1.6×10 4
copies/mL 以上浓度水平，符合率均可以达到97%以上，主要的问题存在于对3.2×10 3
copies/mL 和 640 copies/mL 两个弱阳性样本检出能力。导致检测假阴性的原因涉及
核酸提取和检测两个过程。 |
m**x
发帖数: 1084 | 14 很多国外的，贪便宜买的是测血液anti-body的试剂。这个便宜，而且出结果快。可是
很不准。尤其不能当开始诊断用。只能给已是病人的病愈后检查的 |
w********9
发帖数: 8613 | 15 用百度搜索最近的官方
核酸检测质量评价
得到的结果关联性好像更强 |
w********9
发帖数: 8613 | 16 测试面还是很广的
非官批的试剂也有很多相当不错，甚至不比官批的表现差
样品都是3月中旬或以前的。3月底又有几家被批准提供官方允许的试剂
http://med.china.com.cn/content/pid/169544/tid/1026
近日，国家卫健委临床检验中心公布了《全国新型冠状病毒核酸检测室间质量评价结果
报告》。
本次共发放12个质评样本，各参评实验室回报结果与官方标准答案完全相符判定为合格。
根据国家卫健委临床检验中心的总结报告，本次室间质评活动共有涵盖全国范围的包括
疾控中心、公立医疗机构（综合性医院、专科医疗机构、妇幼保健机构）、独立医学实
验室、海关所属国际旅行医疗保健中心、试剂研发厂家、科研院所在内的1296家实验室
报名。
实际接受报名实验室889家，覆盖全国31个省份（含自治区、直辖市）。共855家实验室
提交检测结果，有效结果844家，其中701家结果合格（83.1%），143家结果不合格（16
.9%）。
http://www.labtoday.net/a/medical/Reagents/2020/0411/9650.html
结果统计
据悉，本次质评共发放12个质评样本，各参评实验室回报结果与官方标准答案完全相符
判定为合格。
质评样本均为国家卫生健康委临床检验中心制备，为基因工程方法制备的噬菌体病毒样
颗粒模拟样本，无生物传染危险性。该样本适用于NMPA批准的新型冠状病毒核酸检测试
剂，19种未批准的商品化试剂和32家不同实验室自建方法。12个质评样本中，进行统计
的样本为10个。 |
w********9
发帖数: 8613 | 17 圣湘和达安那两家官批太厉害了，如果它们在那个超低浓度区的技术稳定的话
浓度只有每毫升128！其它样品是640和3千2，或者更高。
另外两家不知道是谁
"""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
202010 号样本（128 copies/mL）共计 6 家实验室检出，2 家为圣湘生物、2 家为达
安基因、2 家为自建方法（实时荧光 PCR、数字 PCR 法各 1 家）。 |
w********9
发帖数: 8613 | 18 那个128应该相当接近当前的技术阈值了，因此不被作为合格判别指标
测阳率/符合率是6 out of 931 reports
640的790 out of 931 |
w********9
发帖数: 8613 | 19
从其它样品的情况看，这两家表现确实是最好的。尤其是圣湘看起来鹤立鸡群。无论是
否在官批群里。
【在 w********9 的大作中提到】
: 圣湘和达安那两家官批太厉害了，如果它们在那个超低浓度区的技术稳定的话
: 浓度只有每毫升128！其它样品是640和3千2，或者更高。
: 另外两家不知道是谁
: """""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
: 202010 号样本（128 copies/mL）共计 6 家实验室检出，2 家为圣湘生物、2 家为达
: 安基因、2 家为自建方法（实时荧光 PCR、数字 PCR 法各 1 家）。
|
w********9
发帖数: 8613 | 20 当然，除了试剂，实验室之间差别也会很大。也可能是用那两家的实验室的技术能力比
较强。
圣湘公司在广州，安达在中山。 |
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w********9
发帖数: 8613 | 21 官批的上海之江的表现在官批里是绝对的垫底，拖了官群的大大大后腿。复检率太高了。
其它的官批试剂都有95%以上的准确率（对几个高浓度样品的测试准确率基本是100%），
除了
对640浓度的以外（86%，但是圣湘差不多到了97%！神！）。 |
w********9
发帖数: 8613 | 22 大众化新闻报道里的
假阴性
和
假阳性
基本都是大众的概念：
测一个肺炎病毒样品，如果准确度是98%，那么大众化新闻很可能会说：假阴性是2%。
测一个非肺炎病毒样品，如果准确度是97%，那么大众化新闻很可能会说：假阳性是3%。
只涉及基本概率。p和1-p。
但这些不是对
一个未知类别的样品
应该用的概念。
在概率分析意义上的那两个东西很不同于大众观念。涉及条件概率。 |
w***x
发帖数: 1763 | 23 有些是因为国外的检测人员不够专业操作不符合标准造成的
国内也好，国外也罢，针对病毒的核酸检测应该不是一般医院的常规检测人员已经掌握
的技术，往往需要临时培训或招募有专业背景的检测人员
【在 m**x 的大作中提到】
: 很多国外的，贪便宜买的是测血液anti-body的试剂。这个便宜，而且出结果快。可是
: 很不准。尤其不能当开始诊断用。只能给已是病人的病愈后检查的
|
w********9
发帖数: 8613 | 24 好了
开始对准确度作概率分析
假设：
（将被测试的）人群中被感染率是p
也就是说，在人群中随机查到感染人的机会/概率是p
未感染人的比例是1-p |
w********9
发帖数: 8613 | 25 假设
对一个感染的人，试剂的测试准确率是q
不准确率是1-q |
w********9
发帖数: 8613 | 26 假设
对一个没被感染的人，试剂的测试准确率是r
不准确率是1-r |
w********9
发帖数: 8613 | 27 对一个特别好的试剂，
q和r都应该比较接近1，也就是说100%
对一个最糟糕的试剂，q和r都应该高于50%（投硬币的比例）。如果是低于30%了，那肯
定是把试剂用反了。（最近出过一个到处流传的的笑话性新闻，好像是20%-30%？）
也就是说：
q>0.5>1-r
r>0.5>1-q |
w********9
发帖数: 8613 | 28 p=1意味着样品/被测试人群被100%感染了
p=0意味着都没有被感染
那些是显然了
只是强调一下
各地的p相差极大
中国最后是多少？高于8/1600（见第10贴）。现在应该是千分之几甚至更低，但开始的
时候（特别缺试剂）应该有20%以上。
现在美国有不少州是20%以上。 |
w********9
发帖数: 8613 | 29 记住：这是一个数学模型。是理想化的。。。但通常会还是比较可靠的。
随机抽取了一个样品后
是感染样品的概率是p
正确测出是阳性的概率是pq
错误测出是阴性的概率是p（1-q）（假阴情况,type 2 error)
是非感染样品的概率是1-p
错误测出是阳性的概率是（1-p）（1-r）(假阳情况，type 1 error）
正确测出是阴性的概率是（1-p）r
总的错误概率是：p（1-q）+ （1-p）（1-r） |
w********9
发帖数: 8613 | 30 重新理一下：
正确测出是阳性的概率是pq
错误测出是阳性的概率是（1-p）（1-r）(假阳情况，type 1 error）
错误测出是阴性的概率是p（1-q）（假阴情况,type 2 error)
正确测出是阴性的概率是（1-p）r |
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w********9
发帖数: 8613 | 31 防疫抗疫更关心的是
假阴性概率
就只要考虑上贴里最后2项
假阴性概率是p（1-q）/【p（1-q）+（1-p）r】 |
w********9
发帖数: 8613 | 32 当测试阳性样品的准确度，q，接近100%时，测试的假阴性概率接近0
似乎提高q比提高r更关键
可以证明确实是
对那个概率求导，并且利用q和r都大于0.5.因此q+r大于1（前面都提到），就可以看出
提高q能更快地减低假阴性。 |
w********9
发帖数: 8613 | 33 当然，也不能忽视假阳性
否则可能会有不少非感染人被滞留在高感染区，而且占用不合自身情况的资源 |
w********9
发帖数: 8613 | 34 假阴性和假阳性其实是"对称"问题
"对称“转换是
p换1-p
q换r
有“对称”结论
解决两者中的一个问题，就相当于对称地解决了另外一个问题。 |
w********9
发帖数: 8613 | 35 现在来看具体数字
暂时定q=r
p=90%是中国大陆官准试剂准确度的标准底线。
P~-是假阴性概率
Perr是总的错误概率
P~+是假阳性概率
当q=r=0.5时，试剂毫无用处。
可以看出，当样品种阳性比例很低时（对应现实中几乎所有轻症和所有的疑似都被测试
的情况），假阴性很低（很难有病人漏网），但是假阳性很高（无辜者比例太高）。必
须通过其它方法或技术排除假阳性。其中一种办法是再次测试，也就是让1-P~成为下次测
试的p。
（现实中对阳性转阴的也是多次测试。武汉有的医院，不知是否全部，得连续三次阴而
且肺部吸收才可出院，隔离14天）。
“Remaining +’s"是阳性结果所占的比例
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
0.04 1 1 0 0 0 0.04
0.04 0.975 0.975 0.001067235859 0.025 0.380952381 0.063
0.04 0.95 0.95 0.002188183807 0.05 0.5581395349 0.086
0.04 0.925 0.925 0.003367003367 0.075 0.6605504587 0.109
0.04 0.9 0.9 0.004608294931 0.1 0.7272727273 0.132
0.04 0.875 0.875 0.005917159763 0.125 0.7741935484 0.155
0.04 0.85 0.85 0.007299270073 0.15 0.808988764 0.178
0.04 0.825 0.825 0.008760951189 0.175 0.8358208955 0.201
0.04 0.8 0.8 0.01030927835 0.2 0.8571428571 0.224
0.04 0.775 0.775 0.01195219124 0.225 0.8744939271 0.247
0.04 0.75 0.75 0.01369863014 0.25 0.8888888889 0.27
0.04 0.725 0.725 0.01555869873 0.275 0.9010238908 0.293
0.04 0.7 0.7 0.01754385965 0.3 0.9113924051 0.316
0.04 0.675 0.675 0.01966717095 0.325 0.9203539823 0.339
0.04 0.65 0.65 0.02194357367 0.35 0.9281767956 0.362
0.04 0.625 0.625 0.0243902439 0.375 0.9350649351 0.385
0.04 0.6 0.6 0.02702702703 0.4 0.9411764706 0.408
0.04 0.575 0.575 0.02987697715 0.425 0.9466357309 0.431
0.04 0.55 0.55 0.03296703297 0.45 0.9515418502 0.454
0.04 0.525 0.525 0.03632887189 0.475 0.9559748428 0.477
0.04 0.5 0.5 0.04 0.5 0.96 0.5 |
w********9
发帖数: 8613 | 36 对q=r=90%的情况，把上次测试的“阳性组”再做一次测试
假阴性升高到0.4%
假阳性降低到22.9%
Remaining是阳性测试结果所占比例
阳性组的人数其实已经大减了
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
0.2727272727 1 1 0 0 0 0.2727272727
0.2727272727 0.975 0.975 0.009523809523 0.025 0.06400000001
0.2840909091
0.2727272727 0.95 0.95 0.01935483871 0.05 0.1230769231 0.
2954545454
0.2727272727 0.925 0.925 0.02950819672 0.075 0.1777777778
0.3068181818
0.2727272727 0.9 0.9 0.03999999999 0.1 0.2285714286 0.
3181818182
0.2727272727 0.875 0.875 0.05084745762 0.125 0.275862069 0
.3295454545
0.2727272727 0.85 0.85 0.06206896551 0.15 0.32 0.
3409090909
0.2727272727 0.825 0.825 0.07368421052 0.175 0.3612903226
0.3522727273
0.2727272727 0.8 0.8 0.0857142857 0.2 0.4 0.3636363636
0.2727272727 0.775 0.775 0.09818181817 0.225 0.4363636364
0.375
0.2727272727 0.75 0.75 0.1111111111 0.25 0.4705882353 0.
3863636364
0.2727272727 0.725 0.725 0.1245283019 0.275 0.5028571429 0
.3977272727
0.2727272727 0.7 0.7 0.1384615384 0.3 0.5333333334 0.
4090909091
0.2727272727 0.675 0.675 0.1529411765 0.325 0.5621621622 0
.4204545454
0.2727272727 0.65 0.65 0.168 0.35 0.5894736842 0.
4318181818
0.2727272727 0.625 0.625 0.1836734694 0.375 0.6153846154 0
.4431818182
0.2727272727 0.6 0.6 0.2 0.4 0.64 0.4545454545
0.2727272727 0.575 0.575 0.2170212766 0.425 0.6634146342 0
.4659090909
0.2727272727 0.55 0.55 0.2347826087 0.45 0.6857142857 0.
4772727273
0.2727272727 0.525 0.525 0.2533333333 0.475 0.7069767442 0
.4886363636
0.2727272727 0.5 0.5 0.2727272727 0.5 0.7272727273 0.5 |
w********9
发帖数: 8613 | 37 2次都是阳性结果的数目几乎就是原来人数的4%。也就是最初“真实”的感染者比例。
下次换个p再作，看是否也“收敛”。 |
w********9
发帖数: 8613 | 38 用p=0.16
2次阳性的比例是0.228*0.6052631579=0.138484210
大概100人里找出13-14个阳性，漏掉2-3个阴性。
假阴性16%。应该对”阴性“的人要再做一次测试。 |
w********9
发帖数: 8613 | 39 用p=16%
q=r=95%
测两次会漏掉1-2人。（近1.5.） |
w********9
发帖数: 8613 | 40 因此，疫情较严重的时候，假阴性的危害更大。（其实是显然的。）但是一般都还没有
足够人物力顾及。 |
|
|
w********9
发帖数: 8613 | 41 在q=r的情况下，2次测试d假阴性概率是p。这点很容易证明。但是当p很低的时候，实
际上需要做二次测试的比例很低。 |
w********9
发帖数: 8613 | 42 上面说到，那只是理想化的数学模型
更接近的现实的模式是等效于把要被测试的人分成了组（虽然形式上不一定做了，客观
上通过分类处理相当于在做，或者在一定程度上在做）
轻症疑似
普通疑似
重症疑似
危重症疑似
每个组的p是不一样的
然后再分别用上面的模式，分别对待 |
w********9
发帖数: 8613 | 43 前面的那些测试样本都是新病毒和新病毒的亲戚病毒的样本。新病毒是SARS的姊妹。最开
始测试最早几个病人用的试剂就是测SARS的试剂。
都是同一个冠状病毒家庭的。选择它们做比较还是很合理的。更容易以假乱真。对另外
的病毒了解更深。因此是由于这个原因，排除它们是新病毒的准确度看起来比判断新病
毒的准确度高。
因此，下面我再用q |
w********9
发帖数: 8613 | 44 参照前面那些官方测试后
选择在
q=95%,
r=98%
附近 |
w********9
发帖数: 8613 | 45 q=r=95%
可能会用来做对照
p=4%
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
0.04 1 1 0 0 0 0.04
0.04 0.975 0.975 0.001067235859 0.025 0.380952381 0.063
0.04 0.95 0.95 0.002188183807 0.05 0.5581395349 0.086
0.04 0.925 0.925 0.003367003367 0.075 0.6605504587 0.109
0.04 0.9 0.9 0.004608294931 0.1 0.7272727273 0.132
0.04 0.875 0.875 0.005917159763 0.125 0.7741935484 0.155
0.04 0.85 0.85 0.007299270073 0.15 0.808988764 0.178
0.04 0.825 0.825 0.008760951189 0.175 0.8358208955 0.201
0.04 0.8 0.8 0.01030927835 0.2 0.8571428571 0.224
0.04 0.775 0.775 0.01195219124 0.225 0.8744939271 0.247
0.04 0.75 0.75 0.01369863014 0.25 0.8888888889 0.27
0.04 0.725 0.725 0.01555869873 0.275 0.9010238908 0.293
0.04 0.7 0.7 0.01754385965 0.3 0.9113924051 0.316
0.04 0.675 0.675 0.01966717095 0.325 0.9203539823 0.339
0.04 0.65 0.65 0.02194357367 0.35 0.9281767956 0.362
0.04 0.625 0.625 0.0243902439 0.375 0.9350649351 0.385
0.04 0.6 0.6 0.02702702703 0.4 0.9411764706 0.408
0.04 0.575 0.575 0.02987697715 0.425 0.9466357309 0.431
0.04 0.55 0.55 0.03296703297 0.45 0.9515418502 0.454
0.04 0.525 0.525 0.03632887189 0.475 0.9559748428 0.477
0.04 0.5 0.5 0.04 0.5 0.96 0.5 |
w********9
发帖数: 8613 | 46 q=95%
r=97.5%
p=4%
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
0.04 1 1 0 0 0 0.04
0.04 0.975 0.9875 0.00105374078 0.013 0.2352941176 0.051
0.04 0.95 0.975 0.002132196162 0.026 0.3870967742 0.062
0.04 0.925 0.9625 0.003236245955 0.039 0.4931506849 0.073
0.04 0.9 0.95 0.004366812227 0.052 0.5714285714 0.084
0.04 0.875 0.9375 0.005524861878 0.065 0.6315789474 0.095
0.04 0.85 0.925 0.006711409396 0.078 0.679245283 0.106
0.04 0.825 0.9125 0.007927519819 0.091 0.7179487179 0.117
0.04 0.8 0.9 0.009174311927 0.104 0.75 0.128
0.04 0.775 0.8875 0.01045296167 0.117 0.7769784173 0.139
0.04 0.75 0.875 0.01176470588 0.13 0.8 0.15
0.04 0.725 0.8625 0.01311084625 0.143 0.8198757764 0.161
0.04 0.7 0.85 0.01449275362 0.156 0.8372093023 0.172
0.04 0.675 0.8375 0.01591187271 0.169 0.8524590164 0.183
0.04 0.65 0.825 0.01736972705 0.182 0.8659793814 0.194
0.04 0.625 0.8125 0.01886792453 0.195 0.8780487805 0.205
0.04 0.6 0.8 0.02040816327 0.208 0.8888888889 0.216
0.04 0.575 0.7875 0.02199223803 0.221 0.8986784141 0.227
0.04 0.55 0.775 0.02362204724 0.234 0.9075630252 0.238
0.04 0.525 0.7625 0.02529960053 0.247 0.9156626506 0.249
0.04 0.5 0.75 0.02702702703 0.26 0.9230769231 0.26 |
w********9
发帖数: 8613 | 47 假阴性率和假阳性率都降了不少。
总体错误率从5%降到了2.6%。
因此当最需要被改进的准确度，测试新冠的准确度，q，碰到瓶颈时，提高排除其它病
毒以假乱真的准确度，r，可能会很有效的。 |
w********9
发帖数: 8613 | 48 前面说过：改进q比改进r对降到假阴性更有帮助
这是敏感性
97%时，假阴性是0.128%
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
0.04 0.94 0.975 0.002557544757 0.0264 0.3896103896 0.0616
0.04 0.95 0.975 0.002132196162 0.026 0.3870967742 0.062
0.04 0.96 0.975 0.001706484642 0.0256 0.3846153846 0.0624
0.04 0.97 0.975 0.001280409731 0.0252 0.3821656051 0.0628 |
w********9
发帖数: 8613 | 49 p=16%
q=r
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
0.16 1 1 0 0 0 0.16
0.16 0.975 0.975 0.004860267315 0.025 0.1186440678 0.177
0.16 0.95 0.95 0.009925558313 0.05 0.2164948454 0.194
0.16 0.925 0.925 0.01520912548 0.075 0.2985781991 0.211
0.16 0.9 0.9 0.0207253886 0.1 0.3684210526 0.228
0.16 0.875 0.875 0.02649006623 0.125 0.4285714286 0.245
0.16 0.85 0.85 0.0325203252 0.15 0.4809160305 0.262
0.16 0.825 0.825 0.03883495146 0.175 0.5268817204 0.279
0.16 0.8 0.8 0.04545454545 0.2 0.5675675676 0.296
0.16 0.775 0.775 0.05240174672 0.225 0.6038338658 0.313
0.16 0.75 0.75 0.05970149254 0.25 0.6363636364 0.33
0.16 0.725 0.725 0.067381317 0.275 0.6657060519 0.347
0.16 0.7 0.7 0.07547169811 0.3 0.6923076923 0.364
0.16 0.675 0.675 0.08400646204 0.325 0.7165354331 0.381
0.16 0.65 0.65 0.09302325581 0.35 0.7386934673 0.398
0.16 0.625 0.625 0.1025641026 0.375 0.7590361446 0.415
0.16 0.6 0.6 0.1126760563 0.4 0.7777777778 0.432
0.16 0.575 0.575 0.1234119782 0.425 0.7951002227 0.449
0.16 0.55 0.55 0.1348314607 0.45 0.8111587983 0.466
0.16 0.525 0.525 0.1470019342 0.475 0.8260869565 0.483
0.16 0.5 0.5 0.16 0.5 0.84 0.5 |
w********9
发帖数: 8613 | 50 下面是p=16%的情况
结合两组比较典型的p的情况，可以看出：现有官准试剂（除了一家）已经很可靠了，
但是继续改进到
97%左右会对抗疫，尤其是防疫，会有很大的帮助。
p q r P~- Perr P~+ Remaining +’s
【0.16 0.95 0.95 0.009925558313 0.05 0.2164948454 0.194】
0.16 0.94 0.975 0.01158580739 0.0306 0.1225204201 0.1714
0.16 0.95 0.975 0.009673518742 0.029 0.1213872832 0.173
0.16 0.96 0.975 0.007753816331 0.0274 0.1202749141 0.1746
0.16 0.97 0.975 0.005826656956 0.0258 0.1191827469 0.1762 |
