b*******r
发帖数: 1073 | |
b**u
发帖数: 2761 | 2 哦，呵呵，不太感兴趣，也没接触过，我就不搀和了。
metabolic
【在 b*******r 的大作中提到】
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b*******r
发帖数: 1073 | |
b**u
发帖数: 2761 | 4 代谢“组”学？嘛意思？drug metabolism? |
b*******r
发帖数: 1073 | 5 metabonomics: "the quantitative measurement of the multiparametric metabolic
response of living
systems to pathophysiological stimuli or genetic modification." |
l*****2
发帖数: 5 | 6 试一试HILIC？Lipid 会先出来。 看看这个：
http://www.nestgrp.com/pdf/Pp1/HILIC_metab.pdf#search=%22metabolomics%20%20HILIC%22
UPLC当然更好了，不过据说出峰很快, 你的MS 是TOF 还是 ion-trap? 老式ion-trap的
response恐怕是太慢了。 |
i****f
发帖数: 473 | 7 能不能推荐几个PI，我找了找都没找到，不知道是不是只有公司在做这些。 |
I******t
发帖数: 1619 | 8 我也在做相关方面的，大体是以UPLC-APPI-MS/MS来测定一些small molecule,做为疾病
诊断的biomarker，不知道该方面以后找工作如何？我想去pharma，当然如果能做
faculty也行，但是太累，怕不能胜任，呵呵。 |
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l*****2
发帖数: 5 | 9 不客气
化学手段用来收集数据. 数据量很大, 到后期, 数据处理就重要了. 我现在也是边做边
学. 麻烦的是没有像proteomics那样成熟的software tools. 逼急了只能自己写code,
用的时间就多了.
NMR vs. MS 我更看好MS. NMR 现阶段灵敏度太差了
【在 i****f 的大作中提到】
: 能不能推荐几个PI，我找了找都没找到，不知道是不是只有公司在做这些。
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i****f
发帖数: 473 | 10 多谢，我看了一下，感觉还是NMR，MS这些化学手段用得多一些。
【在 l*****2 的大作中提到】
: 不客气
: 化学手段用来收集数据. 数据量很大, 到后期, 数据处理就重要了. 我现在也是边做边
: 学. 麻烦的是没有像proteomics那样成熟的software tools. 逼急了只能自己写code,
: 用的时间就多了.
: NMR vs. MS 我更看好MS. NMR 现阶段灵敏度太差了
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K******S
发帖数: 10109 | 11 I attend a seminar quite some time ago, My feeling about APPI is that it's
fast, easy to operate, more tolerant to impurities, good for large amount of
analyte. Mostly used for chemical warfare related.
【在 l*****2 的大作中提到】
: 不客气
: 化学手段用来收集数据. 数据量很大, 到后期, 数据处理就重要了. 我现在也是边做边
: 学. 麻烦的是没有像proteomics那样成熟的software tools. 逼急了只能自己写code,
: 用的时间就多了.
: NMR vs. MS 我更看好MS. NMR 现阶段灵敏度太差了
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I******t
发帖数: 1619 | 12 LCMSMS2 (GCMS) :
不谢，我也是新手，还要多向你请教：）
我不是做Lipidomics，但是做的东西跟lipid的性质很相似，正如你说的，出峰慢，所
以老板让我用UPLC，可能会梯度洗脱，还没有开始，所以不知道行不行。不过我要是有
什么好的结果会跟你共享的。
你怎么解决的呢？
【在 l*****2 的大作中提到】
: 不客气
: 化学手段用来收集数据. 数据量很大, 到后期, 数据处理就重要了. 我现在也是边做边
: 学. 麻烦的是没有像proteomics那样成熟的software tools. 逼急了只能自己写code,
: 用的时间就多了.
: NMR vs. MS 我更看好MS. NMR 现阶段灵敏度太差了
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l*****2
发帖数: 5 | 13 要是已经拿到可以做PCA的东西，就不难了。
麻烦在于Data processing. 从LC-MS results （raw files) 到可以供PCA处理的表格
化的
数据"半成品"。
比如说这个问题：在Rt有漂移的情况下，如何确定不同样品给出了同一个峰呢？
Mannual processing 当然可以。不过要处理数百个样品，每个样品有数百个峰，
Mannual processing 就不太现实了。
MZmine 的介绍看上去不错. 可是用起来却不对劲. (version: 0.6,还是个beta版,再等
等也许好一点)
【在 I******t 的大作中提到】
: LCMSMS2 (GCMS) :
: 不谢，我也是新手，还要多向你请教：）
: 我不是做Lipidomics，但是做的东西跟lipid的性质很相似，正如你说的，出峰慢，所
: 以老板让我用UPLC，可能会梯度洗脱，还没有开始，所以不知道行不行。不过我要是有
: 什么好的结果会跟你共享的。
: 你怎么解决的呢？
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I******t
发帖数: 1619 | 14 我是新手，不熟，不过听说有现成的软件分析啊，基本上我会用PCA 的方法来做。
就懂这么多，目前，见笑，呵呵。
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【在 l*****2 的大作中提到】
: 不客气
: 化学手段用来收集数据. 数据量很大, 到后期, 数据处理就重要了. 我现在也是边做边
: 学. 麻烦的是没有像proteomics那样成熟的software tools. 逼急了只能自己写code,
: 用的时间就多了.
: NMR vs. MS 我更看好MS. NMR 现阶段灵敏度太差了
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I******t
发帖数: 1619 | 15 我是新手，不熟，不过听说有现成的软件分析啊，基本上我会用PCA 的方法来做。
就懂这么多，目前，见笑，呵呵。
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【在 l*****2 的大作中提到】
: 不客气
: 化学手段用来收集数据. 数据量很大, 到后期, 数据处理就重要了. 我现在也是边做边
: 学. 麻烦的是没有像proteomics那样成熟的software tools. 逼急了只能自己写code,
: 用的时间就多了.
: NMR vs. MS 我更看好MS. NMR 现阶段灵敏度太差了
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l*****2
发帖数: 5 | 16 我的印象是Academia人多。 制药公司才开始进入这个领域，有的大公司（Merck？记不
太清了）好像有十几个人的team。 雀巢好像也开始作metabolomics了
看看这个，希望能有帮助：
http://www.metabolomicssociety.org/boston2006/program.html
【在 i****f 的大作中提到】
: 能不能推荐几个PI，我找了找都没找到，不知道是不是只有公司在做这些。
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