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Physics版 - 外行问个MD的问题,牛人不要笑
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s*******h
发帖数: 113
1
不太懂MD,看paper看糊涂了。。。
bending的计算公式是U=sigma(k/2*(theta-theta0),这个求和求的是哪些角的和?
还有就是有没有可能通过求一个以一个原子为顶点所有角的bending(比如说甲烷中心
原子的三个H-C-H角,求和对位置求导来求这个原子的弯曲力?
m*********t
发帖数: 527
2
这个求和是有 convention 的,查一下 Z-Matrix 那个玩意儿。另外,(theta-theta0)
^2 肯定是要有 2 次方的。。。

【在 s*******h 的大作中提到】
: 不太懂MD,看paper看糊涂了。。。
: bending的计算公式是U=sigma(k/2*(theta-theta0),这个求和求的是哪些角的和?
: 还有就是有没有可能通过求一个以一个原子为顶点所有角的bending(比如说甲烷中心
: 原子的三个H-C-H角,求和对位置求导来求这个原子的弯曲力?

s*******h
发帖数: 113
3
那个2次方打的时候给忘了。。。多谢,我去查一下。。。
那就是说可以这样求单个弯曲力了?coare-grain的也可以吗?
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