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Statistics版 - Clustered Data能用GEE或Mixed Model吗?
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相关话题的讨论汇总
话题: data话题: clustered话题: 老鼠话题: 仔子话题: gee
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e***o
发帖数: 180
1
以前只接触过logitudinal data
感觉Clustered Data虽然有intra-cluster correlation需要model, 但没有with-in
subject factor,怎么把repeated的点联系起来。
比如说, 在longitudinal data, 每个subject都有时间这个with-in subject factor,
所以estimate的时候t=2, t=4, t=6, t=12这些时间点可以对起来。
但在clustered data,比如说同一个老鼠生的n个老鼠仔子,好像说老鼠仔子#1,
老鼠仔子#2,老鼠仔子#3,.....没有意义, 这里顺序只是编号没有任何实际意义。
有谁有这方面经验可以交流一下。
h***i
发帖数: 3844
2
GEE只要set correlation structure 即可。

factor,

【在 e***o 的大作中提到】
: 以前只接触过logitudinal data
: 感觉Clustered Data虽然有intra-cluster correlation需要model, 但没有with-in
: subject factor,怎么把repeated的点联系起来。
: 比如说, 在longitudinal data, 每个subject都有时间这个with-in subject factor,
: 所以estimate的时候t=2, t=4, t=6, t=12这些时间点可以对起来。
: 但在clustered data,比如说同一个老鼠生的n个老鼠仔子,好像说老鼠仔子#1,
: 老鼠仔子#2,老鼠仔子#3,.....没有意义, 这里顺序只是编号没有任何实际意义。
: 有谁有这方面经验可以交流一下。

s*r
发帖数: 2757
3
so here you have to specify a random effect instead of a repeated effect
e***o
发帖数: 180
4
within-subject factor怎么设?
在proc genmod 的 repeated statement下的withinsubject option
用default显然不对

【在 h***i 的大作中提到】
: GEE只要set correlation structure 即可。
:
: factor,

e***o
发帖数: 180
5
this makes sense for Proc Mixed. thanks
can somebody use GEE for clustered data, say using Proc Genmod, if the
response is not continuous?

【在 s*r 的大作中提到】
: so here you have to specify a random effect instead of a repeated effect
s*r
发帖数: 2757
6
proc glmmix

【在 e***o 的大作中提到】
: this makes sense for Proc Mixed. thanks
: can somebody use GEE for clustered data, say using Proc Genmod, if the
: response is not continuous?

d******3
发帖数: 93
7
你是说一共只有一窝老鼠仔的情况么?

factor,

【在 e***o 的大作中提到】
: 以前只接触过logitudinal data
: 感觉Clustered Data虽然有intra-cluster correlation需要model, 但没有with-in
: subject factor,怎么把repeated的点联系起来。
: 比如说, 在longitudinal data, 每个subject都有时间这个with-in subject factor,
: 所以estimate的时候t=2, t=4, t=6, t=12这些时间点可以对起来。
: 但在clustered data,比如说同一个老鼠生的n个老鼠仔子,好像说老鼠仔子#1,
: 老鼠仔子#2,老鼠仔子#3,.....没有意义, 这里顺序只是编号没有任何实际意义。
: 有谁有这方面经验可以交流一下。

e***o
发帖数: 180
8
不是。
一窝老鼠仔只是一个cluster,一共有N个cluster

【在 d******3 的大作中提到】
: 你是说一共只有一窝老鼠仔的情况么?
:
: factor,

d******3
发帖数: 93
9
那可以用compound symmetric的covariance matrix
就是假设所有窝里所有老鼠之间的correlation是一样的
SAS里还是用subject=来指定cluster,每个cluster里的每个obs都会被认为是一个不同
的老鼠
outcome如果不是连续的,dichotomous的话还是可以用genmod的,不是01的我没做过,
肯定可以用glimmix
不过glimmix有时候convergence有问题
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用什么可以画这个clustering 图? R?求教:How to analyze a categorized longitudinal outcome
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