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Statistics版 - GWAS前景
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话题: gwas话题: ngs话题: 前景话题: 基因突变话题: sequencing
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1 (共1页)
s**5
发帖数: 68
1
大家觉得GWAS的前景如何?
l*********s
发帖数: 5409
2
sounds promising
s****y
发帖数: 297
3
具体展开给说说?呵呵
l*********s
发帖数: 5409
4

next generation sequencing is becoming mature

【在 s****y 的大作中提到】
: 具体展开给说说?呵呵
r*****o
发帖数: 140
5
我感觉没啥前途了。
以后要么就是下一代测序,要么就是从表达调控上做文章了。
g********r
发帖数: 8017
6
next gen sequencing预处理更多,可以做的东西更多,计算方面很多和GWAS互通啊.
另外5000刀一个样本,又慢,短期内大规模实验用不上.
我觉得学过GWAS的人,只要再适应一下,以后还是一样有用武之地的.
问题不在于GWAS还是next gen,在于药厂会不会大规模使用这类技术.
h*****q
发帖数: 176
7
http://www.ebiotrade.com/newsf/2010-1/201018163713941.htm
五个“时髦”的生物技术被判死刑
这篇文章是在哗众取宠么,如果说这些技术不行,又不提出替代的方法
有人能找到原文么
个人感觉用NGS 来分析基因突变,是非常有前途的事
D******n
发帖数: 2836
8
original blog post.
http://www.xconomy.com/national/2010/01/06/five-biotechnologies
de-away-this-decade/?single_page=true

【在 h*****q 的大作中提到】
: http://www.ebiotrade.com/newsf/2010-1/201018163713941.htm
: 五个“时髦”的生物技术被判死刑
: 这篇文章是在哗众取宠么,如果说这些技术不行,又不提出替代的方法
: 有人能找到原文么
: 个人感觉用NGS 来分析基因突变,是非常有前途的事

g**********t
发帖数: 475
9
外行扯两句。
虽然现在貌似用GWAS灌水是个不错的选择,不过个人不看好远景。
我这个人比较悲观,我之所以不看好其远景,是因为人类种群中的遗传变异可能不足以
对数量性状进行高分辨率的精确定位(可能signal to noise ratio太小了)。如果这
一猜想是对的话,NGS并不见得能显著的提高GWAS的精确性。也就是说GWAS的问题可能
在于数据本身,而不在于现有技术。
g**********t
发帖数: 475
10
有兴趣的可以看一下下面这个online seminar,其中提出了一个假说解释现有的GWAS的
问题。
http://sackler.nasmediaonline.org.s3.amazonaws.com/2009/evo_hea
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M*********9
发帖数: 15637
11
俺观点类似。 没什么实用价值。 好骗钱罢了。

【在 g**********t 的大作中提到】
: 外行扯两句。
: 虽然现在貌似用GWAS灌水是个不错的选择,不过个人不看好远景。
: 我这个人比较悲观,我之所以不看好其远景,是因为人类种群中的遗传变异可能不足以
: 对数量性状进行高分辨率的精确定位(可能signal to noise ratio太小了)。如果这
: 一猜想是对的话,NGS并不见得能显著的提高GWAS的精确性。也就是说GWAS的问题可能
: 在于数据本身,而不在于现有技术。

h*****q
发帖数: 176
12
牛,多谢了

【在 D******n 的大作中提到】
: original blog post.
: http://www.xconomy.com/national/2010/01/06/five-biotechnologies
: de-away-this-decade/?single_page=true

h*****q
发帖数: 176
13
听不大懂

【在 g**********t 的大作中提到】
: 有兴趣的可以看一下下面这个online seminar,其中提出了一个假说解释现有的GWAS的
: 问题。
: http://sackler.nasmediaonline.org.s3.amazonaws.com/2009/evo_hea

h*****q
发帖数: 176
14
我是初接触这个方面的,为什么大家说这个方向前景不好呢
我前不久看到有CCR5△32缺陷基因的人对艾滋病有天然的抵抗力,这算不算是一种非常
有用的基因突变呢
如果基因突变有巨大意义的话,那么寻找和发现这些基因突变不是也很有意义吗
不管用的是什么技术,只要我们能找到疾病相关的基因改变,不管是先天遗传的,还是
后天造成的,不都是很有意义么

【在 g**********t 的大作中提到】
: 外行扯两句。
: 虽然现在貌似用GWAS灌水是个不错的选择,不过个人不看好远景。
: 我这个人比较悲观,我之所以不看好其远景,是因为人类种群中的遗传变异可能不足以
: 对数量性状进行高分辨率的精确定位(可能signal to noise ratio太小了)。如果这
: 一猜想是对的话,NGS并不见得能显著的提高GWAS的精确性。也就是说GWAS的问题可能
: 在于数据本身,而不在于现有技术。

r*****o
发帖数: 140
15
问题是GWAS的假设,common disease common variation,似乎不是那么美好……
g********r
发帖数: 8017
16
有了NGS,现在已经做到rare variance上去了。跟GWAS还是有不少互通的,尤其是基础
训练。

【在 r*****o 的大作中提到】
: 问题是GWAS的假设,common disease common variation,似乎不是那么美好……
r*****o
发帖数: 140
17

因为CDCV不灵了,所以把rare variation做进去了。所以我觉得NGS目前而言可能更有
前途一点。当然分析有些共同点,问题是NGS的数据实在是太恐怖了。

【在 g********r 的大作中提到】
: 有了NGS,现在已经做到rare variance上去了。跟GWAS还是有不少互通的,尤其是基础
: 训练。

e*****t
发帖数: 642
18
这个人连gwas的弱点在哪都没指出来,就光说这个不行,那个不行。【 在 hypergq (
sdafds) 的大作中提到: 】
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