r*****n
发帖数: 972 | 1 请教大家，在gene expression analysis 中，如何collape probe set into just one
gene value. 看到有paper 是这样做的。。。
Practically speaking, we use a CDF which combined the probes as described
above, in combination with the aroma.affymetrix R library. Similar CDFs can
be obtained from the AffyProbeMiner website.
谁有这方面的经验，可以解释一下，或者提供一下aroma.affymetrix的code啊，多谢多
谢！ | d*******e
发帖数: 1649 | 2 你需要cdf的文件，基本上可以去affy的网站上download，其实就是一个annotation
file
one
can
【在 r*****n 的大作中提到】
: 请教大家，在gene expression analysis 中，如何collape probe set into just one
: gene value. 看到有paper 是这样做的。。。
: Practically speaking, we use a CDF which combined the probes as described
: above, in combination with the aroma.affymetrix R library. Similar CDFs can
: be obtained from the AffyProbeMiner website.
: 谁有这方面的经验，可以解释一下，或者提供一下aroma.affymetrix的code啊，多谢多
: 谢！
| r*****n
发帖数: 972 | 3 多谢，呵呵。这个CDF是不是要下载binary的，而且下载之后要放到aroma package里面
还是read到R里面?
哪里有example code 啊。谢谢了！
【在 d*******e 的大作中提到】
: 你需要cdf的文件，基本上可以去affy的网站上download，其实就是一个annotation
: file
:
: one
: can
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