n*****t
发帖数: 41 | 1 基本需要是，我们需要用一个软件来模拟基因型，然后再把模拟出来的数据整理成这个
软件接受的格式，再调用这个软件（同一个）来计算likelihood.因为需要做大量模拟
，所以需要用R来写段程序，不断的调用那个软件，同时把计算的结果保存下来。有人
知道怎么做吗？谢谢。 |
B******5
发帖数: 4676 | |
n*****t
发帖数: 41 | 3 谢谢楼上，这个system在windows下不能用吗？我看过这个command，还是不清楚他怎么
用的。我要调用的软件是merlin,不知道有没有人用过。 |
B******5
发帖数: 4676 | 4 没用过Windows做正事儿。。。
【在 n*****t 的大作中提到】
: 谢谢楼上，这个system在windows下不能用吗？我看过这个command，还是不清楚他怎么
: 用的。我要调用的软件是merlin,不知道有没有人用过。
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h**********1
发帖数: 155 | 5 I think you need to make a package in order to call other software within R.
Just like how people call C within R.
【在 n*****t 的大作中提到】
: 基本需要是，我们需要用一个软件来模拟基因型，然后再把模拟出来的数据整理成这个
: 软件接受的格式，再调用这个软件（同一个）来计算likelihood.因为需要做大量模拟
: ，所以需要用R来写段程序，不断的调用那个软件，同时把计算的结果保存下来。有人
: 知道怎么做吗？谢谢。
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p******m
发帖数: 353 | |
B******5
发帖数: 4676 | 7 那种不需要编成package，用dyn.load就好了
R.
【在 h**********1 的大作中提到】
: I think you need to make a package in order to call other software within R.
: Just like how people call C within R.
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n*****t
发帖数: 41 | 8 基本需要是，我们需要用一个软件来模拟基因型，然后再把模拟出来的数据整理成这个
软件接受的格式，再调用这个软件（同一个）来计算likelihood.因为需要做大量模拟
，所以需要用R来写段程序，不断的调用那个软件，同时把计算的结果保存下来。有人
知道怎么做吗？谢谢。 |
B******5
发帖数: 4676 | |
n*****t
发帖数: 41 | 10 谢谢楼上，这个system在windows下不能用吗？我看过这个command，还是不清楚他怎么
用的。我要调用的软件是merlin,不知道有没有人用过。 |
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B******5
发帖数: 4676 | 11 没用过Windows做正事儿。。。
【在 n*****t 的大作中提到】
: 谢谢楼上，这个system在windows下不能用吗？我看过这个command，还是不清楚他怎么
: 用的。我要调用的软件是merlin,不知道有没有人用过。
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h**********1
发帖数: 155 | 12 I think you need to make a package in order to call other software within R.
Just like how people call C within R.
【在 n*****t 的大作中提到】
: 基本需要是，我们需要用一个软件来模拟基因型，然后再把模拟出来的数据整理成这个
: 软件接受的格式，再调用这个软件（同一个）来计算likelihood.因为需要做大量模拟
: ，所以需要用R来写段程序，不断的调用那个软件，同时把计算的结果保存下来。有人
: 知道怎么做吗？谢谢。
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p******m
发帖数: 353 | |
B******5
发帖数: 4676 | 14 那种不需要编成package，用dyn.load就好了
R.
【在 h**********1 的大作中提到】
: I think you need to make a package in order to call other software within R.
: Just like how people call C within R.
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F*******7
发帖数: 405 | |
