a*******g
发帖数: 80 | 1 最近课题
1要评估诊断方法，我计算了sensitivity 和 specificity，有没有什么staistics 可
以综合评估这个诊断方法 比如把这两个%加起来 感觉有点扯啊
2 我们想比较这个诊断方法在不同病人身上的表现 我打算计算每个小组的
sensitivity 和 specificity 然后分别有chisq检验 可以吧 因为各小组病人不重叠(
比如 男病人和女病人) 满足indenpendent原则 但是如果病人在不同小组有重叠该怎么
检验呢 比如胖的病人和男的病人 其中必然有些男胖病人 该怎么办
2如果比较不同的诊断方法 1和2 病人都是同一群 该用什么检验方法 mcnemar 比较
paired data 但和这个没关呀
听听大拿们的建议
多谢！ |
t*****a
发帖数: 459 | 2 1. 可以用类似比较AUC的方法（binary的图有另外个名字忘了叫啥了）。不过确实比较
扯。这个主要还是要看诊断目的是更重视多发现病案还是多避免false positive，和病
的严重程度等都有关。
2. 可以用regression的方法， Margaret Sullivan Pepe的书，the statistical
evaluation of medical tests for classification and prediction里有讲。这本书
是研究diagnosis很经典的一本书。
3. 就是mecneymar, 可以古狗一下，Pepe那本书里也讲了。 |
t*****a
发帖数: 459 | 3 补充下，3用mecneymar的话前提是两个诊断不是 one nested in the other |
a*******g
发帖数: 80 | 4 谢谢回复。是两个平行的diagnosis。同意你的意见一 其实sensitivity 和
specificity 是看不同方面 这个我们文章中也有讨论 但是医生还是希望statistician
告诉说综合看那个好
还有你说得这个test 就是mcnemar test还是另外一个test？ 我也常常跟着读音拼错这
些名
突然想到一个办法 把病人重新code成TP，TN，FN，FP，然后把两种诊断的新data用
mcnemar test 是不是可行呢？
【在 t*****a 的大作中提到】
: 补充下，3用mecneymar的话前提是两个诊断不是 one nested in the other
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t*****a
发帖数: 459 | 5 嗯对，就是mcnemar，前面拼写错了。
和医生吧，我觉得不能他们要什么就给他们什么，要跟他们讲道理。实在讲不过，把他
们要的东西给了，也得把这个东西的局限性反复说清楚。不过统计师和医生的交流难度
好像是个永恒的问题 :-p
关于诊断这个，和医生的一个交流办法是，问他们，愿意用多少个false positive换多
一个true positive。比如癌症，如果要开刀诊断，有的情况下医生就会觉得，白开30
个病人得到1个true positive他们就很满意。如果手术伤害很大的情况，可能医生就会
觉得，白开10个病人得到1个true positive他们就会满意。这样再换算出一个评价
specificity和sensitivity的公式来。 |
t*****a
发帖数: 459 | 6 mcnemar那个操作很简单，就是sensitivity只用disease positive的病人，
specificity只用disease negative的病人，都不是用全体。 |
a*******g
发帖数: 80 | 7 说得对！
30
【在 t*****a 的大作中提到】
: 嗯对，就是mcnemar，前面拼写错了。
: 和医生吧，我觉得不能他们要什么就给他们什么，要跟他们讲道理。实在讲不过，把他
: 们要的东西给了，也得把这个东西的局限性反复说清楚。不过统计师和医生的交流难度
: 好像是个永恒的问题 :-p
: 关于诊断这个，和医生的一个交流办法是，问他们，愿意用多少个false positive换多
: 一个true positive。比如癌症，如果要开刀诊断，有的情况下医生就会觉得，白开30
: 个病人得到1个true positive他们就很满意。如果手术伤害很大的情况，可能医生就会
: 觉得，白开10个病人得到1个true positive他们就会满意。这样再换算出一个评价
: specificity和sensitivity的公式来。
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g**a
发帖数: 2129 | 8 这个就是alpha和beta啊。McNemar的NULL是 two marginal probability for each
outcome are the same. Pb=Pc. 这个对楼主需要的结论没有帮助吧？reject以后结论
是什么？Pb<>Pc? 这没用吧？确实需要根据医生的实际要求把这两个值和起来。 |
a*******g
发帖数: 80 | 9 我觉得可以啊 。如果只看positive(gs) patients， 那么marginal probability 不就
是两种diagnosis的 sensitivity吗。test pb=pc 不是正可以回答两个diagnosis方法
的sensitivity相同不相同的问题吗。如果不相同 那末就看看那个高 那个就好。或者
用one sided test。
欢迎大家指正。
【在 g**a 的大作中提到】
: 这个就是alpha和beta啊。McNemar的NULL是 two marginal probability for each
: outcome are the same. Pb=Pc. 这个对楼主需要的结论没有帮助吧？reject以后结论
: 是什么？Pb<>Pc? 这没用吧？确实需要根据医生的实际要求把这两个值和起来。
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b******2
发帖数: 654 | 10 Believe the positive or believe the negative method
【在 a*******g 的大作中提到】
: 最近课题
: 1要评估诊断方法，我计算了sensitivity 和 specificity，有没有什么staistics 可
: 以综合评估这个诊断方法 比如把这两个%加起来 感觉有点扯啊
: 2 我们想比较这个诊断方法在不同病人身上的表现 我打算计算每个小组的
: sensitivity 和 specificity 然后分别有chisq检验 可以吧 因为各小组病人不重叠(
: 比如 男病人和女病人) 满足indenpendent原则 但是如果病人在不同小组有重叠该怎么
: 检验呢 比如胖的病人和男的病人 其中必然有些男胖病人 该怎么办
: 2如果比较不同的诊断方法 1和2 病人都是同一群 该用什么检验方法 mcnemar 比较
: paired data 但和这个没关呀
: 听听大拿们的建议
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a*******g
发帖数: 80 | 11 没看懂
【在 b******2 的大作中提到】
: Believe the positive or believe the negative method
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b******2
发帖数: 654 | 12 https://books.google.com/books?id=sU1YBAAAQBAJ&pg=PT62&lpg=PT62&dq=Believe+
the+positive+or+believe+the+negative+method&source=bl&ots=4bTtyJE6Wi&sig=
imTcq8BftXZ8HJB9ZnGSoekJ89c&hl=en&sa=X&ei=SQ0sVb3ILqfnsATNi4GACQ&ved=
0CCcQ6AEwAQ#v=onepage&q=Believe%20the%20positive%20or%20believe%20the%
20negative%20method&f=false
【在 a*******g 的大作中提到】
: 没看懂
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