a********g 发帖数: 651 | 1 现在有data,里面有2个group 1和2,我想plot survival % difference。
就是说 survival1 减去survival2,然后difference vs follow up time 做图,要有
95% CI。找了半天R里面也没找到合适的package和function。
请大牛指点哈。
谢谢 |
p******1 发帖数: 79 | 2 https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survdiff.html
is this ok? I only searched a little on internet.
【在 a********g 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 现在有data,里面有2个group 1和2,我想plot survival % difference。 : 就是说 survival1 减去survival2,然后difference vs follow up time 做图,要有 : 95% CI。找了半天R里面也没找到合适的package和function。 : 请大牛指点哈。 : 谢谢
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a********g 发帖数: 651 | 3 survdiff will not work. you can get p value from it, but not the survival
rate difference.
Thanks though.
【在 p******1 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survdiff.html : is this ok? I only searched a little on internet.
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p******1 发帖数: 79 | 4 哦,你做的分析是不是 KAPLAN-MEIER CURVES analysis?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3932959/
他上边也有 difference rate confidence intervals
感觉这么popular 的东西,网上应该能找到现成的。要不然那么多博士。呵呵。
【在 a********g 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : survdiff will not work. you can get p value from it, but not the survival : rate difference. : Thanks though.
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a********g 发帖数: 651 | 5 现在有data,里面有2个group 1和2,我想plot survival % difference。
就是说 survival1 减去survival2,然后difference vs follow up time 做图,要有
95% CI。找了半天R里面也没找到合适的package和function。
请大牛指点哈。
谢谢 |
p******1 发帖数: 79 | 6 https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survdiff.html
is this ok? I only searched a little on internet.
【在 a********g 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 现在有data,里面有2个group 1和2,我想plot survival % difference。 : 就是说 survival1 减去survival2,然后difference vs follow up time 做图,要有 : 95% CI。找了半天R里面也没找到合适的package和function。 : 请大牛指点哈。 : 谢谢
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a********g 发帖数: 651 | 7 survdiff will not work. you can get p value from it, but not the survival
rate difference.
Thanks though.
【在 p******1 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/survival/html/survdiff.html : is this ok? I only searched a little on internet.
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p******1 发帖数: 79 | 8 哦,你做的分析是不是 KAPLAN-MEIER CURVES analysis?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3932959/
他上边也有 difference rate confidence intervals
感觉这么popular 的东西,网上应该能找到现成的。要不然那么多博士。呵呵。
【在 a********g 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : survdiff will not work. you can get p value from it, but not the survival : rate difference. : Thanks though.
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L*******R 发帖数: 105 | 9 就是三个time series并列作图么,直接用ggplot包含不同的level不行吗? |
L*******R 发帖数: 105 | 10 就是三个time series并列作图吧,用ggplot就可以啊 |
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L*******R 发帖数: 105 | 11 就是三个time series并列作图吧,用ggplot就可以啊 |
L*******R 发帖数: 105 | 12 就是三个time series并列作图吧,用ggplot就可以啊 |
L*******R 发帖数: 105 | 13 就是三个time series并列作图吧,用ggplot就可以啊 |
L*******R 发帖数: 105 | 14 一直说连接不上服务器,结果最后全发出来了... |
w*******9 发帖数: 1433 | 15 自己手动吧,survfit算出每个curve的值和variance,你再手动取差值,variance就是
俩variance的和,不过要注意前面的variance得是estimated survival function的
variance,因为默认不是这样的 |