j*****n
发帖数: 1781 | 1 Here is a question been asked...
先讨论一下第一题。我知道pivot的用法。但是这个考的好像和传统的不一样。我知道
的pivot一般都要和aggregate
function在一起用的。当然也可以不用aggregate function，但这样会有大量的null出
现。
我理解的题目意思是这样
1）把
colName1 colName2 colName3
s11 s12 s13
s21 s22 s23
s31 s32 s33
s41 s42 s43
变成
s11 s21 s31 s41
s12 s22 s32 s42
s13 s23 s33 s43
2） 然后用一个concate... 阅读全帖 |
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c*****e
发帖数: 1106 | 2 There are ROLAP and MOLAP, and some offerings try to combine them.
This thread seems to be more about a front-end mdx-based MOLAP.
There are logical MOLAP and physical(storage wise) MOLAP.
A physical MOLAP is well suited to build apps where you have a well defined
and finite space to perform analysis.
The good thing is that measures can be fully computed and stored for the
entire cube space to achieve great performance. Comparing to ROLAP, it
automatically handles the setup, management and navig... 阅读全帖 |
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e****7
发帖数: 4387 | 3
我也想听听有没有OLAP以外的办法。
另外想提的就是OMNITURE，和google analytics .
微软的OLAP应该不贵，性价比还不错。open source 的也有，如pentaho cube, 不过一
分钱一分货吧。
weblog 这玩意本身就是一个多维数据，用OLAP可以解决很多aggregation 的计算，
data mart 有十几个表就差不多了。什么dimension hierarchy, aggregation 让OLAP
来完成就容易多了。按照时间或其它的attribute 也狠容易建立partition, 所以
scaling 应该不是大问题。
如果公司请人做OLAP的话，帮我递个简历吧，短期的也行啊，哈哈 |
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u**d
发帖数: 211 | 4 我觉得这种 syntax 的设计目的
在于把 data operation 和 code 区分开来
linq 的一个目的就是使得 application program 和 db
更容易的整合起来
两个 lists 做 intersection，也许 list 指向的是 db 里的 table
也许都在 memory 里，也许一个在 memory 一个在 db 里，
在 linq 的 syntax 下，都是一致的
至于需不需要用 sql 等等，用户都不用操心
要说 underneath，但是同样的operator，底层实现完全可以不同
性能也会不同
比如 aggregation，在 multi-core 下，就可以平行 aggregate
自己真要实现起来，还是很 tedious
不过 c# 好像没这么智能
而且，如果操作的 array/list 也就 千八百个 elements
各个实现也都差不了多少 |
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u**d
发帖数: 211 | 5 我觉得这种 syntax 的设计目的
在于把 data operation 和 code 区分开来
linq 的一个目的就是使得 application program 和 db
更容易的整合起来
两个 lists 做 intersection，也许 list 指向的是 db 里的 table
也许都在 memory 里，也许一个在 memory 一个在 db 里，
在 linq 的 syntax 下，都是一致的
至于需不需要用 sql 等等，用户都不用操心
要说 underneath，但是同样的operator，底层实现完全可以不同
性能也会不同
比如 aggregation，在 multi-core 下，就可以平行 aggregate
自己真要实现起来，还是很 tedious
不过 c# 好像没这么智能
而且，如果操作的 array/list 也就 千八百个 elements
各个实现也都差不了多少 |
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d****i
发帖数: 1038 | 6 7600， ASR1k, cat6k 等等。
SP 方面aggregation, pre-aggregation的platform主要都是IOS的。
所以，不支持bgp-vpls对IOS的business有影响。 |
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t*******r
发帖数: 3271 | 7 //上一次的
Summary:
Per RFC 4271, Junos will tear down a BGP session upon receiving a malformed
UPDATE. The issue is that Junos may recognize optional, transitive
attributes that are not yet recognized by other vendors' routers. In this
case, non-Junos routers which don't recognize the attribute just pass the
UPDATE through with the Partial bit ON. Junos, however, would recognize the
path attribute and perform validation. If the packet has errors, a Junos
router will send a NOTIFICATION (Error code ... 阅读全帖 |
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x*********n
发帖数: 28013 | 8 1 交换机的根桥优先级是多少
Without System ID, default is 2^16/2=2^15=32768
with System ID。Only 12 bit as system ID, so it has to be the increment of 2
^12=4096
2 HSRP和VRRP的区别
主要区别。
Cisco propriety vs standard
Assign another virtual IP for communicate VS use one of the IP as virtual IP
3 BGP的wellknow参数和transit参数
well-known mandatory
AS_path
ORIGIN
NEXT_HOP
well-known discretionary
LOCAL_PREF
ATOMIC_AGGREGATE
optional-transitive
The Aggregator of the Route ( AGGREGATOR)
Community ... 阅读全帖 |
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m**k
发帖数: 290 | 9 $ traceroute 69.53.236.17
...
8 tge8-4.fr4.sjc.llnw.net (69.28.171.118) 39.253 ms 22.797 ms tge18-2.
fr3.sjc.llnw.net (69.28.172.54) 25.082 ms
9 netflix.tge7-4.fr4.sjc.llnw.net (69.28.179.74) 48.394 ms ve5.fr4.sjc.
llnw.net (69.28.171.210) 19.060 ms 29.856 ms
10 netflix.tge7-4.fr4.sjc.llnw.net (69.28.179.74) 31.160 ms 25.653 ms 24
.756 ms
11 te1-8.csrt-agg01.prod1.netflix.com (69.53.225.6) 22.401 ms 25.522 ms
xe-2-2-0-954.jnrt-edge01.prod1.netflix.com (69.53.225.26) 32.865 ms
12 ... 阅读全帖 |
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t*******e
发帖数: 684 | 10
generalization vs. aggregation (composition is a strong form of aggregation) |
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t*******e
发帖数: 684 | 11 Machine learning/data mining tools can do the job. Screening spam is another
use case, but much simpler. The challenge lies in the aggregate function.
To make ad hoc queries relying on an aggregate function that touches the
entire datastore real-time is really tough, if not impractical. |
|
c****e
发帖数: 1453 | 12 如果数据量非常大， 先在本地做一些cleanup和aggregation.可以自己搭db cluster.
根据数据和读写pattern, mongodb, Cassandra, hbase都考察一下。
public cloud对于serving非常有利。如果你的客户很多，可以把一些aggregated data
每个小时传上去，客户看看dashboard就可以了。如果需要drill down, 再redirect到
local.
NoSQL
cluster |
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|
c****e
发帖数: 1453 | 14 What you ask is an essential feature of monitoring: counter. So you can put
sample values, see the percentile curve and even build alert from there. It
seems your system is pretty primitive without such infrastructure. I won't
recommend you to write from scratch to build a monitoring system, efficient
logging and leveled aggregation are not trivial.
To have a quick fix, you can create a in-memory datatable and write some
simple code to hardcode your aggregation(min/max/average) and dump them to
... 阅读全帖 |
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c****e
发帖数: 1453 | 15 很多还都是把aggregated以后的数据放回relational DB用传统的方式出报表。
有的情况放在nosql数据库里面也就够了。比如geo的数据，一些visulization,每一步
都是简单的key查找，不需要关系数据库那么重的东西。
hadoop是比较慢，这些map reduce的系统都比较慢。实时的系统idea也差不多，关键是
在node level更有效的filtering,不但是query optimization,存储的结构也要改，像
是列存储，不同的值cluster在不同的file chunk里面。但是不管怎么样，你都必须有
global的aggregation,这个很麻烦。counter之类的还可以预处理。要是GROUP BY你是
绕不过去的。In-memory还有10G network能让这些变快些。
map-reduce系统加类SQL还有一个很大的问题，关于图的算法效率都很低，不是对所有
算法都适用。
Hadoop对于很多应用也是过于笨重，现在很多ML的算法都开始强调realtime, light
weight.象典型的recommendation,新出的s... 阅读全帖 |
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f********x
发帖数: 99 | 16 The world beyond batch: Streaming 101: A high-level tour of modern data-
processing concept
http://radar.oreilly.com/2015/08/the-world-beyond-batch-streami
by Tyler Akidau August 5, 2015
Editor’s note: This is the first post in a two-part series about the
evolution of data processing, with a focus on streaming systems, unbounded
data sets, and the future of big data.
Streaming data processing is a big deal in big data these days, and for good
reasons. Amongst them:
Businesses crave ever more tim... 阅读全帖 |
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d*******r
发帖数: 3299 | 17 请教，这个 processing server(data pre aggregation) 是指初步的数据处理吧?
比如这些ID来的数据，每分钟 aggregate 一次，有些fields去掉，可能有用的fields
保留.
这一步需要的数据处理能力很小, 不用轮子，基本手写点简单的逻辑就行?
streaming |
|
d***b
发帖数: 24 | 18 对求职网址和工具的一个小结
一、职位搜索网站i
1. www.Jobguideweb.com
2. , 此网站将Indeed和Simplyhired上的信息综合在一起，可以叫做advanced
aggregator, 用户可以在首页直接点击感兴趣的职位，尤其适合IT, engineering, web
,
finance等行业。
3. Indeed.com, simplyhired.com
这两个网站都是Job Search Aggregator, 将来自众多企业网站和招聘网站的信息综合
在一
起，信息比较全面。但也不是万全的，有的小公司或者小网站上的信息就不能被这两家
搜到。
4. Monster, careerbuilder, hotjobs
这就是传统的三大网站，不过已经是日趋衰落了，recruiting agency发布的信息的比
例越来
越高，这些机会大多是Contract. 但是这三个网站投递简历还是比较方便，在上面发布
简历也有
机会被Recruiter找到，但要经常update。
5. Linkedin
这个网站的求职功能日益增强，但是职位... 阅读全帖 |
|
T**********t
发帖数: 1604 | 19 TBE的pH是8.3左右，你的蛋白如果pI是5应该跑得没问题的。但是250kD确实太大了，8%
的胶可能浓度还是高了。你要不要试试用5%的胶或者干脆用Agarose胶跑跑？我没用过
Agarose胶跑蛋白但我知道是可以用的。另外你最好还是确认一下在这个条件下蛋白有
没有aggregation，可以用Analytical Ultracentrifugation来看蛋白的aggregation，
不过那个实验用的蛋白量比较大。 |
|
m*********s
发帖数: 1188 | 20 先说一下,俺对生物基本不懂..
求一个柱子的型号, 厂商, 可以分离Protein and Protein aggregates? 想分离的比较
好, 也就是希望跑的慢一点, band比较窄一点... Protein MW=150k, Protein
aggregates MW>500k.
还有, 怎么知道啥时候该收集啊? 往下滴的时候, 这玩意没有颜色又看不见...
谢谢, 大包子酬谢.. |
|
a***a
发帖数: 40617 | 21 那就要Q和S同時上樣，然後分別洗脫。但是還是我說的，你不知道哪個是那個（哪個
peak是aggregate）
你還要考慮不一定aggregate和150kd的在ion exchange上可以分開 |
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c*****e
发帖数: 436 | 22 能具体说说这什么含义麻？
我的蛋白质长细菌了？变性了？
什么是aggregate, 为什么要aggregate？这是从何判断的呢？
谢谢你！ |
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I*****y
发帖数: 6402 | 23 what sizing column did you use? I guess your proteins of interest have
aggregated without salt or DTT? The aggregated proteins behave like a huge proteins
that you find in the first few fractions.
glycerol |
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A******y
发帖数: 2041 | 24 Huh? You have x-ray crystal structure showing you that it is binding to the
DNA. The same paper also reconstituted the chromosome using DNA and
histone. In addition, you can see nucleosome with cryo-EM. In real
physical world, binding specificity is achieved through affinity, if you use
enough of DNA and enough random protein, they will bind except it has no
biological significance and just aggregation. To answer your question, even
BSA can shift a DNA gel if you used enough to aggregate th... 阅读全帖 |
|
b*******3
发帖数: 99 | 25 To denature, use a loading buffer with the anionic denaturing detergent
sodium dodecyl sulfate (SDS), and boil the mixture at 95-100°C for 5
minutes.
Heating at 70°C for 5-10 minutes is also acceptable and may be preferable
when studying multi-pass membrane proteins. These tend to aggregate when
boiled and the aggregates may not enter the gel efficiently.
http://www.abcam.com/ps/pdf/protocols/WB-beginner.pdf
Denature |
|
a****d
发帖数: 1919 | 26 depends on the size of cell aggregates. dual cells or triple cells are fine
for cell sorting. But big cell aggregates can't pass through and may get
machine jammed. |
|
a****d
发帖数: 1919 | 27 I do use 45um filter to filter through the lysate before preparing the rest
procedures. I guess you can collect smaller aggregates less than certain
diameters.
The other thing is the purity of your cells. If the lysate is prepared from
heterogeneous population, where cells have different sizes, than you have to
be careful to isolate large cells and small aggregates. |
|
W*******a
发帖数: 1769 | 28 你要tweak FACS才能收集aggregate，因为它default是要把所有不是single cell
event都排除掉的。此外cell aggregate形状不规则，你很难收集一个homogenous的
sample，会有很大的样本偏差。如果你规定只收集2 cell的，倒是还可能比较纯
sort? |
|
o**d
发帖数: 3080 | 29 pubmed: Gong Zhang, Zoya Ignatova
1.Polyglutamine expansion alters the dynamics and molecular architecture of
aggregates in dentatorubropallidoluysian atrophy.
Hinz J, Lehnhardt L, Zakrzewski S, Zhang G, Ignatova Z.
J Biol Chem. 2012 Jan 13;287(3):2068-78. Epub 2011 Dec 1.
PMID:
22134925
[PubMed - in process]
2.Length-dependent translation of messenger RNA by ribosomes.
Valleriani A, Zhang G, Nagar A, Ignatova Z, Lipowsky R.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2011 Apr;83(4 Pt 1):04... 阅读全帖 |
|
l**********1
发帖数: 5204 | 30 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21050804
浮黴菌門
Isosphaera屬
//hamap.expasy.org/proteomes/ISOPI.html
Species: Isosphaera pallida (strain ATCC 43644 / DSM 9630 / IS1B)
Species code: ISOPI
Taxonomy: Bacteria; Planctomycetes; Planctomycetia; Planctomycetales; Planctomycetaceae; Isosphaera
(TaxID: 575540) [NEWT/ NCBI]
Description: Isosphaera pallida strain IS1B was isolated from a hot spring in Kah-nee-tah, Oregon, USA.
It is the only budding bacterium known to glide and the only heterotrophic bacteriu... 阅读全帖 |
|
l**********1
发帖数: 5204 | 31 Sure
please go to
HTTPS//www.rocq.inria.fr/bang/research.html
>
Research topics of the BANG project, briefly reviewed:
partial differential equations, ordinary differential equations,
methods of statistical physics, numerical algorithms and applications to:
Cell division cycle modelling for healthy and cancer cells
Aggregation-fragmentation models for prion and Alzheimer's diseases (ANR TOPPAZ)
Cell chemotaxis and cell aggregation (in French)
Molecular cancer pharmacotherapy and its optimisation... 阅读全帖 |
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i***0
发帖数: 160 | 32 If you dilute the high concentration protease to low concentration its
activity increase, then the decreased activity at high concentration is
reversible, which is good. It might due to the storage buffer you use for
concentration not friendly for the activity of the enzyme, or reversible
oligomerization that enclose the active site.
If you dilute the high concentration protease and can not restore the
activity you have seen while it is at low concentration, it is possible,
that it is aggregated... 阅读全帖 |
|
s******y
发帖数: 28562 | 33 听起来是你的两个蛋白会形成比较复杂的高聚物或者aggregate
有没有考虑过大大降低你的蛋白的浓度？
另外，一个方法就是把其中一个蛋白crosslink 到agarose 的表面，这样一样就不会
形成aggregate了，因为其中一个的分布浓度被强行固定了。 |
|
s******y
发帖数: 28562 | 34 一般来说。。。如果纯蛋白能溶的话，一般都是折叠正确了的。
当然也有例外。比方说如果带电量很强的话，有时候会出现所谓的soluble aggregate
，就是单独的情况下能溶解，但是一碰到什么核心立刻就纠缠起来沉了。
你这个情况听起来有点象这个情况。
既然你说了A蛋白用GST-bead的话会导致迅速aggregate, 你是否试验过把B蛋白先
cross-link 在什么bead 上，然后去结合低浓度的纯化之后的A? |
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C*******e
发帖数: 4348 | 35 我可能没说清楚
GST-A蛋白如果用GST resin的话是可以纯化,并且浓缩的
我是说如果GST-A,B共表达,用GST的magnetic beads做in vitro pull-down
上吸铁石,
很快beads变成一整片
没有办法吸吹
我不能说是A或者A+B aggregate了
是bead变成一整片无法分开
当然具体什么原因我不知道
aggregate |
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s********n
发帖数: 2939 | 36 只是猜测：你这种情况可能像ls有人提到的，形成A-B active complex比较复杂，或者
不稳定，易形成aggregation。可以试试，
1）in vitro reconstitution, 用很低的浓度做试验（ug/ml）；A和B在高盐浓度下的
稳定性如何？如果稳定的话，你可以试试在高盐（1 M even higher）条件下做混合，
高盐可能可以降低non-specific interaction形成aggregation的几率；
2）in vivo，你可以试试用weak promoters表达你的蛋白（Aw+Bw, Aw+Bm, Am+Bw; w,
weak, m, medium），lower temperature，coexpress chaparones。
不过个人更倾向于试in vitro的方法，in vivo的local concentration太高了即使在
low expression的条件下。
BTW: Chaperone的plasmid可以买Takara (Clontech)和Agilent (Stratagene). |
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c********n
发帖数: 225 | 37 谈谈和蛋白打交道的日子 （八）
第八篇 轮回
引子
主题构思于美国独立日，一个国家的生日。每一个新事物的产生，往往都伴随着老事物
的离去。日月轮回， 周而复始。这在LIVE乐队一首经典的Lighting Crashes MTV里，
有着令人心动的视觉体现。旋律混合着实验室几个人深夜coffee break的aroma，深深
印在脑海：
oh now feel it comin' back again
like a rollin' thunder chasing the wind
forces pullin' from the center of the earth again
I can feel it.
这次来简单思考一下轮回吧。
最近施一公与Sjors Scheres合作得到了4.5A 分辨率γ secretase的晶体结构， 和
amyloid生成相关， 涉及到了蛋白在体内轮回的重要性，特别是在neurological
diseases的集中体现。
蛋白aggregation是一点一滴积累起来的，一旦形成就很难被细胞正常的protein
degradation机制消化掉。大量垃圾... 阅读全帖 |
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v**********m
发帖数: 5516 | 38 http://m.f1000research.com/articles/3-291/v1
波士顿地区的千老联合会的报告，文章提到的问题非常典型和深刻，该文已经在圈内得
到了包括大佬们的极大肯定(恐惧)。
OPINION ARTICLE
Shaping the Future of Research: a perspective from junior scientists[v1;
ref status: approved 1, approved with reservations 1,http://f1000r.es/4ug]
Gary S. McDowell1*, Kearney T. W. Gunsalus2*, Drew C. MacKellar3, Sarah A.
Mazzilli4, Vaibhav P. Pai1, Patricia R. Goodwin5, Erica M. Walsh6, Avi
Robinson-Mosher7, Thomas A. Bowman8, James Kraemer9, Marcella L. Erb10, Eldi
Schoenfeld1... 阅读全帖 |
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M******g
发帖数: 152 | 39 Try not to heat up your protein samples in SDS loading buffer. Many
membrane proteins form aggregates even in SDS-loading buffer when they are
heated. 70 kd may be your protein aggregation. |
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M******g
发帖数: 152 | 40 Try not to heat up your protein samples in SDS loading buffer. Many
membrane proteins form aggregates even in SDS-loading buffer when they are
heated. 70 kd may be your protein aggregation. |
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d***b
发帖数: 24 | 41 1. www.Jobguideweb.com
此网站将Indeed和Simplyhired上的信息综合在一起，可以叫做advanced
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, finance等行业。
3. Indeed.com, simplyhired.com
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在一
起，信息比较全面。但也不是万全的，有的小公司或者小网站上的信息就不能被这两家
搜到。
3. Monster, careerbuilder, hotjobs
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例越来
越高，这些机会大多是Contract. 但是这三个网站投递简历还是比较方便，在上面发布
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4. Linkedin
这个网站的求职功能日益增强，但是职位要求相对比较高。
1) 此网站有职位搜索功能，搜到的很多职位也... 阅读全帖 |
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B*****n
发帖数: 654 | 43 Spectroscopic properties of decacyclene assembled in Langmuir Blodgett film
mixed with stearic acid
By Acharya, Somobrata; Parichha, Tapan Kr.; Talapatra, G. B.
From Molecular Crystals and Liquid Crystals Science and Technology, Section
C: Molecular Materials (2000), 12(1), 91-100. Language: English, Database:
CAPLUS
Langmuir Blodgett (LB) films of nonamphiphilic decacyclene were prepd. by
mixing with stearic acid. Surface pressure vs. area per mol. isotherms (π
- A) at different compns. are me... 阅读全帖 |
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f*******e
发帖数: 628 | 44 你说分不出来是因为你的 particle 都 aggregate 了，那把你的 powder 混在某种溶
剂里成悬浮液，然后 ultrasound, 就是帮助打散 aggregate。
crystalline |
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p****y
发帖数: 23737 | 45 【 以下文字转载自 Wisdom 讨论区 】
发信人: aggregate (Aggregate), 信区: Wisdom
标 题: Re: 姓倪的其实中医的错挺多
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Dec 9 00:16:29 2009, 美东)
瞎猫也能抓住老鼠，偶尔有效的还说不定是心理暗示其作用了。
另外补充一下，糖尿病中医是没办法的。 |
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d***b
发帖数: 24 | 46 对求职网址和工具的一个小结
1. www.Jobguideweb.com
, 此网站将Indeed和Simplyhired上的信息综合在一起，可以叫做advanced
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1) ... 阅读全帖 |
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d***b
发帖数: 24 | 47 1. www.Jobguideweb.com
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z********u
发帖数: 30 | 48 Quote"My definition is, therefore, as follows: Men are involuntarily
unemployed if, in the event of a small rise in the price of wage-goods
relatively to the money-wage, both the aggregate supply of labour willing to
work for the current money-wage and the aggregate demand for it at that
wage would be greater than the existing volume of employment."
I am a little confused about his logic, who can tell me that.. |
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