n*******r
发帖数: 1484 | 1 "PNAS最近也太杯具了，人人都要踩上几脚",请问这是发生了什么状况？
两杂志的以后的走向如何？想听听大家的意见.
次于CNS及NEJM排第五, Total Cites （3 years）排第一，说明上面还是有不少好东西
的，只不过是有些灌水的和冷门领域的文章把杂志的整体水平给拉下去了。相比之下
PLoS biology好像八九点钟的太阳，不知道未来PNAS还有没有翻盘的可能。看来可以先
试试 PLoS biology了，不行再上PNAS，然后PLoS one. |
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j********i
发帖数: 143 | 2 Paper列在publicatin list上谁知道是direct submission 还是 contribution
submission or prearranged editor。简历上怎么区分？
另外，我觉得如果把PNAS上biology方向的paper单独拿出来算impact factor应该比
current biology高很多吧。高人能估计以下有多少吗？ |
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s*******1
发帖数: 40 | 3 我是搞计算出身的，对生物的insight不是很强。最近看了一些synthetic biology的
paper，比较看好这个方向。觉得应该是将来的发展方向。但不知道这个领域的计算问
题多不多，还是基本上等同于bioinformatics+system biology?
想知道大家的看法。谢谢！ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 4 RE: LD
LZ 是计算数学PhD
你给他推荐
//elowitz.caltech.edu/publications.html
那样的papers
你不会想让其回大三学理论和做实验吧
plus
[回复] 要有针对性 不是通论
[ 6 ]
发信人: sailor321 (sailor), 信区: Biology
标 题: Re: 关于synthetic biology
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Feb 14 14:45:10 2012, 美东)
谢谢各位的回复！
有没有跟算法，图论，组会优化相关的例子？
------ |
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B******s
发帖数: 52 | 5 fundamental limits on suppressing noise paper... I read them so many times..
.. you don't need to elaborate it
my study is not to use synthetic biology to suppress noise but to try to
figure out why it is there, and how dose it function I have
been in Johan Paulsson's class once. i still remember the words he said that (not
exactly but with same meaning)
even with such limits on suppressing noise, the specificity and robustness
does exist and behave quite in
order.
in any case, theoretica... 阅读全帖 |
|
d*****r
发帖数: 2583 | 6 It's not simply the problem of data-acquisition. Although I admit the bottle
-neck now for systems biology is data-acquisition.
In Financial systems, we have huge amount of data, you never need to fit a
line with only 3 data points from 3 cells as in biology. We have trading
tick data at exactly every milli second for every players in the whole world
financial markets.
but the problem still exists, no math can have predictive power in the
complexity system. No one can predict the price of next s... 阅读全帖 |
|
l**********1
发帖数: 5204 | 7 sorry
some parts contents at up floor paste is my misleading.
from i am also 实验出身的 quit PhD already near one decade but six year later
try this Synthetic/Computational
biology/Mathematical/Systems/biology PhD,
Ps;
i just revised those contents now. |
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d***y
发帖数: 8536 | 8 synthetic biology就是为了忽悠纺锭而搞出来的东西。数学之类，用的到，但是要看
你咋用。 对N多学生物和微生物的人来说，synthetic biology就是不用P片段，自己合
成就行了，而且可以随意的改变ATCG。数学嘛，反正要干炫的，弄些理论啥的，用得到
。 |
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s*******1
发帖数: 40 | 9 我是搞计算出身的，对生物的insight不是很强。最近看了一些synthetic biology的
paper，比较看好这个方向。觉得应该是将来的发展方向。但不知道这个领域的计算问
题多不多，还是基本上等同于bioinformatics+system biology?
想知道大家的看法。谢谢！ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 10 RE: LD
LZ 是计算数学PhD
你给他推荐
//elowitz.caltech.edu/publications.html
那样的papers
你不会想让其回大三学理论和做实验吧
plus
[回复] 要有针对性 不是通论
[ 6 ]
发信人: sailor321 (sailor), 信区: Biology
标 题: Re: 关于synthetic biology
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Feb 14 14:45:10 2012, 美东)
谢谢各位的回复！
有没有跟算法，图论，组会优化相关的例子？
------ |
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B******s
发帖数: 52 | 11 fundamental limits on suppressing noise paper... I read them so many times..
.. you don't need to elaborate it
my study is not to use synthetic biology to suppress noise but to try to
figure out why it is there, and how dose it function I have
been in Johan Paulsson's class once. i still remember the words he said that (not
exactly but with same meaning)
even with such limits on suppressing noise, the specificity and robustness
does exist and behave quite in
order.
in any case, theoretica... 阅读全帖 |
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d*****r
发帖数: 2583 | 12 It's not simply the problem of data-acquisition. Although I admit the bottle
-neck now for systems biology is data-acquisition.
In Financial systems, we have huge amount of data, you never need to fit a
line with only 3 data points from 3 cells as in biology. We have trading
tick data at exactly every milli second for every players in the whole world
financial markets.
but the problem still exists, no math can have predictive power in the
complexity system. No one can predict the price of next s... 阅读全帖 |
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d***y
发帖数: 8536 | 13 synthetic biology就是为了忽悠纺锭而搞出来的东西。数学之类，用的到，但是要看
你咋用。 对N多学生物和微生物的人来说，synthetic biology就是不用P片段，自己合
成就行了，而且可以随意的改变ATCG。数学嘛，反正要干炫的，弄些理论啥的，用得到
。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 14 here you are:
A spatially distributed, signaling-transcription cascade robustly
discriminates between transient and sustained
ERK activities at the c-Fos system level:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20493519
Stimulus-dependent MAPKs, ERK1/2 and ERK5, in DRG, motor neuron:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21220101
Modeling review:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16482094
Modeling cancer review:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20836040
NGWet lab tools review:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21999828
Conclus... 阅读全帖 |
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z*****n
发帖数: 236 | 15 Here is the list:
Biology (6th Edition)
Publisher: Benjamin Cummings
Authors: Neil A. Campbell, Jane B. Beece
Culture of Animal Cells-A Manual of Basic Techniques (5th Edition)
Publisher: Wiley-Liss
Author: R. Ian Freshney
Clinical Chemistry-Principles, Procedures, Correlations (4th Edition)
Publisher: Lippincott Williams & Wilkins
Authors: Michael L. Bishop, Janet L. Duben-Engelkirk, Edward P. Fody
Cellular and Molecular Immunology (6th Edition)
Publisher: Saunders Elsevier
Authors: Abul K. Abb... 阅读全帖 |
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M******A
发帖数: 15 | 16 We are looking for a Scientist or Senior Scientist for a leading pharma
company's R&D center in Shanghai, China.
Main Responsibilities:
1. Works within a multi-disciplinary team of scientists to ensure successful
delivery of antiviral drug discovery program from exploratory to lead
optimization stage;
2. Initiate and execute research activities related to identification and
characterization of antiviral targets;
3. Design and implement various in vitro and in vivo studies to elucidate
molecular ... 阅读全帖 |
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A*******e
发帖数: 284 | 17 请问system biology到底是什么，怎么做，做出了那些成果了。 听了讲座 稀里糊涂的
，感觉尽在忽悠玩，现在的似乎流行整写math ， 这个那个whole genome regulation
network， modeling啥的。看这些讲座下结论那真是一个痛快，完全不care数据是否能
被验证，反正large scale biology， prediction 啥的，忍许犯些错误。说实话，我
真的很懒得去读那些公式。 |
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M******A
发帖数: 15 | 18 We are looking for a Scientist or Senior Scientist for a leading pharma
company's R&D center in Shanghai, China.
Main Responsibilities:
1. Works within a multi-disciplinary team of scientists to ensure successful
delivery of antiviral drug discovery program from exploratory to lead
optimization stage;
2. Initiate and execute research activities related to identification and
characterization of antiviral targets;
3. Design and implement various in vitro and in vivo studies to elucidate
molecular ... 阅读全帖 |
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O******e
发帖数: 4845 | 19 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 wass 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Mon Jul 23 00:05:56 2012)
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
由于 wass 在 Biology 版的 煽动灌水 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 14 天。
版主:Oncogene
Mon Jul 23 00:05:37 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 20 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 wf1994 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Wed Jul 25 21:09:32 2012)
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
由于 wf1994 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:Oncogene
Wed Jul 25 21:09:22 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 21 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 xiaoman0521 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Thu Jul 26 15:21:37 2012)
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
由于 xiaoman0521 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:Oncogene
Thu Jul 26 15:21:31 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 22 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
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标 题: Oncogene 封 zhanghan 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Thu Jul 26 15:24:13 2012)
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由于 zhanghan 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:Oncogene
Thu Jul 26 15:24:05 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 23 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
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标 题: Oncogene 封 sgwe00 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Thu Jul 26 15:25:59 2012)
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由于 sgwe00 在 Biology 版的 煽动灌水 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:Oncogene
Thu Jul 26 15:25:44 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 24 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
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标 题: Oncogene 封 jiaoshougege 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Thu Jul 26 23:18:20 2012)
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由于 jiaoshougege 在 Biology 版的 煽动灌水 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Thu Jul 26 23:17:58 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 25 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
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标 题: Oncogene 封 wf1994 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Jul 31 11:35:08 2012)
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由于 wf1994 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:Oncogene
Tue Jul 31 11:34:58 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 26 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
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标 题: Oncogene 封 xiaoman0521 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Jul 31 15:02:15 2012)
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由于 xiaoman0521 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Tue Jul 31 15:02:06 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 27 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 stopingtirne 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Fri Aug 3 20:03:51 2012)
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由于 stopingtirne 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Fri Aug 3 20:03:32 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 28 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
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标 题: Oncogene 封某版版主 Bestbeer 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Sat Aug 4 16:36:09 2012)
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版主:Oncogene
Sat Aug 4 16:36:03 2012 |
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p*****o
发帖数: 27 | 29 本科biology的 phd是computational biology 问下phd方向主要是computational
aided drug discovery 研究protein structure和 molecular dynamics
一下几个问题希望前辈们能给点建议
1.以后进industry希望大吗
2.还有就是如果做consultant的话 phd毕业就能做吗 咨询公司大概要求的学校排名多
少的呢 是看综合排名还是专业排名呢？如果要进咨询公司 现在需要做些什么准备呢？
3.如果毕业以后学法律也很看重学校排名吗 还是只要自己直接考lsat就可以？ |
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O******e
发帖数: 4845 | 30 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 X9810 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Sun Aug 26 02:08:04 2012)
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由于 X9810 在 Biology 版的 煽动灌水 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Sun Aug 26 02:07:36 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 31 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 Paulina 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Sat Sep 1 16:21:02 2012)
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由于 Paulina 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Sat Sep 1 16:20:51 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 32 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 dade 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Sun Sep 2 01:53:02 2012)
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由于 dade 在 Biology 版的 干扰版面讨论秩序 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Sun Sep 2 01:52:45 2012 |
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O******e
发帖数: 4845 | 33 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 whour 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Sun Sep 9 00:01:00 2012)
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由于 whour 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Sun Sep 9 00:00:52 2012 |
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m**z
发帖数: 787 | 35 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: mmzz (mmzz), 信区: Chemistry
标 题: 求Dupont referral:biochemistry/molecular biology scientist
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 9 15:29:00 2012, 美东)
发信人: mmzz (mmzz), 信区: Pharmaceutical
标 题: 求Dupont referral:biochemistry/molecular biology scientist
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 9 15:26:16 2012, 美东)
Thx. Please PM me if you can help |
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O******e
发帖数: 4845 | 36 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 nnynny 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Nov 27 11:42:58 2012)
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由于 nnynny 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 14 天。
版主:Oncogene
Tue Nov 27 11:42:41 2012 |
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A******y
发帖数: 2041 | 37 I don't know why you think the poster is saying he/she prefers medical
school. A lot of biology department due to their structures (more on plant
biology) will be really hard to apply for NIH R01. How can you tell? Just
look at if anyone of them are funded by NIH. NSF funding these days is bad.
..However, this is not true for Caltech, Stanford, and some of the big name
school. |
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O******e
发帖数: 4845 | 38 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 ahongbjzj 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Jan 22 11:56:52 2013)
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由于 ahongbjzj 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 14 天。
版主:Oncogene
Tue Jan 22 11:56:43 2013 |
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t*****z
发帖数: 1598 | 39 各位早上快乐！我们组做了个生信方法加软件，到了准备投稿的阶段。但是我们组是微
生物和生态学方向的，没有搞生信方法的经验，不清楚这一行的水深。稍微讨论了下，
想要先从Genome Biology试试，因为我们看到一些同类的方法发在这个上面。在此请教
各位，我们这种情况有什么需要注意的地方呢？会不会太好高骛远了些？Genome
Biology这杂志竞争激烈吗？从投稿到得到反馈大概要多久呢？谢谢！ |
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g*********s
发帖数: 350 | 40 【 以下文字转载自 EB23 讨论区 】
发信人: greattigris (I saw your body move), 信区: EB23
标 题: 求审稿机会， Cancer Biology的
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Feb 22 12:38:57 2013, 美东)
本人有非常多年的经验在Cancer Biology， Signaling， Transcription 领域。 渴求
审稿机会。望有需要审稿的，请给机会帮忙。 谢谢先！ |
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g*********s
发帖数: 350 | 41 【 以下文字转载自 EB23 讨论区 】
发信人: greattigris (I saw your body move), 信区: EB23
标 题: 求审稿机会， Cancer Biology的
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Feb 22 12:38:57 2013, 美东)
本人有非常多年的经验在Cancer Biology， Signaling， Transcription 领域。 渴求
审稿机会。望有需要审稿的，请给机会帮忙。 谢谢先！ |
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O******e
发帖数: 4845 | 42 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 usalaotu 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Sat Mar 30 01:15:58 2013)
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由于 usalaotu 在 Biology 版的 干扰版面讨论秩序 行为，
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版主:Oncogene
Sat Mar 30 01:15:46 2013 |
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O******e
发帖数: 4845 | 43 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 ZhChunxian 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Apr 2 22:23:20 2013)
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由于 ZhChunxian 在 Biology 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Tue Apr 2 22:23:13 2013 |
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j****f
发帖数: 19 | 44 恳求审稿机会
方向：
Cancer Biology;
Signal Transduction;
Carcinogenesis;
Cellular, Molecular and Tumor Biology
希望大家帮忙推荐一下，请站内私信联系，多谢 |
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O******e
发帖数: 4845 | 45 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 ZhChunxian 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Fri Apr 12 23:35:02 2013)
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由于 ZhChunxian 在 Biology 版的 言语粗俗 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Fri Apr 12 23:34:53 2013 |
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a****c
发帖数: 339 | 46 【 以下文字转载自 Faculty 讨论区 】
发信人: aortic (要么叫我英雄，要么就叫我胖子), 信区: Faculty
标 题: 求审稿机会 Cell biology
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Apr 23 12:14:58 2013, 美东)
用于绿卡申请。
关键字：cell biology/membrane trafficking/lysosomal function
曾经给3-4分的杂志独立审稿4次，帮老板审的10来次吧。
需要先看CV的请站内。先行谢过 |
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s******d
发帖数: 795 | 47 我最近投了一篇文章到Plos Biology.第一轮审稿不到一个月，第一个reviewer非常正
面。第二个reviewer比较负面，认为有个地方应该提供机理，但是对文章实验结果没有
提太多问题出一个小实验外，认为应该投其它专业杂志，我认为他的意见应该是
rejection。editor在咨询academic editor后给major revision，并在意见中说要做第
二个reviwer提出的一个小实验，期限两个月.我们一个月后提交revision，可能第二个
reviwer太忙，其实我们做拉他说的机理，老板在point to point letter中详细讨论拉
这个问题。除此之外，我们补拉他们所要求的两个小实验，但是8天后我看状态一直是
with editor。第一轮with editor后，第二天就是editor invited 和 under review.
投过Plos Biology的前辈们，这是啥情况啊？谢谢回复。 |
|
O******e
发帖数: 4845 | 48 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 kelianchong 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Fri Jul 26 00:55:42 2013)
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由于 kelianchong 在 Biology 版的 干扰版面讨论秩序 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Fri Jul 26 00:55:30 2013 |
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O******e
发帖数: 4845 | 49 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: Oncogene 封 chestburster 在 Biology 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Mon Jul 29 00:31:45 2013)
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由于 chestburster 在 Biology 版的 干扰版面讨论秩序 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 7 天。
版主:Oncogene
Mon Jul 29 00:31:39 2013 |
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S*********s
发帖数: 304 | 50 In focus: molecular and cell biology research in China
Xuebiao Yao, Dangsheng Li and Gang Pei
Abstract | An interactive, intellectual environment with good funding
opportunities is essential for the development and success of basic research
. The fast-growing economy and investment in science, together with a
visionary plan, have attracted foreign scholars to work in China, motivated
world-class Chinese scientists to return and strengthened the country’s
international collaborations. As a result... 阅读全帖 |
|
