b********d
发帖数: 720 | 1 你是说怎么知道-COOH是在最外面整齐地排列的吗？
不需要整齐排列吧？如果最外层是-COOH,methylene blue可以吸附，然后光谱能检测出
来，如果最外层是-OH,methylene blue不能吸附，UV-vis没有信号（其实应该还是会有
一点的，因为总是会有一点methylene blue会penetrate into deep layer,不过肯定比
最外层是-COOH的时候信号要弱很多）
反过来用光谱信号其实是可以推算出来有多少methylene blue分子吸收上去，进而推知
有多少-COOH的
还有问题麽？~~~ 多谢提问 呵呵 |
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m***n
发帖数: 266 | 2 或者是在水中的COOH的availability.
一方面结构里COOH密度要高，另一方面在水相时COOH available 的要多。
然后才好用这个COOH长peptide.
大家有什么建议吗？ |
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m***n
发帖数: 266 | 3 有没有可以购买的表面有COOH的PEU?
平面的？管子内表面有COOH的？
把COOH引
虑
。 |
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b********d
发帖数: 720 | 4 比如我有个film,一层是带有-COOH functional group的polymer A,另外一层是带有-OH
functional group的polymerB,两层mix的地方呢，可能还有一点复杂的hydrogen bond
and esteration interface
怎么表征这样的mix film？怎么确定某一层是-COOH还是-OH的那种polymer,而不是另外
一种polymer?
我先说说我思考和做的调研的心得（没做过FTIR,就是这礼拜和上礼拜读文献学习的，
所以可能理解还有不对的地方，如有，欢迎指正，谢谢）
1.hydrogen bond and esteration的问题都可以通过FTIR检测到，对比实验是纯的
polymer A and B,因为hydrogen bond的问题，C=O,O-H stretch vibration peak应该
都有一个红移现象，说明就有hydrogen bonding; A和B的脱水成酯呢，也可以检测，对
比是拿A+B完全成酯的物质做对比实验，通过检测C=O or C-O stretch vibration peak
... 阅读全帖 |
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m***n
发帖数: 266 | 5 多谢！你觉得他们这种方法好吗？其实我可以一步就用plasma deposition 把COOH引上去
。但是也
是不知道能达到满意的表面COOH密度。
改 |
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b**s
发帖数: 589 | 6 you want to increase COOH密度, maybe their method are better. Because
"一步plasma deposition" can only happen on the PU surface, while dextran
polymer chain can fold, so bring more COOH in.
去
么 |
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x*******2
发帖数: 5333 | 7 比如我有一个R-OH的物质，另外一个是R-COOH的，会形成R-COO-R吗？ |
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h********g
发帖数: 143 | 8 大家好，小弟在这里也来问一个-COOH与-OH反应的问题，
我花了挺久来重复一篇paper里面的一个反应，见下图
文章的link是
http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jo0518809
paper里面的产率高达98%，但是我做出来的却最高也只有50%。
主要的副产物经过分离纯化之后，NMR、IR、MS确认可能是两种结构，见下图两个ester。
可能是我的原料或者产物和作为溶剂的2-ethoxyethanol反应了。
我怀疑过可能是有氢离子催化的esterification。
我纯化过原料和solvent，也加过过量的K2CO3。但是也没有帮助。
各位大牛能不能指点一下，问题可能出在哪里？
我加的Cu/Cu2O在高温下容易从红色（Cu2O的颜色）变绿（有Cu(II)）。
这个也始终不知道为什么...
拜谢！ |
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h********g
发帖数: 143 | 9 谢谢哦，我也有想过换溶剂。但是带-COOH的反应倒是没有看到DMF的。其他溶剂要求的
温度都200+。
你能推荐一下你的ullmann coupling的文献么？
谢谢咯！！ |
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b********d
发帖数: 720 | 10 是的
XPS不行，我的film很薄，每层只有大概1nm，然后是两种polymer alternating in a
layer by layer way
XPS 采集到的深度有1-10nm，所以不能用来表征区分某一层
我找到了一个方法，用methylene blue,它会和-COOH结合，然后再用光谱采集
methylene blue的谱图 |
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w********h
发帖数: 12367 | 11 what's your question then?
how to increase density of -COOH, or is this a doable method? |
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m***n
发帖数: 266 | 12 是这样的，我们已经试过一种表面带COOH的polyurethane，但是效果不好，考虑怎么改进
提高。 |
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n******g
发帖数: 662 | 13 I did follow Pierce instructions for COOH to amine-protein link in water
solution using EDC/NHS activation or just EDC activation.
Its protocol did work well for polymer microbead-COOH and amine-protein
linking. But it seems not working if I change microbead-COOH to micelle-COOH.
I do see people using maleimide-PEG-Phosphilipid to react with thiolated
protein.
without |
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r*******6
发帖数: 545 | 14 新手要用aptamer，有几个问题不清楚，求问专家：
1）RNA aptamer中A，C和G三个碱基中都含有NH2基。看的文献中都用EDC/NHS和基地的
COOH反应，COOH岂不是除了和3'和5'修饰的NH2反应还要和aptamer上的NH2反应？这不
就破坏aptamer的功能了？
2）如果把基地的功能团是NH2,没找到有公司可以在aptamer的3'和5'修饰COOH。这是什
么原因，不好修饰？ |
|
r*******6
发帖数: 545 | 15 新手要用aptamer，有几个问题不清楚，求问专家：
1）RNA aptamer中A，C和G三个碱基中都含有NH2基。看的文献中都用EDC/NHS和基地的
COOH反应，COOH岂不是除了和3'和5'修饰的NH2反应还要和aptamer上的NH2反应？这不
就破坏aptamer的功能了？
2）如果把基地的功能团是NH2,没找到有公司可以在aptamer的3'和5'修饰COOH。这是什
么原因，不好修饰？ |
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S*****n
发帖数: 6055 | 16 http://www.sciencenet.cn/blog/Synthon.htm
说说碳纳米管表面氧化的两篇文章
这两年碳纳米管表面修饰方面做的文章很多，作者大都claim首先在表面上氧化形成
COOH集团，然后COOH就可以做各种化学反应接上各种好玩的东西了，这方面Tour JM等
同志已经做了很多。
今天我们不谈Tour，专门说说这个氧化的过程。很奇怪的是，很少有人讨论这个氧化的
过程，当然，这个东西也确实不好表征。。。最近的两篇文章倒是对此进行了一些讨论
，讨论的结果也很有意思。当然，这个结果对不对还是仁者见仁智者见智，但是至少可
以给我们一个很好的idea，呵呵。。。
Adv. Mater. 2007, 19, 883–887
The Role of Carboxylated Carbonaceous Fragments in the Functionalization and
Spectroscopy of a Single-Walled Carbon-Nanotube Material**
By Christoph G. Salzmann,* Simon A. Llewe |
|
S*****n
发帖数: 6055 | 17 ☆─────────────────────────────────────☆
Synthon (合成子·欢迎大家到化工版走一走看一看) 于 (Tue Sep 11 18:49:37 2007) 提到:
http://www.sciencenet.cn/blog/Synthon.htm
说说碳纳米管表面氧化的两篇文章
这两年碳纳米管表面修饰方面做的文章很多，作者大都claim首先在表面上氧化形成
COOH集团，然后COOH就可以做各种化学反应接上各种好玩的东西了，这方面Tour JM等
同志已经做了很多。
今天我们不谈Tour，专门说说这个氧化的过程。很奇怪的是，很少有人讨论这个氧化的
过程，当然，这个东西也确实不好表征。。。最近的两篇文章倒是对此进行了一些讨论
，讨论的结果也很有意思。当然，这个结果对不对还是仁者见仁智者见智，但是至少可
以给我们一个很好的idea，呵呵。。。
Adv. Mater. 2007, 19, 883–887
The Role of Carboxylated Carbonaceous Fragments in the Functionalizati |
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s****a
发帖数: 436 | 18 应该是这样的，测试表明，ZnSe-COOH 和 MNP-COOH之间就能有强的吸附。 |
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s****a
发帖数: 436 | 19 Thank you. Your suggestion is very helpful.
I agree the strong affinity between Fe2O3 and ZnSe-COOH.
I think I have two options:
1. try B-casein or BSA to block the surface of MNP-COOH.
2. Increase the surface DNA density to prevent the non-specific adsorption.
your
Did
to aggregate. |
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m****o
发帖数: 310 | 20 SAMs -COOH terminated. Want to break the H-bond between -COOH and water
molecules. |
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s****2
发帖数: 4569 | 21 Make it: Dye-NH2 + =COOH -> Dye-=
or Dye-COOH + H2N-= -> Dye-= |
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h*****h
发帖数: 264 | 22 查看EDTA的结构，看看有几个N,几个COOH
酸性是NH+,COOH还是N,COO-,能否配位?
大一化学的问题，居然都不懂，惊叹你的大学教育水平
？ |
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f*****n
发帖数: 93 | 23 小分子 cysteamine， 高分子 HS-PEG-NH2 都可以吧， 但是这两种分子都会在某种程
度上导致颗粒聚集。
你要是用 -COOH 和 -NH2 的coupling反应，只能是在颗粒上修饰 -COOH， 然后再连 -
NH2 group 的分子， 研究一下反应机理你就知道怎么回事了。
的大分子。在哪里可以买到？谢谢~ |
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k****o
发帖数: 728 | 24 I know, making NHS ester is easy. (-COOH + NHS or sulfoNHS at neutral pH,
30min). But, normally those commercial NHS ester has a spacer between the
resin surface and NHS, which allows further functionalization of the resin
with proteins. Anyway, any info. about 5~10 um -COOH resin is also
appreciated. |
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x*******6
发帖数: 994 | 25 Sorry, I can't input Chinese right now.
I did acid treatment of carbon in orde to get -COOH. Is that possible to
bond -COOH to H3BO3? Or -COO (-) to H3BO3?
Thanks |
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g*****x
发帖数: 3283 | 26 1)当然会反应，ACG在oligo合成时候分别用Bz, Ac和ib保护。除此之外，每一个ribose
的2'上的－OH也会反应。
2)这个修饰很显然得在rna oligo synth完成、脱保护/从CPG切割之前做，但很显然-
COOH的ester在随后用高浓度nucleophile脱保护/切除时就会被干掉。
3)综合以上两点，只在3'/5'做－COOH的ester基本上不可能。 |
|
d********l
发帖数: 1 | 27 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
【 原文由 dragonpool 所发表 】
要是谁能够访问Thermodynamics Research Center或者其他
物性数据库资源，请帮我找一下下面两种物质的
临界温度，临界压力，临界体积，偏心因子(Omega)，沸点
CH3-CH2-CH-COOH
|
Cl
(分子式：C4H7ClO2)
和
Cl
|
CH3-CH2-C-COOH
|
Cl
(分子式：C4H6Cl2O2)
多谢！ |
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m***n
发帖数: 266 | 28 我来抛块砖引玉.
我想你说的对表面有影响是说生物方面的吧?
就生物方面,对细胞和和蛋白质的影响最后都可以归结为对蛋白质的作用.
有人说-COOH and -CH3的charge difference may affect
the amount of adsorbed protein on surfaces as well as the
orientation/conformation of adsorbed protein, if it's
non-specific protein adsorption.
或者在某些情况下-COOH可以和protein的-NH2反应.
所以你的理解应该是generally right, but it should be considered in a specific
context. It is hard to define "inert". |
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s****e
发帖数: 2934 | 29 ☆─────────────────────────────────────☆
possible (yes) 于 (Thu Oct 19 14:07:12 2006) 提到:
而另外一些却是inert的？
不知道我这个理解是否正确，
比如，-CH3就不太有啥影响，
而一般来说-COOH之类的对表面就影响比较大？
☆─────────────────────────────────────☆
magon (跑龙套的科学工作者: Desperate Labguy) 于 (Thu Oct 19 17:13:47 2006) 提到:
我来抛块砖引玉.
我想你说的对表面有影响是说生物方面的吧?
就生物方面,对细胞和和蛋白质的影响最后都可以归结为对蛋白质的作用.
有人说-COOH and -CH3的charge difference may affect
the amount of adsorbed protein on surfaces as well as the
orientation/conformation of adsorbed protein, if it's
n |
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S*****n
发帖数: 6055 | 30 【 以下文字转载自 ChemEng 讨论区 】
发信人: Synthon (合成子·欢迎大家到化工版走一走看一看), 信区: ChemEng
标 题: 说说碳纳米管表面氧化的两篇文章
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Sep 11 18:49:37 2007), 转信
http://www.sciencenet.cn/blog/Synthon.htm
说说碳纳米管表面氧化的两篇文章
这两年碳纳米管表面修饰方面做的文章很多，作者大都claim首先在表面上氧化形成
COOH集团，然后COOH就可以做各种化学反应接上各种好玩的东西了，这方面Tour JM等
同志已经做了很多。
今天我们不谈Tour，专门说说这个氧化的过程。很奇怪的是，很少有人讨论这个氧化的
过程，当然，这个东西也确实不好表征。。。最近的两篇文章倒是对此进行了一些讨论
，讨论的结果也很有意思。当然，这个结果对不对还是仁者见仁智者见智，但是至少可
以给我们一个很好的idea，呵呵。。。
Adv. Mater. 2007, 19, 883–887
The Role of Carboxylated Carbonaceous |
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V2
发帖数: 91 | 31 如果用FT-IR来测的话，大致可以知道一些共价键的强弱，比如 C-O,C=O,O-H等，但其
实感觉location也不是很容易确定。一般来说表面含氧功能团，总有-COOH,-HC=O,-C-
OH 等等。我的问题是怎么区分FT-IR测出来的键，比如C=O键是属于－COOH还是属于-HC
=O ？ 看了好几天文献，没有想明白，请教各位～～～谢谢 |
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o****e
发帖数: 1011 | 32 EDC chemistry本身没什么，尤其人家把kit/protocol都弄好了话。
主要问题是比如你的interacting peptide上的那些COOH和该plate上的那些NH2（脱水）反
应后，其和你要测的蛋白之间的相互作用恐怕就已经和“原始的interacting peptide和
你要测的蛋白之间的相互作用”有很大差别了。。。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 33 氨基酸的定义就是NH2-CHR-COOH,
只要符合这个结构的都可以称为氨基酸。
并不一定需要是生物体里能够利用的那几种 |
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o****e
发帖数: 1011 | 34 参加反应的是Cysteine的side chain上的-SH。
（不必担心main chain上的-COOH或-CONH2）
the
i.
presented
. |
|
s******y
发帖数: 28562 | 35 另外，对于DNA而言，即使不存在DNA酶，在有足够的二价金属离子的情况下，也是可以
导致水解的。
一般认为DNA酶的作用是把镁离子放在一个最有利的位置从而加快这个水解过程。如果
用一个比方的话，如果说DNA酶是枪，那么镁离子就是子弹。
其实从一个化学的角度来说，大部分酶的作用无非就是把氨基酸侧链上的基团（COOH,
SH, OH,NH3, etc.)或者蛋白结合上的小分子（离子或者有机小分子)放到合适的地方让
他们进行水解或者合成（水解倒过来）反应而已。
比方说什么serine-protease, 无非就是用serine的侧链上的-OH来搞搞氢键什么的来促
进水解而已。 |
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n******g
发帖数: 662 | 36 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: nantsing (猛龙过江), 信区: Chemistry
标 题: Did anyone conjugate micelles with biomolecules?
发信站: BBS 未名空间站 (Sat May 3 01:44:19 2014, 美东)
Micelles were prepared by Phospholipid-PEG-COOH.EDC/NHS was used to activate
micelle surface to react with NH2-protein. However, never see the
conjugation is successful.
Very confused. Any suggestions? |
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A******y
发帖数: 2041 | 37 Are you sure the one you buy is not already activated? EDC activation
require anhydrous condition (just go search online). Once Osu-ester is form
, it can react with amine in aqueous condition. If you think it is the
micelle, then you have to re-think you sequence of reaction.
COOH. |
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g*****x
发帖数: 3283 | 38 R-NH2 + H+ -> R-NH3+
R-COOH + OH- -> RCOO- + H2O |
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q******n
发帖数: 8 | 39 我想在一种聚合物（苯环上挂一个氨基）上用氨基与一种含氟羧酸的缩合反应生长一层
SAM，即-NH2+-COOH->CO-NH+水.请问如何才能使得反应顺利进行？是否要加碱来控制PH
值？温度呢？我是化学的门外汉，对这些很迷惘，还望版上大侠指点迷津，越详细越好
，不胜感激！ |
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s****n
发帖数: 147 | 40 I got some mass spectra, some MS of fragments have 46, 30, 16 difference.
Please some advice, what is fragments are possible difference: 46: COOH?
30: CH3CH2?, 16: O?
Thanks a lot |
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s****n
发帖数: 147 | 41 30 possible -CH2NH2
difference.
COOH? |
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a********a
发帖数: 1229 | 42 请问一下PO(OH)2-(CH2)nCHO的CHO基团被氧化成COH败or被还原成COOH基团的电极电势
是多少?查了一下没有发现. |
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f*****g
发帖数: 237 | 43 【 以下文字转载自 NanoST 讨论区 】
发信人: freedog (POPPET), 信区: NanoST
标 题: 问一个单抗与颗粒连接的事情？谢谢
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jan 24 01:20:51 2010, 美东)
方法：
采用EDC(卜ethyl一3-[3-dimethylamin—
opropy1]carbodiimide hydrochloride)化学连接剂将单克隆抗体与DMSA[meso。2，3-
dimercaptosuccinic acid(HOOCCH(SH)一
CH(SH)一COOH)]修饰的USPIO相结合，形成具有免疫活性的分子探针。
求教： 如何检测抗体已经连到这个颗粒上了？
以及怎么算反应效率？
谢谢大家 |
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r****p
发帖数: 1854 | 44 啥溶剂？啥pH值？
非质子溶剂，COO- 又是质子化形式的话，可能会形成氢键吧？
1。增大pH值
2。用质子化溶剂，或者是加水（能混溶的话),让COOH和水分子形成氢键而不是分子间
氢键。 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 45
When DTT is more than a threshold, it will destablize QD, even dissolve your
QD.... try to mix low concentraiton of QD and high concnetration of DTT.
，所以我
this is right, this is call place-exchange,developed by RW Murray for AuNP
synthesis.
保护NPs导致稳定性增强。
when there is only DTT on QD surface, no charge repulse effect anymore? Did
you notice this change? Without charge repulsion, then it may be easier to aggregate.
And one more point, affinity between COOH and Fe is very strong, if your
magnetic |
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d******g
发帖数: 1073 | 46 我想活化 11-mercapto-undecanoic acid (MUA)的 COOH以便下一步和带NH2的材料进行
反应，请问可以用NHS,EDC在溶液里面和MUA反应吗？查了文献发现都是把 MUA吸附到金
的表面，然后再把这个金膜泡在NHS, EDC的溶液中。
如果谁能帮我找到这个方面的文献或者反应过程，包子答谢。 |
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z****y
发帖数: 6864 | 47 多谢楼上，
如果把CF3CO也脱掉的话，那NH2成了NH3的盐，怎么中和掉呢，因为COOH，又会成盐。
。。
郁闷啊。。 |
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s****2
发帖数: 4569 | 48 活化氨基? flying 氨基?
氨基 is already very reactive! you need a better leaving group for
-COOH |
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s****2
发帖数: 4569 | 49 "Fmoc或者Boc牌的超薄型" not good for big biomolecules, such as protein.
may be convert this "含有氨基的物质"(if small molecule) to COOH, further to
COOSu(or COOSu-SO3Na). Then react with 既含有氨基又含有羧基的物质(large
molecule). |
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h*****1
发帖数: 26 | 50 大家好！
我问一个问题：
-COOH 官能团可不可以看成是electronic donor呢？
因为 O上面有成对电子，我认为是，大家怎么看。
谢谢，希望给点建议！ |
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