w**n
发帖数: 244 | 1 heihei, 最全面的理论化学家之一. 居我所知他肯定没做过我做的.
以前佩服我师兄 Jurgen Gauss (3 年 PhD 18 篇文章), 不过他范
了两个抉择性的错误. 当年他愿意做chaos theory 的话估计已经
成大拿了. 现在他又不愿走DFT, 专于wavefunction 估计难了. |
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w***n
发帖数: 4358 | 2 ☆─────────────────────────────────────☆
flytutu (笨笨的爱) 于 (Sat Sep 10 12:44:50 2011, 美东) 提到:
祝大家中秋快乐～～
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somekiss (哎哟，不错喔～) 于 (Sat Sep 10 12:55:41 2011, 美东) 提到:
你奔个脚就给你吃
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Viaaa (大V) 于 (Sat Sep 10 14:05:56 2011, 美东) 提到:
排吧
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santorini (103/7) 于 (Sat Sep 10 16:54:00 2011, 美东) 提到:
谢谢
中秋快乐
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hunzaimeiguo (魂栽寐过) 于 (Sat Sep 10 ... 阅读全帖 |
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w***n
发帖数: 4358 | 3 ☆─────────────────────────────────────☆
wowowowo (life is a journey) 于 (Sat Dec 31 12:14:35 2011, 美东) 提到:
新的一年身体健康，万事如意
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macbookair (苹果妞) 于 (Sat Dec 31 12:30:56 2011, 美东) 提到:
Happy New Year, 老乡们！
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serena28 (Serena) 于 (Sat Dec 31 13:35:42 2011, 美东) 提到:
新年快乐！同乐！
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baoyuhong (yubao) 于 (Sat Dec 31 13:38:28 2011, 美东) 提到:
同乐！同乐！
☆─────────────────────────────────────☆... 阅读全帖 |
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m******n
发帖数: 6673 | 4 ☆─────────────────────────────────────☆
milkswan (好花堪折直须折) 于 (Fri Sep 9 07:56:52 2011, 美东) 提到:
明月易低人易散，归来呼酒更重看。
堂前月色愈清好，咽咽寒螀鸣露草。
卷帘推户寂无人，窗下咿哑唯楚老。
南都从事莫羞贫，对月题诗有几人。
－－苏轼《中秋见月和子由》
老乡们节日好，周末愉快
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JackJones (六-穷折腾-六) 于 (Fri Sep 9 08:45:25 2011, 美东) 提到:
re
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tuniu (俏大妈) 于 (Fri Sep 9 08:54:02 2011, 美东) 提到:
祝老乡们节日好，周末愉快！
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Dwayna (慢性子) 于 (Fri Sep 9 09:31:51 2011, 美东) 提... 阅读全帖 |
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a****5
发帖数: 10854 | 5 【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: wldft (dft), 信区: Joke
标 题: ZT 吐槽伦敦奥运[网文]
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 6 08:29:25 2012, 美东)
1：1812年，第二次独立战争爆发。
黑人威廉姆斯为了赢得自由，成为了一名光荣的美利坚民兵。
尽管他毫无畏惧地作战，但1814这一年，在英军的优势兵力下，华盛顿的防线一点点地
溃退。
枪声渐渐零落，远方，白宫的方向，熊熊的火光升腾而起。
撤出城外的民兵们哭了。威廉姆斯咬着牙齿，拿起了一杆枪，毅然向火光的方向走去。
“我必须和这座城市共存亡。虽然我们现在的首都被攻陷，虽然现在我们的军队被击溃
，但美利坚的精神不会消亡。总有一天，我们的星条旗会从伦敦的上空飘过。请把我的
话带给我的家人，这，就是我的使命，也将是威廉姆斯家族的使命。”
战友们目送他消失在一片火光中。一阵枪响，一切又归于沉寂。
在战争爆发整整200年后，一名名叫塞雷娜·威廉姆斯的运动员站在伦敦的一角，仰望
天空，流下了激动的泪水。
2：1948年，作为对战败国的惩罚，伦敦奥运会拒绝日本代表队参赛。
以观... 阅读全帖 |
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y***u
发帖数: 5243 | 6 非常intensive地使用linux。我们要用地很多library根本没有windows版本，因为
windows实在慢地发指。一抹一样地fft，dft代码，一抹一样地搜索地代码，windows能
跑个一天，linux就跑十几分钟，这种事情让我再也不用windows干活了，也不port任何
代码到windows了。eclipse在linux上面很难用，我也要写java，只用netbeans，主要
是swt太buggy。
我也很好奇，你既然知道怎么tweak，怎么会觉得ubuntu慢，因为你的经验和我身边大
多数人的经验完全相反。
Ubuntu
test |
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a***y
发帖数: 19743 | 7 ☆─────────────────────────────────────☆
Huxzz (GreenasGrass) 于 (Fri Sep 2 12:40:14 2011, 美东) 提到:
才用了一天就一堆的毛病！且不说一堆的软件不能用，crash的速度比leopard还快好几
倍, 搜狐输入法用两次选字栏就莫名其妙的消失了，重启也没用！！就说最基本的上
网功能都保证不了。
apple设计这么个鸟玩意，没光驱没网口，唯一的指望就是个wifi。现在好了，在学校
的公共网每隔30分钟必须掉线一次。显示连接都是好的，就是没数据，非得把airport
关掉再重开才行。而且这事就只有mba有，其他电脑一点事没有！老子花了1300多刀不
是买个花架子当摆设得，现在网都上不利索，你让老子整天重启机器玩啊！
上网搜了一下，尼玛抱怨的人绝对不在少数。从刚发售就有人说，尼玛这都快一年了，
还没解决呢？？看情况是软件硬件都有毛病，我看乔不死是怕被人吐沫星子淹死才匆匆
闪人了吧？
https://discussions.apple.com/thread/2664670?start=90&ts... 阅读全帖 |
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J*******3
发帖数: 1651 | 9 program is not written by me.
I run Siesta which is One of DFT.
commands I used is like this:
siesta < h2o.usercell.fdf > h2o.10Ang.out &
tail -f h2o.10Ang.out
The command line could not show up.
If I use
siesta < h2o.usercell.fdf > h2o.10Ang.out
Everything perfect fine! |
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w****g
发帖数: 44 | 10 Any body here developed the program for first-principles calculations ?
Such as DFT, HF ?
How are those programming compared to MD ? any books/other materials to
start with ?
Thanks |
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E*******1
发帖数: 3464 | 11 C++，fortran写的大规模并行程序多了，计算化学计算物理里面，都不是专业的码工，
几个商业code算DFT都是几十万行下来的mpi。有些人自己不会写就他妈说写会死人的，
搞笑 |
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a**********n
发帖数: 9 | 12 大家好，好不容易上坛子上请教个关于offer的问题，
手上两个小offer，一个是University of Tennessee Knoxville, 一个是University
of California Riverside，都是化工专业。由于个人比较倾向于理论计算，分子模拟
这块，不知道这两个学校的情况如何？
UTK的话，靠近Oak Ridge Lab，有着前三的超级计算机，我个人对高性能计算一直比较
有兴趣，有三个是搞计算的，目前可能觉得Prof.Keffer不错
UCR的话，位于加州地方好，系里就一个教授Prof. Wu是搞计算的，偏DFT，但是主页上
看来基本只招过中国学生，学生也偏少，有些小小担心。
两个学校化工排名都一般，50开外，不知道大家觉得哪个会稍微好些？
谢谢大家的帮助 |
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f*******U
发帖数: 19 | 13 Ab Initio and Classical Molecular Modeling of Energy Storage Materials
The Complex Fluids and Multiphase Transport Laboratory within the Department
of Mechanical Engineering and Mechanics at Drexel University is looking for
a well-qualified postdoctoral researcher to work on ab initio modeling of
energy storage materials. The candidate should have experience on
electrochemical energy storage materials. The candidate is expected to
collaborate with other graduate students who work on lattice-Bolt... 阅读全帖 |
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y****z
发帖数: 502 | 14 最常见的，DFT一般都是单参考方法。还有单参考CI、CC之类。
多参考方法一般是CASSCF以及后续的MRCI之类的，现在有人做MRCC，但实用的不多。 |
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p******a
发帖数: 582 | 15 这个区分我一直也不是很明了。但是HF是最典型的单参考体系(single reference)，此
外一般常见的correlation methods都属于单参考体系，如DFT,CISD,CCSD,MP2等。按照
我的理解就是单参照体系仅考虑系统的一种电子组态，比如仅考虑一个分子的单重闭壳
层状态，系统的关联能计算也都只针对这一组态，计算上源于HF得到的单行列式并保持
了与之一直的对称性。而多参考体系(mlulti reference)则考虑了不止一种电子组态，
体现于他的csf中还包括其他对成性的行列式，这种计算对于一些系统的能态简并度高
，能隙很小的体系很重要，应为体系的真实组成实际上是由各种电子组态共同混合而成
。最简单的多参考体系方法就是CASSCF，这个方法基本上就是在HF的基础上简单拓延而
来，使用者选定一个活性空间，在此空间内进行类似于完全组态互绕(full CI)的计算
，不同在于此计算中波函的系数和行列式本身都得到优化。在活性空间之外的部分则完
全等同于HF的方法，所以有着和HF一样的局限性。为了解决这一问题又产生了MRMP2,
MRCI, MRCC等方法，以获得活性空 |
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m****L
发帖数: 573 | 17 燃料电池里的issue非常多，电催化在低温燃料电池中很关键，另外一大块就是做
membrane。
DFT么？貌似化学里头的理论计算工作前景都不怎么乐观 |
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h********r
发帖数: 821 | 18 理论化学有几大坑，比如价键理论，AIM，DFT的基础问题等等，多年以来爆发几次口水
大战，成就了一批战士。争到后面都不是学术讨论了，没办法啊，有人的地方就有江湖
。 |
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c**r
发帖数: 51 | 19 谢谢您的解释，看来我曲解了Ayers的意思。问一下，如果以粒子数作为变量，DFT的化
学势是不连续的，如果将化学势作为一种properties,在Ayers的框架下，这个性质只能
不是transferable的（参考Lemma1)。所以必须把化学势排除在AIM所考虑的properties
之外。如果我的理解没有错误的话，这样做本身真的非常合理吗？ |
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h********r
发帖数: 821 | 21 我记得Davidson和他的关门女弟子做过类似的工作，你搜搜看吧。记不确切了，不好意
思。 |
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m**i
发帖数: 84 | 22 forget the C2v, try Broken Symmetry Approach and limit the symmetry to C1 to
singlet diradical
b2) |
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S*M
发帖数: 10832 | 25 DFT不错啊，感觉比较hardcore，我不太懂
可以应用在比较大的体系，这点很不错
我是做小分子动力学的
感觉和real world problem离得有点太远了
考虑博后要换个方向 |
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g*********n
发帖数: 808 | 26 太感谢了，胜读十年书呵！
为啥仁兄不建议Siesta 入门？本人是菜牛。我是作解析的。但就其前景和局限性来说
，是没法和DFT比的。所以就背着老板想练练。之所以选Siesta 是因为有免费的
software。 不可能让老板给掏钱买它不让干的东东。目前还不知道有任何其它的，且
易上手的软件包。 如若知道，敬请相告：-）
这么说Siesta 是很难入门的了？ |
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J*******3
发帖数: 1651 | 27 本人用SIESTA. 一个general的问题。
通常情况下，设计一个体系，假设选用了Atomic orbitals 作basis，用cutoff radius
和orbital撒数来控制计算精度。这时，那些控制planwaves 和realspace grid 的参
数们都不起作用了吗？换句话说，他们对计算没什么贡献了，对吗？ |
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J*******3
发帖数: 1651 | 28 为什么？ basis 的选择 通常有三个options：1） atomic orbital 2）plane wave
3） real space without basis。 他们不是平行的吗？ 我的意思是一旦用其中一个
，例如说 1， 那就是说我们用 atomic orbital 同展开 KS equation,另外两个以及相
关的参数在计算过程中就被neglected? 不对吗？ |
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e******g
发帖数: 29 | 29
架，这个是
啊哈，了解了一下，不是一回事：） |
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e******g
发帖数: 29 | 30
常是
用
在一个计算中采用什么基组跟你的体系无关，只跟你选用的软件，或者计算方法有关。
对bulk体系，平面波基组有天生的优势，但对低维材料来说，平面波基组相对于原子轨
道基组来说计算量比较大。
siesta是基于原子轨道基组的，它的参数貌似跟平面波cutoff之间没有很明显的联
系。这也是siesta缺少一种系统化提高精度的方法的原因之一。
不清楚siesta里哪个参数叫“energycutoff” |
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J*******3
发帖数: 1651 | 31 sorry, 它不叫energycutoff, 而是meshcutoff， 定义说是 planewave cutoff for
the grid?
既然不是用planewave, 为啥还有这个参数？
另一个问题是：在SIESTA 中用 super cell 不是为了使非周期性的东东具有周期性而
利用 planewave 吗？ |
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h********r
发帖数: 821 | 32 推荐看martin的书，siesta也有足够多的参考资料。 |
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e******g
发帖数: 29 | 33
cutoff for
性而
关于meshcutoff，这个问题貌似在别的帖子里回答过了，简单说就是siesta的
Hamiltonian可以分成两坨，其中双中心积分是在k空间做的，其他的在real space
做比较容易，但最后要把两块加起来。这里面需要一个Fourier变化倒来倒去。而
meshcutoff指定的是做FFT时的实空间格点密度。这个参数跟基组没有关系
siesta中会把所有的体系都当做周期性体系来算。但按你设置super cell的不同，你
的体系实际上不一定bulk，低维体系可以通过设定真空层来模拟。
程序用到了super cell 跟它用什么基组没有关系 |
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J*******3
发帖数: 1651 | 35 推荐看martin的书? 能不能把书的全名给一下，以便查找？感激涕凌！ |
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