t*****e
发帖数: 8 | 1 有没有人知道用什么simulate haplotype data for large number of marker loci
with LD? 或者哪里可以找到这种simulation tools？
我找了一些，但不是很符合要求，并且觉得不是很好找。有用过的，可不可以推荐一下
？或者知道的，也可给个建议。
多谢！ |
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D**g
发帖数: 739 | 2 case/Control 的CASE group 违反HWE，是不是应该用BAYESIAN estimation 求
HAPLOTYPE的FREQ？ 这种情况下应该怎么样test marker-trait association? 请高手
指点一二，不胜感激 |
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p*****d
发帖数: 16 | 3 I guess it would be same SAS proc haplotype procedure except you specify EST
= BAYESIAN instead of using default EM algorithm. |
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D**g
发帖数: 739 | 4 Once you use EST=Bayesian, you can't use trait statement to conduct marker-
trait association test. What should I do? I am going to use haplotype freq
estimated by Bayesian method to creat a new data set, then use logistic
regression or chi-squre test to do the analysis. But I am not sure if it's
correct or not.
If case or control group violated HWE, how should we do association analysis
in general? Any suggestions? Thanks
EST |
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a***r
发帖数: 420 | 5 随着deep-sequencing的发展，
感觉haplotype phasing & genotype imputation的一整套都终将日落西山啊，
最大的问题变成如何把小片段assembly起来，
原来的找tagSNP啊，shared IBD啊，基本都用不上了
唉，为了一个genotype imputation的课题读paper，读出这么个结论，黯然神伤啊
大家给说说？ |
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t*m
发帖数: 4414 | 6 We still have to phase the haplotype after NGS |
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h*i
发帖数: 3446 | 7 我都懒得查，这是很久以前的发现了。
就如别人说的，你错得没边了，连最基本的原则都搞反了。
一个haplotype在广泛的地理区域低频存在，说明一件事情：就是这个haplotype是这些
地区的原住民，在与后来者的竞争中失败了。如果同一haplotype在地理边缘地区高频
存在，就验证了这一事实，说明他们的主力被赶到了这些偏远地带。
这样的逻辑，用在了C， D上，现在用在N上，也是同样合适的。用在Q上，也是合适的。
haplotype在一个民族中高频发生，有两种可能，一种情况，他们是haplotype起源者，
另一种情况，他们是后来的征服者。
第一种情况，一般发生在偏远地区的小民族中，这些地区还必须是在该haplotype可能
的迁移路径上，而且高频起码要超过90%，我们才能确
认他们是起源者，否则说不清楚的。独龙族的O3属于这种情况。
第二种情况，在这一民族中，征服者基因会占多数，但绝不会多到超过80%，因为总会
有各种被征服者基因的低频混入。 汉人O3，西欧和美洲的R1b，东欧的R1a, 都属于这
种情况。 |
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s*****0
发帖数: 357 | 8 This is a really good opportunity to get exposure to the knowledge of the
association study. If you are interested in an industry job, this project
will definitely help.
You'd better formulate your question more clearly. What is your plan? Why
going directly to haplotypes without conducting single site tests? How large
and how dense of the coverage you want your haplotype to be? How would you
plan to use the statistical inference to guide your functional study?
Different software (PHASE, PLINK, ... 阅读全帖 |
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x********e
发帖数: 35261 | 9 考验各位将军英文水平的时候来了。想好了再说话，免得露马脚。
Of the 13 genomes from the United States, three were from the same patient
in Washington encoding the same haplotype H38, while the other three samples
encoded eight haplotypes, covering all five groups (Figure 3A), so the
sources of imported infections are complicated. Three haplotypes (H1 (
California), H19 (Wisconsin), and H38 (Washington)) were linked to Wuhan,
and three (H19 (Wisconsin), H35 (Arizona), H42 (California)) to five (H41 (
California) and H58 (Illin... 阅读全帖 |
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d******8
发帖数: 1972 | 10 Recent advances in whole-genome sequencing have brought the vision of
personal genomics and genomic medicine
closer to reality. However, current methods lack clinical accuracy and the
ability to describe the context (haplotypes) in
which genome variants co-occur in a cost-effective manner. Here we describe
a low-cost DNA sequencing and
haplotyping process, long fragment read (LFR) technology, which is similar
to sequencing long single DNA molecules
without cloning or separation of metaphase chro... 阅读全帖 |
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t**i
发帖数: 688 | 11 我在使用别人写的 一个程序，只有binary executable，是用Fortran写的。
Windows XP 32-bit 和Windows Server 2008 64-bit都是过了，每次都有如下的错误：
forrtl: severe (170): Program Exception - stack overflow
Image PC Routine Line Source
haplotyping.exe 00402205 Unknown Unknown Unknown
haplotyping.exe 0040D8BB Unknown Unknown Unknown
haplotyping.exe 0044A549 Unknown Unknown Unknown
haplotyping.exe 0043B964 Unknown Unknown Unkn |
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h*i
发帖数: 3446 | 12 犹太人还是随父系的，更别的种族没神马不同。
犹太人拼命要证明犹太人rabi姓的父系基因纯正的事实参见wiki, http://en.wikipedia.org/wiki/Genetic_studies_of_Jewish_origins
Priestly Families
Cohanim
Nephrologist Dr. Karl Skorecki decided to analyze the Cohanim to see if they
were the descendants of one man, in which case they should have a set of
common genetic markers.
To test this hypothesis, he contacted Dr. Michael Hammer of the University
of Arizona, a researcher in molecular genetics and a pioneer in research on
chromosome.[46] Their article,... 阅读全帖 |
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m****c
发帖数: 244 | 13
我也不是一生，以下关店进攻参考。
首先你的理解是错的。孩子和妈妈是可以配上的，就像孩子可以和一个不相关的人配上
一样。只是又巧了一下。
你是怕BGI把母亲的血样当孩子的了。
可以再做一个 SNP array for the trio, 应该比HLA typing便宜好多。
在MHC区的3000个SNP，95％都可以知道phase。是不是HLA typing 时血样错了很容易看
出来。
这个意大利钻驾的意思是：妈妈和爸爸共享的haplotype完全一样的可能性很低（除非
是近亲）。
你测的亚型只是到四位，还有更细的分型，6位，8位，等等。
而如果是兄弟姐妹的话，只要配了，就是几乎完全一样。
单就HLA来说，我会选妈妈。因为至少有一个haplotype是完全配。
另一个haplotype的不配程度应该和donor的不配程度一样。
：是不是用妈妈的骨髓存在一些特别的排异呢?
不懂你的伊斯。 |
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u*********1
发帖数: 2518 | 14 不知道怎么取题目。。。
就是现在发现同一个基因里的两个SNP，相隔3个bp，都是nonsynonymous SNP，两者的
MAF（minor allele frequency）都在5%左右，一个不高不低的数值（比如UCSC定义MAF
<=1%的才算rare SNP）。
我就是想问，这相隔3个bp的俩SNP，到底是独立遗传的，还是更可能是同时遗传的（也
就是同一个haplotype）？如果haplotype里这两个mutation总是在一起同时遗传的，那
他们俩作为整体的MAF就是5%；如果是相对独立的，那么MAF最小可以是0.25%，这样就
是一个很好的rare mutation的candidate。是不是要去找haplotype的database？
希望我表达清楚了。多谢。 |
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G***y
发帖数: 1082 | 15 A couple of questions you need to ask yourself:
1. Are the two SNPs authentic? Try first look at the raw alignments to make
sure the SNPs are not caused by mis-alignment or things like that. MANY SNPs
that are close by are actually sequencing/alignment artifacts.
2. What is the inherence pattern? You mentioned both SNPs are relatively
common (~5% MAF). If they are on the same haplotype, they are very likely to
be in complete LD (r2=1). So the expectation is in any given individual you
either see... 阅读全帖 |
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t******e
发帖数: 2504 | 16 还有，美洲的haplotype Q占绝对优势，Q在东亚少量存在，但和美洲不是一型，居计算
共祖时间在1.5万年以上。
所以从Y染色体的haplotypes判断， 排除了历史时期，不，不止历史时期，是完全排除
了传说时期东亚和美洲的联系。 |
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E*******F
发帖数: 2165 | 17 DNA evidence[edit]
Zerjal et al. (2003)[6] identified a Y-chromosomal lineage present in about
8% of the men in a large region of Asia (about 0.5% of the world total). The
paper suggests that the pattern of variation within the lineage is
consistent with a hypothesis that it originated in Mongolia about 1,000
years ago, and thus several generations prior to the birth of Genghis. Such
a spread would be too rapid to have occurred by genetic drift, and must
therefore be the result of selection. The... 阅读全帖 |
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h*********n
发帖数: 11319 | 18 F250这个政庇根本看不懂英文，tmd每次被打脸就换个地方扯淡
论文原文是这么说的
... both H13 and H38 would be suggested as ancestral haplotypes....
... Two main evolutionary paths of available haplotypes can be from H13
through H3 to H1, or
from H38 through H3 to H1 (Figure 3C)....
这tmd说的很明确了，美国的H38演化出H3，H3演化出武汉大爆发的H1 |
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h*********n
发帖数: 11319 | 19 F250这个政庇根本看不懂英文，tmd每次被打脸就换个地方扯淡
论文原文是这么说的
... both H13 and H38 would be suggested as ancestral haplotypes....
... Two main evolutionary paths of available haplotypes can be from H13
through H3 to H1, or
from H38 through H3 to H1 (Figure 3C)....
这tmd说的很明确了，美国的H38演化出H3，H3演化出武汉大爆发的H1 |
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h*********n
发帖数: 11319 | 20 F250这个政庇根本看不懂英文，tmd每次被打脸就换个地方扯淡
论文原文是这么说的
... both H13 and H38 would be suggested as ancestral haplotypes....
... Two main evolutionary paths of available haplotypes can be from H13
through H3 to H1, or
from H38 through H3 to H1 (Figure 3C)....
这tmd说的很明确了，美国的H38演化出H3，H3演化出武汉大爆发的H1 |
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b****r
发帖数: 17995 | 21 免费的haplopview就可以估计haplotype，用的人也非常多。据我所知好像也谈不上什
么“更准确的haplotype”，大家没有几个人真正去大规模验证吧，都是refer出来的，
方法上各有优势，都有不少人用。
或者打算投啥杂志，看看主编的文章一般用啥软件 |
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m****c
发帖数: 244 | 22 哈，最近正好在研究HLA。所以吃饱了承德蕉叶不睡了麻子。下面的讨论是纯技术性的。
这对夫妻共享同一个 haplotype：A*11:01-B*15:02-C*08:01-DRB1*12:02－DQB1*0301.
这是一个比较长的IBS/IBD,尤其是考虑到这个区间的recombination hotspots.
其中B*15:02, DRB1*12:02 在汉人中频率不高，5％左右。但在云贵少数民族地区很高
25％左右。但我们不能从边际频率来估计 haplotype 频率，因为MHC是一个奇怪的区域
range LD.
有趣的是：B*15:02, C*08:01, DRB1*1202 的频率在欧洲人(WTCCC)中很低，分别为 3
／万，5／万，10／万。
如果这对夫妻是欧洲人，我用我的车来赌他们是近亲结婚。
如果这队夫妻是汉人，我用我的自行车来赌。
如果这队夫妻是云贵少数民族的，我用Tanna的车来赌。 |
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o***n
发帖数: 96 | 23 yes, a son can be fully matched with mom or dad on HLA, if mom or dad share
a haplotype. This usually happens when mom& dad are related, or both carry a
same common haplotype. I am working in
a HLA lab. |
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b***8
发帖数: 31 | 24 http://webcache.googleusercontent.com/search?q=cache:sL_-hXGNSu
对于践踏知识产权问题的反思（上海交大Bio-X研究院）
万万没有料到，在人人尊重知识产权的今天，知识产权仍遭到肆无忌惮的践踏
。今天，几位同事在忍无可忍的情况下，向我们反映发生在上海交大生命学院网站上的
不真实见闻（见本文最后部分所附的从生科院网站http://life.sjtu.edu.cn/上下载的例子）。
人们早已意识到，维护必要的知识产权是促进生产力发展和积极性提高的必要
条件。在这个世界上，物品的归属一般从来不会出错的？就像黑和白是不会搞颠倒一样
。但为什么当遇到了某些人时就会搞错，而且错的方向又是如此的一致，总是把别人的
东西“搞错”到自己口袋？但这毕竟显得理不直气不壮!谁都会知道把别人口袋的钱“
悄悄”放入自己口袋去花意味着什么？即使把兄弟姐妹或父母口袋内的钱放入自己口袋
之前，也起码打个招呼。咱们的孩子好像都懂得这一基本道理？然而，有些人如果一定
要采取“悄悄拿”模式，恐怕有什么要担心事，难道是担心得不到“同意”... 阅读全帖 |
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A*******e
发帖数: 284 | 25 我在看自己做的一个功能基因的进化问题。 现在有一个超过800个samples的snp data
，包括上游和下游基因的。 上游邻接着它的是一个house keeping基因，这800个
sample里面超过95的house keeping基因都是同一个haplotype。而我自己的基因则是主
要有6个不同的haplotype，这6个加起来超过了95%。 我想请帮看看history上这两个基
因发生了什么，怎么演变的。 |
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a***r
发帖数: 420 | 26 "Then, we update the haplotypes for each individual in turn by using the
current set of haplotype estimates for all individuals as templates and
sampling S proportional to the likelyhood L(S|G)∝P(G,S).A new set of
haploytpes for an individual is then defined according to sampled mosaic."
其中， S是HMM中的hidden states， G是observations
P(G,S)作为S和G的joint probability，可以由markov chain基本公式得出，认为已知
关键是“sampling S proportional t the likelyhood L(S|G)∝P(G,S)”，不明白是
咋个sampling的过程，大致觉得是说对每一个individual来说（每个G），相对 ”th |
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a***r
发帖数: 420 | 27 if we consider each marker as a time point
the origin clusters of haplotypes as sample space
the haplotype,which is a sequence of origin clusters at each marker
could be described as a Markov chain with the transition probability a
function of recombination rate |
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a****t
发帖数: 7049 | 29 我上面贴连接了。
Abstract
The prehistoric peopling of East Asia by modern humans remains controversial
with respect to early population migrations. Here, we present a systematic
sampling and genetic screening of an East Asian–specific Y-chromosome
haplogroup (O3-M122) in 2,332 individuals from diverse East Asian
populations. Our results indicate that the O3-M122 lineage is dominant in
East Asian populations, with an average frequency of 44.3%. The
microsatellite data show that the O3-M122 haplotypes in |
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S*******C
发帖数: 7325 | 30 ☆─────────────────────────────────────☆
aptget (apt) 于 (Tue Jul 27 23:27:24 2010, 美东) 提到:
二楼
☆─────────────────────────────────────☆
aptget (apt) 于 (Tue Jul 27 23:39:10 2010, 美东) 提到:
黄的是通用语，绿的也是汉语，其他颜色的不是
修改了一下的新版本：
http://tinyurl.com/23d42vv
附件里是老版本：
☆─────────────────────────────────────☆
daigaku (๑۩۞۩๑) 于 (Wed Jul 28 00:01:09 2010, 美东) 提到:
你那个“北语”是从哪冒出来的啊
☆─────────────────────────────────────☆
aptget (apt) 于 (Wed Jul 28 00:08:33 2010, 美东) 提到... 阅读全帖 |
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c**i
发帖数: 6973 | 31 Nicholas Wade, Finding on Finding on Dialects Casts New Light on the Origins
of the Japanese People. New York Times, May 4, 2011
http://www.nytimes.com/2011/05/04/world
/asia/04language.html?scp=1&sq=japan%20dialects&st=cse
(Japanese "language is descended from that of the rice-growing farmers who
arrived in Japan from the Korean Peninsula, and not from the hunter-
gatherers who first inhabited the islands some 30,000 years ago")
My comment:
(a)
(i) Jōmon period
http://en.wikipedia.org/wiki/J%C5... 阅读全帖 |
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l***o
发帖数: 2017 | 32 One proposal of the Egyptian Theory is that the ruling class of early
ancient Egypt had Y-DNA haplotype Q, so were ruling classes of Shang and
Zhou.If the above hypothesis were true, your objection is moot.
So far, there is no evidence to the contrary. This hypothesis is in fact
easy to test, if the governments of Egypt and China are willing to cooperate
... |
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t******e
发帖数: 2504 | 33 或者是Olmec在中国， 如果从美洲人的角度看， 中国古代文明就是从他们传来的。
实际上可能是共同享有一个更古老的史前文明，可能是在last glacial period， 当然
那时也没有中国人，日本人，北亚及美洲人之分。
当然，从Y染色体的haplotypes看， 东亚主流类型O（O1/O2/O3)在美洲根本就没有，而
这些类型都有上万年以上的历史，可见美洲人和东亚人分离之久远。 |
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h********J
发帖数: 563 | 34 https://listverse.com/2017/02/27/10-incredible-mysteries-of-the-huns/
While investigating the impact of Huns on European DNA, researchers
discovered that haplotype Q was the likely genetic core of these Asian
invaders. The Huns were predominately carriers of Q1b and Q1a2 Y-chromosomes
. Native Americans are predominately Q1a3a. This suggests that Huns and
Native Americans share an ancestor from about 18,000 years ago, most likely
from the Altai Mountains. |
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S*********4
发帖数: 5125 | 35 （转贴）人类基因图谱证明华夏基因进化最完备 供参考
http://tieba.baidu.com/f?kz=858990143
研究结果表明，崇洋媚外的情节是违背基因变异和进化方向的。
============================================================
基因图谱证明汉人基因是世界上进化最艰难与最复杂的基因体系, 而日本人则是除非洲外离汉人基因图最远的一个种族。
(环境是造成基因突变主要原因,也是使人种进化更聪明人的主要原因)
M168 (出非洲,约5-6万年前)
> M130(小矮棕人,海上移民标记,沿海路,澳大利亚洲,日本人8.5%,外蒙55%,满族6%,约5
万年前,)
> YAP (小黑矮人,日本人34.7%)
> M89(中**变)
> M9(伊朗高原突变-->欧亚部落,约4万年前)
> M45 (向北--中亚突变->欧洲人起源,约3.5万年前)
> M207(向西殖民突变)
> M173(欧洲中部雅利安人突变)
> M343(西欧现代英国人)
> M21... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 36 人类基因图谱证明华夏基因进化最完备 没之一
文章提交者：nwtnt 加贴在 中国历史 铁血论坛 http://bbs.tiexue.net/bbs73-0-1.html
研究结果表明，崇洋媚外的情节是违背基因变异和进化方向的。
============================================================
基因图谱证明汉人基因是世界上进化最艰难与最复杂的基因体系, 而日本人则是除非洲
外离汉人基因图最远的一个种族。
(环境是造成基因突变主要原因,也是使人种进化更聪明人的主要原因)
M168 (出非洲,约5-6万年前)
M130(小矮棕人,海上移民标记,沿海路,澳大利亚洲,日本人8.5%,外蒙55%,满族6%,约5万
年前,)
YAP (小黑矮人,日本人34.7%)
M89(中**变)
M9(伊朗高原突变-->欧亚部落,约4万年前)
M45 (向北--中亚突变->欧洲人起源,约3.5万年前)
M207(向西殖民突变)
M173(欧洲中部雅利安人突变)
M343(西欧现代英国人)
M214 (向南--南亚/东南亚突变)
M20 --陆路-南... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 37 【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: wayofflying (小破熊), 信区: WaterWorld
标 题: 研究表明，崇洋媚外违背基因变异和进化方向
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 5 12:40:56 2012, 美东)
研究结果表明，崇洋媚外的情节是违背基因变异和进化方向的。尤其是跟非洲人\中东
人和南美洲人结婚的,无论男女,每结婚一次,基因都会明显退化.
============================================================
基因图谱证明汉人基因是世界上进化最艰难与最复杂的基因体系, 而日本人则是除非洲
外离汉人基因图最远的一个种族。
(环境是造成基因突变主要原因,也是使人种进化更聪明人的主要原因)
M168 (出非洲,约5-6万年前)
M130(小矮棕人,海上移民标记,沿海路,澳大利亚洲,日本人8.5%,外蒙55%,满族6%,约5万
年前,)
YAP (小黑矮人,日本人34.7%)
M89(中**变)
M9(伊朗高原突变-->欧亚部落,约4万年前)
M45 (向北--中亚突变... 阅读全帖 |
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l*y
发帖数: 21010 | 38 By ethnicity
In an ethnic sense, an Ashkenazi Jew is one whose ancestry can be traced to
the Jews of Central and Eastern Europe. For roughly a thousand years, the As
hkenazim were a reproductively isolated population in Europe, despite living
in many countries, with little inflow or outflow from migration, conversion
, or intermarriage with other groups, including other Jews. Human geneticist
s have identified genetic variations that have high frequencies among Ashken
azi Jews, but not in the ge... 阅读全帖 |
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D*********n
发帖数: 279 | 39 http://en.wikipedia.org/wiki/Native_Americans_in_the_United_Sta
Native Americans in the United States
From Wikipedia, the free encyclopedia
Jump to: navigation, search
"American Indian" redirects here. For other indigenous peoples, see
Indigenous peoples of the Americas and other geographic regions. For
Americans from South Asia, see Indian American.
This article may be too long to read and navigate comfortably. Please
consider splitting content into sub-articles and/or condensing it. (January
2... 阅读全帖 |
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S*******l
发帖数: 4637 | 41 Zionist当然这么说。想论证巴勒斯坦人是外来户，所以拿走他们土地没问题。
但是遗传学研究表明巴人就是当地土著，阿拉伯化的土著。
Genetic analysis suggests that a majority of the Muslims of Palestine,
inclusive of Arab citizens of Israel, are descendants of Christians, Jews
and other earlier inhabitants of the southern Levant whose core may reach
back to prehistoric times. A study of high-resolution haplotypes
demonstrated that a substantial portion of Y chromosomes of Israeli Jews (70
%) and of Palestinian Muslim Arabs (82%) belonged to the same chromosome
... 阅读全帖 |
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T****t
发帖数: 11162 | 42 哈哈！当年的“坑人”徐西平摇身一变成“千人”徐希平
【实按：这年头，要想组织不被蒙骗，就得依靠“孤狗”。
刚才在网上搜“徐西平”，结果搜出了干过同事的“徐希平”，所以，现把这“两名一
人”的“百科名片”给复制过来。
顺便也求网友给中组部的李部长打个“小报告”，千万别把敌“潜伏”给“牵会”当“
卧底”呕。
还求打假逗士方舟子继续关注“徐希平”，他的简历好像很特别哟！】
附：
徐希平
百科名片
徐希平教授，男，汉族，1956年8月生于安徽省明光市，博士生导师，中科院“百人计
划”入选者，“千人计划”国家特聘专家。另有西南民族大学文学院教授。
中文名： 徐希平
国籍： 中国
民族： 汉
出生地： 安徽省明光市
出生日期： 1956年8月
职业： 教授
1.“千人计划”国家特聘专家
人物简介
主要学习经历
1982年获安徽医科大学医学学士学位，同年考入北京医科大学出国代培研究生；
1985～1986年在美国Johns Hopkins大学公共卫生与保健学院学习；
1987～1988年在美国Tulane大学医学院学习；
1988年获日本筑波大学医学博士学位... 阅读全帖 |
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x********e
发帖数: 35261 | 43 日，华农和西双版纳植物所联合发的haplotype分析文。你果然没看懂。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 44 另外再回答另一个人的问题。华农文章里的H1H3是haplotype的H，流感HxNx里的H是
hemagglutinin的H。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 45 西双版纳植物所和华农联合发布的preprint文章定义了两种古老型haplotype H1（C
group root，CA06携带毒株）和H3（B group root， WH04携带毒株）。我把这两个毒
株跟RaTG13还有pangolin-CoV比对了一下，提出以下新冠来源和早期演化的理论：
1. SARS-CoV-2的自然宿主是一种蝙蝠体内类似于RaTG13的bat-CoV。这个病毒（RaTG13
-like-CoV）和RaTG13是亲戚，但两者基因组序列有很多自然突变造成的差异。
2. 蝙蝠接触穿山甲导致RaTG13-like-CoV感染穿山甲。RaTG13-like-CoV可能在穿山甲
体内长期存在积累突变，然后与穿山甲体内的pangolin-CoV发生重组，导致S蛋白可以
识别穿山甲ACE2受体。重组后的病毒（RaTG13like-pangolin-CoV）按理说已经具备传
播人的能力，这个病毒在穿山甲体内可以继续突变影响病毒的毒性。
3. 走私穿山甲的人与带病穿山甲接触，发生病毒向人的传播，这个“零号病人”携带
的毒株，我称为H0.它跟H3相似度在99.99%以上。
4.... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 46 完全就是扯淡，故意转移视线！如果是走私穿山甲的人，疫情不会只是武汉单点爆发！
穿山甲是被栽赃的！
：西双版纳植物所和华农联合发布的preprint文章定义了两种古老型haplotype H1（C
：group root，CA06携带毒株）和H3（B group root， WH04携带毒株）。我把这两个毒 |
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t**x
发帖数: 20965 | 47 请你仔细看看，
良性的三个报告。其中一个是这个德国医生自己的，他承认自己从来没有看过。第一个
genedx，是我们出院(04/13)后一个月报的(05/13)， 这个极有可能就是我们宝宝的结
果，被报呈良性。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/variation/92429/
这个变异发现10多年，欧洲基因库收录为恶性。只有美国报称良性，在我们宝宝刚刚出
院。你真得仔细看看时间和事情了。
你没有看到跨国界作假反而。。。你看看荷兰医生的回信。我真怀疑你到底是干什么的
？
这个变异发现了10多年了， 这个德国医生的链接的文献没有说是良性的， 你自己看看
下面德国医生附上的文献。我不是医生，我看不出来说这个变异是良性的。你如果愿意
看看我家宝宝cpt2的两个结果， 一个1.5%酶活性，一个15%酶活性，跟下面的温度相关
吻合得多好。
我家宝宝的下降更多，大概是因为他的变异更多。这个特征的变异很多年了，但是
cchmc和Baylor都没有查出来。你说说他们不知道？！
Here the excerpt von OMIM regarding this mut... 阅读全帖 |
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t**x
发帖数: 20965 | 48 yangyi和aning我没有跟她/他斗， 我劝你们好好看看德国医生给的参考资料, 这个资
料你怎么得出是benign的结论的：
0018 ENCEPHALOPATHY, ACUTE, INFECTION-INDUCED, SUSCEPTIBILITY TO, 4
CPT2, PHE352CYS AND VAL368ILE [dbSNP:rs2229291] [dbSNP:rs1799821] [ClinVar]
Chen et al. (2005) found an association between 2 thermolabile polymorphisms
in the CPT1 gene and susceptibility to infection-induced acute
encephalopathy-4 (IIAE4; 614212) in Japanese children. The variants were a
1055T-G transversion, resulting in a phe352-to-cys (F352C) substitution (
rs... 阅读全帖 |
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t**x
发帖数: 20965 | 49 我可以跟你说这个写这个文章的医生是一个十恶不赦的王八蛋！因为这个德国医生就是
跟西雅图儿童医院勾结的个婊子养的畜生。
这是我的信：
Von: Andrew Xie [mailto:[email protected]/* */]
Gesendet: Montag, 19. September 2016 13:24
An: Wieser, Dr. Thomas, Chefarzt
Betreff: RE: Question on a benign mutation / NM_000098.2(CPT2):c.1102G>A (p.
Val368Ile) Simple - Variation Report - ClinVar – NCBI
Dear Dr. Wieser,
Thanks for your reply.
In the link it says 3 sources reporting ‘benign’ :
1. GeneDX on May 29, 2013
2. Emory Genetics Laboratory on Apr 16, 2014... 阅读全帖 |
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h***u
发帖数: 4 | 50 PH.D. ASSISTANTSHIP IN PLANT BREEDING AND GENETICS
available at Cornell University, Ithaca, USA. A research and education
team is being assembled for association mapping of beta-glucan in oat
germplasm for food and nutritional function. One association study will be
performed in elite, agronomically performing oat, and one study in a global
oat collection from the USDA National Plant Germplasm System. Cutting-edge
marker technologies and statistical analyses for linkage disequilibrium,
haplotyp |
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