d********1
发帖数: 2462 | 1 Short WTW..
以前买过，不好，债务过重，对手有Nutrisystem, Jenny Craig，Jenny是winner。
还特地去听了interview，落后无比，尽然想着让人家users offsite meetups，还收
monthly fee for advice，不知道现在smartphone上可以free download software么，
还有Fitbit, Garmin的bands，好了，竞争对手又多了许多；） |
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x******h
发帖数: 13678 | 2 确实高，可不可以搞个股版heatmap来判断走势啊 |
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发帖数: 1 | 4 140 通过也有些时间了，一直在忙485， 今天也有时间来说说自己的经历，以飨来者。
先说一下timeline， 估计大家对这个最感兴趣，然后会具体说一下自己的准备过程，
策略，和踩的坑。
1. TIMELINE
140 Sent : 12/15/2017
140 RD: 12/20/2017
140 RFE: 12/29/2017
140 Approve: 01/02/2018
485 Sent: 01/09/2018
485 RD: TSC 01/10/2018
485 Transfer: NSC 01/17/2018
…….
大家一定会对RFE 和 approve 的时间很奇怪， 且听我慢慢道来。
2. 个人情况
本人具体情况：国内中科院火坑专业土博 ＋ 美国中西部博士后第三年。
硬件参数为：文章五篇，其中一篇为共同一作 （引用 120 +， 10分杂志），其他四篇
为挂名，Google Scholar citation 320+, Review 文章 17 篇 （一个五分杂志，一个
两分杂志，一个会议）。
3. 申请过程
2017年7月份和 Wegreen/Chen Group... 阅读全帖 |
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v***r
发帖数: 1046 | 5 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: valar (和光同尘), 信区: Biology
标 题: 请教一个彩图转黑白梯度的问题
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 15 17:19:01 2011, 美东)
heatmap彩图是用HSV colormap代表不同的数据大小,已经存成tiff文件了。现在想把图转成黑
白梯度，但是HSV colormap转化gradient时，极大值和极小值都变成深黑的。哪位制图
达人指点迷津，不胜感激! |
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r****t
发帖数: 10904 | 6 【 以下文字转载自 Soccer 讨论区 】
发信人: windking (Mr Doctor), 信区: Soccer
标 题: 西德大战简要技术分析：哈维跑出一片天
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jul 7 17:36:23 2010, 美东)
赛前所有人都看出来，西班牙与德国的胜负手就在如何定义哈维与施魏因斯泰格在队伍
的位置。在已过的比赛中，施魏因斯泰格利用厄齐尔在中圈与对方弧顶区域的扯动，有
效地承担了分球组织的任务。而哈维在队伍中的位置则容易和布斯克茨、阿隆索混淆，
造成跑动距离下降，前压不足，无法为前锋线创造出开阔的空间。
针对于此，本场西班牙在战术上的最大变化是，利用布斯克茨与阿隆索在中圈一线对厄
齐尔的挤压，成功将哈维的位置前提。纵观全场，厄齐尔的29次传球中，有16次均是向
后传递。这就使得施魏因斯泰格不得不增加自己向前覆盖的时间。与此同时，伊涅斯塔、
佩德罗频繁交叉换位，加上拉莫斯的冲击，直接将对方左路的博阿滕挤压到自身禁区肋部
位置，从而逼迫防守中场赫迪拉退后，为哈维大范围跑动创造出空间。如果观察Heatmap，
就会发现，哈维向前的覆盖正好处于赫 |
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K*********n
发帖数: 2852 | 8 以前hotpad.com可以看收入的heatmap，现在这个功能没有了 |
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m*******r
发帖数: 339 | 10 有powermeter必须上，没有的话差别不大，能看看heatmap，hr zone啥的
give
you' |
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c****n
发帖数: 21367 | 11 是的，佩德罗如果站住前锋位置，那他自私一点无妨
问题在于他拿球的位置极度靠后，这种不出球对球队战术伤害太大了
如果认为佩德罗全场进攻作用很大的，请去fifa.com看看matchcast里面Pedro的
heatmap
看看他全场主要在哪个区域活动，再看看拉莫斯的。我认为他失位很厉害。 |
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c****n
发帖数: 21367 | 12 30分钟换下是说得夸张一点，但是有我的道理
如果你坚持认为佩德罗表现正常，请去fifa.com看matchcast里面
他的heatmap，再看看拉莫斯的。如果这个叫做“表现正常的前锋”，
我和你对一个球队各个位置的责任可能理解不同。
在我看来佩德罗全场大部分时间完全失位，扰乱了全队的战术衔接，
还在全队靠传接控制住中场的时候经常一个人闷头乱带，个人表现
再抢眼，再能一次过几个人，影响全队的发挥也应该换下。 |
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w******g
发帖数: 10018 | 13 赛前所有人都看出来，西班牙与德国的胜负手就在如何定义哈维与施魏因斯泰格在队伍
的位置。在已过的比赛中，施魏因斯泰格利用厄齐尔在中圈与对方弧顶区域的扯动，有
效地承担了分球组织的任务。而哈维在队伍中的位置则容易和布斯克茨、阿隆索混淆，
造成跑动距离下降，前压不足，无法为前锋线创造出开阔的空间。
针对于此，本场西班牙在战术上的最大变化是，利用布斯克茨与阿隆索在中圈一线对厄
齐尔的挤压，成功将哈维的位置前提。纵观全场，厄齐尔的29次传球中，有16次均是向
后传递。这就使得施魏因斯泰格不得不增加自己向前覆盖的时间。与此同时，伊涅斯塔、
佩德罗频繁交叉换位，加上拉莫斯的冲击，直接将对方左路的博阿滕挤压到自身禁区肋部
位置，从而逼迫防守中场赫迪拉退后，为哈维大范围跑动创造出空间。如果观察Heatmap，
就会发现，哈维向前的覆盖正好处于赫迪拉向左退防留下来的一片空间，并伺机利用拉姆
助攻的空当。这一战术收到的效果堪称是一石三鸟：不仅钳制了厄齐尔的扯动，并利用哈
维的跑动与分球限制了德国后卫的插上，最重要的是让施魏因斯泰格处于较为孤立无援的
位置。
这一战术在上半场的体现最为充分，德国队在上半场的控 |
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T****s
发帖数: 915 | 14 博斯克的确是有料啊。
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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f*******9
发帖数: 723 | 15 其实关键在于中前场的反抢和两个后腰的屏障作用，延缓了德国的反击速度和阻挡了向
前传递的方向，迫使对手向后传球，增加了反击时的传球次数，迫使对方把传接球技术
的相对劣势曝露出来了。
从德国的角度讲，这场球打得错误的地方在于，没有打出反击的速度，反击传球线路不
够简洁直接，妄图在中场与对方纠缠。应该多打两侧翼的过顶身后球，将球快速的从两
侧推向对手的纵深区域，迫使对方边后卫不敢轻易压上进行套边进攻，同时给本方边后
卫提供接前场回传后起45度传中的机会。
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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L*********i
发帖数: 649 | 17 zan !
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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m*******e
发帖数: 6358 | 18 要说32只球队教练最好干的就是博斯克了
首先把8傻首发拿来，去掉外国人，对应的位置从皇马补上，还不补齐的话就从其他队
找两个凑上，于是就有了麻子脸和那个什么卡普德维拉
进攻呢就是让8傻的几个人控呀控，防守呢还是让8傻的几个人控呀控
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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s****y
发帖数: 401 | 19 分析很到位，赞
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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u******g
发帖数: 154 | 20 换不换OEZIL不会有太大改观.没有人能敢保证上新人就一定能扭转局面,绝对有人会说
上新人会出问题.
本场重点还是在于立即采取战略收缩,加强防线打突击,而不是霸王硬上弓.
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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t*******e
发帖数: 2921 | 21 赞分析
这场球 完全进入了板鸭的节奏 德国被牵着鼻子 疲于奔命 而且板鸭中场的反抢压迫非
常有效 德国过
中场都很难 快攻基本打不起来 上半场还好 下半场体力被搞光之后场面就更加难看了
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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o**d
发帖数: 3080 | 22 赞技术贴，教练之争，老帅完胜。
在 windking (Mr Doctor) 的大作中提到: 】
塔、
肋部
Heatmap，
拉姆 |
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c****n
发帖数: 21367 | 23 佩德罗独还不是大问题，虽然他老人家搞了13个solorun，在场上平均5分钟
就带球冲一次
他最大的问题是失位，可以看fifa.com的matchcast的heatmap，看看他全场
都在什么地方活动。 |
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j***n
发帖数: 51 | 24 挺。
如Z大师所说， 麦鹰是热爱足球并且能够去实践的人，大家来到soccer版，虽然对于足
球的理解不尽相同，既然Z大都能表示理解， 各位应该也不成问题。
说到装b之嫌， 好比要是做了件得意的事情，有人愿意偷着乐，讲究闷声发大财，有人
愿意在那儿得涩，唯恐人不知， 都是人之常情。在麦鹰看来， 能和比自己高的人一起
踢球， 就是一件可以得意的事情， 吹吹也无可厚非。 因为这也是提高和学习的机会
， 并非说和前职业踢就是自己也成职业的意思， 就象和巴非特吃顿饭成不了巴非特一
个道理。
麦鹰是愿意琢磨足球的人，愿意自己画图板，找视频，找书是难能可贵的， 没有痴迷
到一种程度， 干不了这事。不是说水平低就不能再提高， 相反,水平越低， 提高的空
间越大，况且麦鹰好歹还能带队从D2到D1.
诚然，身体素质和基本技术动作的提高对于成年人希望不大， 不过对于足球的理解是
可以随年龄时间的增长不断提高，不管他100米跑多少。对于广大球友，踢球可能只是
锻炼身体， 和球友交流，麦鹰目标是提高,不仅自己提高，而且是带领队伍提高。足球
的基本元素对于球员来讲在于技术,身体和意识，对于球队来讲还有战术,不是说... 阅读全帖 |
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l*******y
发帖数: 4006 | 25 谢谢了， 其实这就是一种 heatmap， 我是想用简单的命令画出来。 |
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c******n
发帖数: 16666 | 26 高级玩家的话开个空气污染的heatmap不就出来了 |
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W***o
发帖数: 6519 | 27 比如我有下面这些多维数据，怎么把每个数据点画成一个3D surface？
Label Sample1 Sample2 Sample3 Sample4 Sample5
U.S.A. 10.1 3.2 5.6 6.9 7.3
Canada 9.8 4.5 5.7 6.8 7.9
Mexico 10.9 4.9 9.6 5.9 4.3
China 9.2 4.4 5.8 6.9 7.1
我想的是把第一列用做x坐标，第一行用做y坐标，然后数值用Z坐标画3D surface，颜
色根据数值大小显示成类似heatmap的颜色，请问有哪种软件可以做这个？
谢谢 |
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B*****g
发帖数: 34098 | 28 周二参加我教第12部数据库在弗吉尼亚的发布会，粗谈感想
multitenant container database hold many pluggable databases
1.share resource and os (available when request)
2.easy maintenance, upgrade, patch (only do it at container database)
3.easy clone
4.OEM 12c will be labile for both level (container database and pluggable
databases)
5.Private cloud
6.Can be used as stand-alone db also
security
1.Data Redaction (realtime, comparing to Data Mask)
2.Audit Vault and Database Firewall
High Availability
1.enhance for Data guard,... 阅读全帖 |
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s********e
发帖数: 893 | 29 看到奔就赶紧进来了。结果看到一对术语Data Redaction， heatmap什么的不知所云。
我们最近才升到11g r2。估计几年后才会升到12吧。不管什么版本，我们developer用
的也不过就是些简单sql，好像用不着这些新功能。不过最近俺写了个query用了
LISTAGG，把我们办公室的16年经验的大牛给震惊了一下，说从来不知道这个东东。后
来一查，这个function从11GR2才有的。
俺以前也参加过一次Oracle BI的发布会，早饭中饭都管，还有帽子随便拿。反正是上
班时间去，今后有还去。呵呵。 |
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k*z
发帖数: 4704 | 30 商场啊，剧院啊，酒店啊，商店啊等等自定义的地图。
不是地理地图。
怎么在SAS/Cognos/SSRS/R/里面搞？ |
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s*****n
发帖数: 5488 | 31 你用php给我算一个地图上的 location clustering来。不知道是什么去redfin看看大
绿圈。
或者用php给我做个heatmap.或者run一个real time traffic predication and route
selection来。
这都是web service,你说说那个web server支持。那个php怎么做。 |
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N******n
发帖数: 3003 | 33 谢谢，不过cutree没有考虑到heat, 可能我觉得例子不全。
比如matrix每个格子代表pair similarity. 做hierarchical clustering rearrange
the index, and use heatmap to visualize the similarity intensity. 显然heat
degree 高的代表想要的，低的不想要，如果cutree,看不到高的和低的的区别 因为相
似度低的也在一个cluster里面。 |
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ET
发帖数: 10701 | 34 给了地理位置的heatmap吧。
没人挖掘的这数据太可惜了。 |
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s******a
发帖数: 252 | 36 I usually recommend MeV to people.
Go to tm4.org, download MeV and read its tutorial. |
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r*******e
发帖数: 123 | 37 就是分析microarray和proteomics数据的那种有颜色的方块图?有没有免费的软件好用?
谢谢. |
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t*d
发帖数: 1290 | 40 行内标准：genecluster @ Broad
或 cluster @ Eisen lab |
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h*******o
发帖数: 4884 | 41 麻烦能不能再解释的清楚一点
我现在的case是就2个group, ctrl 和Treatment
用得actin+GAPDH做得internal control
所有其他的target 都normalize了
然后软件又给出了treatment group的fold change和P value
做cluster/heatmap的时候，有2个选择一个是Pearson Correlation一个是Euclidean
distance.
因为我就2个group，所以我想看看每个group的individual sample怎么cluster
发现不管用那个方法，图都还行，每组6个sample里面5个都cluster在一起，只有一个
会跳到另外一组的sample中间
但是pearson 和Euclidean的差别在于 不同的target gene被放在一起了
这个有区别吗？
谢谢 |
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g********i
发帖数: 207 | 42 that's heatmap. Matlab can do it. |
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v***r
发帖数: 1046 | 43 heatmap彩图是用HSV colormap代表不同的数据大小,已经存成tiff文件了。现在想把图转成黑
白梯度，但是HSV colormap转化gradient时，极大值和极小值都变成深黑的。哪位制图
达人指点迷津，不胜感激! |
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U********S
发帖数: 1896 | 44 那区别不是在PC2上。
你可以在partek里加个elipsoid，用默认的2SD，应该可以看到把两个细胞组混在一起
的时候有没有基因的两种情况分离的比单独的时候更开，也就是像你看到的有更多的
DEG。
我觉得主要问题不在于DEG数量多少而在于分析是否合理，把两个不同的cell合在一起
恐怕不是一个合理的分组方法，除非你的实验设计比较特别。
另外这个是细胞实验还是动物实验，如果是细胞实验的话恐怕实验过程或者芯片处理过
程有些问题，否则不应该有这么大的变异，尤其是红色小点那一组，蓝点那组也不是太
好。可以用所有基因/probe作个hierachical clustering heatmap看一下,红色的那两
组恐怕会混在一起。动物实验的话倒是可以看到这种情况。 |
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g*******g
发帖数: 45 | 45 Hi,
刚刚接触生物信息，现在有一个gene list，要确定做siRNA的可能性。目前需要从da数
据库里找到这些基因在各种组织（包括正常和疾病）里面的表达情况。
能否推荐一个好用的数据库？最好能输出一个heatmap之类的。
多谢！ |
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g*********3
发帖数: 177 | 46 好帖~
1）我前几天在想personal medicine，我们是不是策略可能有点问题~ 通常的做法是
find a commonly occured desregulated pathway based on many samples---Find
drug---Treat people carrying this abnormal pathay with drug.
其实由于heterogeneity，找出癌症共有的通路本身就是很难的【这个可以部分解释为
什么microarray做了这些工作，取得的效果不是很明显】~ 我的想法是直接进入
personal medicine，忽略第一步，直接进入第三步不见得难~ 当然这个成本目前还不
可能被接受~
2）LZ说的第二点很好~ 我个人的观点是怎样从这么多mutation中找出driver mutation
，这个面有不少牛组在做了，进展不是很大，另外有人提到了一点，很多不是
druggable的，这个比较棘手，很多TFs，我估计是driver mutation，恰好很多TFs不是
druggable的，这个是老板的经验，他说可能和TFs ... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 47 1.直接personal我觉得是不现实的。怎么个peronalize，你怎么找切入点？人的一辈子
，除了DNA是相对稳定的，其他的东西变化太厉害，对于科学研究来说可以说是个相当
捉摸不定的东西
2.大牛组进展不大很正常，现在遗传学技术的通量对于癌症的复杂程度根本差得太远太
远，说九牛一毛也不一定夸张了。至于是不是drugable，也不好一概而论，但是我觉得
原则上只要癌症和正常细胞还有本质的区别，它就一定有致命的靶点
3.microarray就别提了，太逊了。我反复强调的一点，就是有没有可能穷尽一个东西。
只要能穷尽地研究一个东西，这个东西就能被搞清楚，这是我的信念。microarray只能
针对一部分基因的很小一部分信息，说它挂一漏万，肯定没有夸张。 proteinomics理
论上当然好，但是刚才我说过，蛋白变化太大，而且即使一个细胞里不同蛋白都可以有
无数种位置区别，不同的化学修饰，再加上和另外几十几百个protein的互作，然后人
体有几亿亿个细胞，现有的人类技术不知道要多少年才能穷尽。我觉得这是一条低效率
的路。
4.癌症致死，归根结底是癌细胞越来越多。
1）我前几天在想p... 阅读全帖 |
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l*****i
发帖数: 1163 | 48 今天看到一片文章，做Microarray的，其中的Heatmap不是基因表达量，而是－Log10 P
Value （vs control）来表示某一类的基因的表达量。请问这种表示方式合理么？有
什么需要注意的？对这块不熟，请高手指教。多谢 |
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f******g
发帖数: 1003 | 49 我用Nanostring这个技术的到一些数据，在KO细胞里面发现有30个基因表达量有变化。
如图（我只拿5个基因来举例）。
我的问题是，有没有更好的图标来呈现这些数据。想基因芯片的数据那样的heatmap的
图。
谢谢 |
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a****c
发帖数: 339 | 50 单就你的问题 基因的表达和肿瘤生存率的关系
http://ist.medisapiens.com/
phenotype heatmap
需要注册，大部分功能免费
但是这个网站看不出来不代表不能做下去了，能够重要到影响病人生存率的基因都是宝
贝了。一般来说，能够看到你的基因在某些肿瘤里过表达，或者有mutation,然后
knockdown能够影响proliferation or migration，这就已经很好了。 |
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